MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9 plasmid pSJH901

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009477	A	6	6	159	164	100 %	0 %	0 %	0 %	148244140
2	NC_009477	A	7	7	1501	1507	100 %	0 %	0 %	0 %	148244142
3	NC_009477	T	7	7	1938	1944	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
4	NC_009477	T	6	6	1982	1987	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
5	NC_009477	T	6	6	2224	2229	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
6	NC_009477	T	6	6	2341	2346	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
7	NC_009477	T	6	6	2350	2355	0 %	100 %	0 %	0 %	148244143
8	NC_009477	A	6	6	2823	2828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009477	A	6	6	3264	3269	100 %	0 %	0 %	0 %	148244144
10	NC_009477	A	6	6	3273	3278	100 %	0 %	0 %	0 %	148244144
11	NC_009477	T	6	6	3786	3791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009477	T	6	6	3875	3880	0 %	100 %	0 %	0 %	148244145
13	NC_009477	A	6	6	4245	4250	100 %	0 %	0 %	0 %	148244145
14	NC_009477	A	6	6	4380	4385	100 %	0 %	0 %	0 %	148244145
15	NC_009477	A	6	6	4578	4583	100 %	0 %	0 %	0 %	148244146
16	NC_009477	A	6	6	4836	4841	100 %	0 %	0 %	0 %	148244146
17	NC_009477	T	6	6	4949	4954	0 %	100 %	0 %	0 %	148244146
18	NC_009477	A	7	7	5277	5283	100 %	0 %	0 %	0 %	148244146
19	NC_009477	A	7	7	5641	5647	100 %	0 %	0 %	0 %	148244146
20	NC_009477	T	6	6	5871	5876	0 %	100 %	0 %	0 %	148244147
21	NC_009477	T	6	6	6798	6803	0 %	100 %	0 %	0 %	148244148
22	NC_009477	T	6	6	7324	7329	0 %	100 %	0 %	0 %	148244149
23	NC_009477	T	7	7	7367	7373	0 %	100 %	0 %	0 %	148244149
24	NC_009477	A	6	6	7906	7911	100 %	0 %	0 %	0 %	148244149
25	NC_009477	T	6	6	8689	8694	0 %	100 %	0 %	0 %	148244149
26	NC_009477	T	9	9	8864	8872	0 %	100 %	0 %	0 %	148244150
27	NC_009477	T	6	6	9220	9225	0 %	100 %	0 %	0 %	148244150
28	NC_009477	T	6	6	9376	9381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009477	T	6	6	9787	9792	0 %	100 %	0 %	0 %	148244151
30	NC_009477	T	6	6	9883	9888	0 %	100 %	0 %	0 %	148244151
31	NC_009477	T	6	6	9976	9981	0 %	100 %	0 %	0 %	148244152
32	NC_009477	T	6	6	10187	10192	0 %	100 %	0 %	0 %	148244152
33	NC_009477	A	7	7	10739	10745	100 %	0 %	0 %	0 %	148244152
34	NC_009477	T	6	6	10835	10840	0 %	100 %	0 %	0 %	148244152
35	NC_009477	T	8	8	11226	11233	0 %	100 %	0 %	0 %	148244152
36	NC_009477	T	7	7	11268	11274	0 %	100 %	0 %	0 %	148244152
37	NC_009477	A	6	6	11633	11638	100 %	0 %	0 %	0 %	148244152
38	NC_009477	A	8	8	11896	11903	100 %	0 %	0 %	0 %	148244153
39	NC_009477	A	6	6	12054	12059	100 %	0 %	0 %	0 %	148244153
40	NC_009477	A	6	6	12213	12218	100 %	0 %	0 %	0 %	148244153
41	NC_009477	A	6	6	12306	12311	100 %	0 %	0 %	0 %	148244153
42	NC_009477	A	8	8	12378	12385	100 %	0 %	0 %	0 %	148244153
43	NC_009477	A	6	6	12815	12820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009477	T	6	6	12900	12905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009477	T	6	6	12969	12974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009477	T	6	6	13158	13163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009477	A	7	7	14288	14294	100 %	0 %	0 %	0 %	148244155
48	NC_009477	A	6	6	14343	14348	100 %	0 %	0 %	0 %	148244155
49	NC_009477	T	6	6	15076	15081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009477	T	6	6	15343	15348	0 %	100 %	0 %	0 %	148244156
51	NC_009477	A	6	6	15387	15392	100 %	0 %	0 %	0 %	148244156
52	NC_009477	T	6	6	15800	15805	0 %	100 %	0 %	0 %	148244157
53	NC_009477	A	6	6	16013	16018	100 %	0 %	0 %	0 %	148244157
54	NC_009477	T	6	6	16300	16305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009477	T	7	7	16609	16615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009477	T	6	6	16729	16734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009477	T	6	6	16823	16828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009477	A	7	7	17124	17130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009477	A	7	7	17279	17285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009477	A	6	6	17317	17322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009477	A	6	6	17601	17606	100 %	0 %	0 %	0 %	148244158
62	NC_009477	A	6	6	17744	17749	100 %	0 %	0 %	0 %	148244158
63	NC_009477	A	7	7	17759	17765	100 %	0 %	0 %	0 %	148244158
64	NC_009477	A	6	6	17865	17870	100 %	0 %	0 %	0 %	148244158
65	NC_009477	A	7	7	17915	17921	100 %	0 %	0 %	0 %	148244158
66	NC_009477	A	6	6	17940	17945	100 %	0 %	0 %	0 %	148244158
67	NC_009477	T	6	6	18347	18352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009477	A	6	6	18387	18392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009477	T	6	6	18729	18734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009477	T	6	6	19029	19034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009477	A	7	7	19048	19054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009477	T	7	7	19129	19135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009477	T	7	7	19294	19300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009477	T	6	6	19531	19536	0 %	100 %	0 %	0 %	148244159
75	NC_009477	T	7	7	19618	19624	0 %	100 %	0 %	0 %	148244159
76	NC_009477	T	7	7	20101	20107	0 %	100 %	0 %	0 %	148244159
77	NC_009477	T	6	6	20125	20130	0 %	100 %	0 %	0 %	148244159
78	NC_009477	A	6	6	20365	20370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009477	A	6	6	20920	20925	100 %	0 %	0 %	0 %	148244160
80	NC_009477	A	8	8	20989	20996	100 %	0 %	0 %	0 %	148244160
81	NC_009477	A	6	6	21295	21300	100 %	0 %	0 %	0 %	148244160
82	NC_009477	A	7	7	21419	21425	100 %	0 %	0 %	0 %	148244160
83	NC_009477	A	6	6	22093	22098	100 %	0 %	0 %	0 %	148244161
84	NC_009477	A	6	6	22452	22457	100 %	0 %	0 %	0 %	148244161
85	NC_009477	A	6	6	23386	23391	100 %	0 %	0 %	0 %	148244163
86	NC_009477	A	7	7	23409	23415	100 %	0 %	0 %	0 %	148244163
87	NC_009477	A	6	6	23644	23649	100 %	0 %	0 %	0 %	148244163
88	NC_009477	A	6	6	23773	23778	100 %	0 %	0 %	0 %	148244163
89	NC_009477	A	6	6	23971	23976	100 %	0 %	0 %	0 %	148244163
90	NC_009477	T	6	6	24006	24011	0 %	100 %	0 %	0 %	148244163
91	NC_009477	T	6	6	24111	24116	0 %	100 %	0 %	0 %	148244163
92	NC_009477	T	6	6	24183	24188	0 %	100 %	0 %	0 %	148244163
93	NC_009477	A	7	7	24763	24769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009477	A	6	6	25451	25456	100 %	0 %	0 %	0 %	148244165
95	NC_009477	A	6	6	25810	25815	100 %	0 %	0 %	0 %	148244165
96	NC_009477	T	6	6	26139	26144	0 %	100 %	0 %	0 %	148244166
97	NC_009477	T	8	8	26434	26441	0 %	100 %	0 %	0 %	148244166
98	NC_009477	T	6	6	26466	26471	0 %	100 %	0 %	0 %	148244166
99	NC_009477	T	8	8	26705	26712	0 %	100 %	0 %	0 %	148244166
100	NC_009477	A	6	6	27132	27137	100 %	0 %	0 %	0 %	148244166
101	NC_009477	T	6	6	27186	27191	0 %	100 %	0 %	0 %	148244166
102	NC_009477	C	6	6	27505	27510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_009477	T	6	6	27851	27856	0 %	100 %	0 %	0 %	148244167
104	NC_009477	T	6	6	28010	28015	0 %	100 %	0 %	0 %	148244167
105	NC_009477	T	6	6	28214	28219	0 %	100 %	0 %	0 %	148244167
106	NC_009477	T	6	6	29020	29025	0 %	100 %	0 %	0 %	148244168
107	NC_009477	T	6	6	29827	29832	0 %	100 %	0 %	0 %	148244168
108	NC_009477	A	6	6	30286	30291	100 %	0 %	0 %	0 %	148244168
109	NC_009477	A	6	6	30413	30418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.