MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 plasmid pSJH901

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009477	TTAAAC	2	12	3520	3531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244144
2	NC_009477	ATAGAT	2	12	5171	5182	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148244146
3	NC_009477	AGTAAA	2	12	5501	5512	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148244146
4	NC_009477	CCACGA	2	12	7925	7936	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148244149
5	NC_009477	TAAATT	2	12	9257	9268	50 %	50 %	0 %	0 %	148244150
6	NC_009477	TACCTG	2	12	10108	10119	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148244152
7	NC_009477	TATAAT	2	12	10681	10692	50 %	50 %	0 %	0 %	148244152
8	NC_009477	AATTGC	2	12	11825	11836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148244153
9	NC_009477	AAAATT	2	12	15639	15650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244157
10	NC_009477	CAAAAA	2	12	16954	16965	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009477	TTTATT	2	12	20693	20704	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009477	AGAAAA	2	12	21224	21235	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148244160
13	NC_009477	TTAAAC	2	12	22340	22351	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244161
14	NC_009477	TTGATA	2	12	22913	22924	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148244162
15	NC_009477	GTATAT	2	12	23236	23247	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148244162
16	NC_009477	ATTATC	2	12	23525	23536	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148244163
17	NC_009477	TTAAAC	2	12	25698	25709	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244165
18	NC_009477	ACCTAA	2	12	28935	28946	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148244167

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.