MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 plasmid pSJH901

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009477	AGA	2	6	1354	1359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009477	AAG	2	6	1360	1365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009477	ACT	2	6	1738	1743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009477	TAC	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009477	ATC	2	6	2624	2629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009477	GAT	2	6	2641	2646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009477	ATA	2	6	2647	2652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009477	GTC	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009477	TCA	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009477	TAT	2	6	2756	2761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009477	AAT	2	6	2793	2798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009477	ATT	2	6	2947	2952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009477	TCT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009477	AAC	2	6	3846	3851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009477	AAT	2	6	3859	3864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009477	AGG	2	6	3867	3872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009477	AAT	2	6	5834	5839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009477	TAT	2	6	6356	6361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009477	TAA	2	6	6442	6447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009477	CCT	2	6	9316	9321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009477	TAA	2	6	9480	9485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009477	TAA	2	6	9517	9522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009477	TAT	2	6	9546	9551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009477	CTT	2	6	11707	11712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009477	TAA	2	6	11724	11729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009477	ATA	2	6	12663	12668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009477	TAT	2	6	12694	12699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009477	TAT	2	6	12706	12711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009477	TAT	2	6	12755	12760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009477	TCA	2	6	12857	12862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009477	AAT	2	6	12922	12927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009477	ATA	2	6	12999	13004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009477	TAT	2	6	13028	13033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009477	TAG	2	6	13062	13067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009477	CAA	2	6	13672	13677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009477	TAA	2	6	13713	13718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009477	CTA	2	6	14743	14748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009477	AGT	2	6	14814	14819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009477	TTG	2	6	14865	14870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009477	TGA	2	6	14914	14919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009477	ATG	2	6	14928	14933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009477	CCT	2	6	14963	14968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009477	TAT	3	9	15005	15013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009477	GTC	2	6	15052	15057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009477	TAT	2	6	16125	16130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009477	AAT	2	6	16145	16150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009477	TTC	2	6	16280	16285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009477	TTA	2	6	16405	16410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009477	TCG	2	6	16520	16525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009477	TCG	2	6	16602	16607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009477	CTA	2	6	16685	16690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009477	CGA	2	6	16744	16749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009477	ATT	2	6	17196	17201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009477	TCA	2	6	17300	17305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009477	TTA	2	6	17492	17497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009477	TTC	2	6	18327	18332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009477	TTA	2	6	18554	18559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009477	ATA	2	6	19081	19086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009477	TCA	2	6	19156	19161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009477	CCA	2	6	19231	19236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_009477	CGT	2	6	19301	19306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009477	GAT	2	6	19324	19329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009477	TAA	2	6	20401	20406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009477	ATT	2	6	20462	20467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009477	TTA	2	6	20521	20526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009477	AGT	2	6	20546	20551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009477	TAT	2	6	20575	20580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009477	TAT	2	6	20717	20722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009477	TGA	2	6	20780	20785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009477	AAT	2	6	21531	21536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009477	ATC	2	6	21597	21602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009477	TAA	2	6	21796	21801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009477	CTT	2	6	21822	21827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009477	TCT	2	6	21887	21892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009477	AAC	2	6	22573	22578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009477	AAG	2	6	22683	22688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009477	AGA	2	6	22694	22699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009477	ATT	2	6	22706	22711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009477	ATG	2	6	22773	22778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009477	TTC	2	6	22789	22794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009477	TAT	2	6	24732	24737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009477	ATA	2	6	24776	24781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009477	TCT	2	6	25245	25250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009477	AAC	2	6	25931	25936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009477	CTC	2	6	26003	26008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009477	AGT	2	6	27498	27503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009477	ATT	2	6	30353	30358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009477	ATT	2	6	30400	30405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.