MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 plasmid pSJH901

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009477	ATTAT	2	10	4343	4352	40 %	60 %	0 %	0 %	148244145
2	NC_009477	AAAAG	2	10	4442	4451	80 %	0 %	20 %	0 %	148244145
3	NC_009477	TTATT	2	10	4536	4545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009477	ACAAT	2	10	4816	4825	60 %	20 %	0 %	20 %	148244146
5	NC_009477	ATTCA	2	10	5139	5148	40 %	40 %	0 %	20 %	148244146
6	NC_009477	AACTA	2	10	6507	6516	60 %	20 %	0 %	20 %	148244148
7	NC_009477	AAATC	2	10	6679	6688	60 %	20 %	0 %	20 %	148244148
8	NC_009477	AAATT	2	10	8944	8953	60 %	40 %	0 %	0 %	148244150
9	NC_009477	ATATT	2	10	9894	9903	40 %	60 %	0 %	0 %	148244151
10	NC_009477	TAATT	2	10	10311	10320	40 %	60 %	0 %	0 %	148244152
11	NC_009477	TTGAG	2	10	10323	10332	20 %	40 %	40 %	0 %	148244152
12	NC_009477	GTATC	2	10	11251	11260	20 %	40 %	20 %	20 %	148244152
13	NC_009477	TTATG	2	10	11455	11464	20 %	60 %	20 %	0 %	148244152
14	NC_009477	AATTA	2	10	12280	12289	60 %	40 %	0 %	0 %	148244153
15	NC_009477	TAAGC	2	10	13109	13118	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009477	TATCA	2	10	13634	13643	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009477	AAGAA	2	10	14261	14270	80 %	0 %	20 %	0 %	148244155
18	NC_009477	ATTAA	2	10	14499	14508	60 %	40 %	0 %	0 %	148244155
19	NC_009477	ACAGC	2	10	14901	14910	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009477	CAAGA	2	10	15089	15098	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009477	ATCAC	2	10	15429	15438	40 %	20 %	0 %	40 %	148244156
22	NC_009477	CAAGA	2	10	17091	17100	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009477	ATCTA	2	10	17137	17146	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009477	TAAAA	2	10	17311	17320	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009477	TTTAA	2	10	18844	18853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009477	ATATT	2	10	19391	19400	40 %	60 %	0 %	0 %	148244159
27	NC_009477	CTTTT	2	10	20119	20128	0 %	80 %	0 %	20 %	148244159
28	NC_009477	TTTCT	2	10	21760	21769	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009477	TATGG	2	10	23557	23566	20 %	40 %	40 %	0 %	148244163
30	NC_009477	AGAAA	2	10	24676	24685	80 %	0 %	20 %	0 %	148244163
31	NC_009477	ATATA	2	10	24714	24723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009477	TACTT	2	10	27324	27333	20 %	60 %	0 %	20 %	148244166
33	NC_009477	ATGAA	2	10	28100	28109	60 %	20 %	20 %	0 %	148244167
34	NC_009477	ACCCA	2	10	30188	30197	40 %	0 %	0 %	60 %	148244168

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.