MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 plasmid pBBta01

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009475	GAAAA	2	10	2474	2483	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009475	TCGCT	2	10	9740	9749	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009475	TAGCT	2	10	28841	28850	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009475	GATTT	2	10	28938	28947	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009475	AGGAC	2	10	41638	41647	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009475	AGGCG	2	10	59954	59963	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009475	AGCTA	2	10	70125	70134	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009475	TTGTG	2	10	83892	83901	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009475	GGCCA	2	10	91542	91551	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009475	CATTC	2	10	93018	93027	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_009475	TCGGC	2	10	98430	98439	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009475	GGTCA	2	10	107075	107084	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009475	CTTCT	2	10	109912	109921	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009475	ACCCT	2	10	113566	113575	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_009475	TGAAA	2	10	118605	118614	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009475	CGGGA	2	10	123015	123024	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009475	TCGGC	2	10	141939	141948	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009475	AGCGT	2	10	144876	144885	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009475	CGATC	2	10	153344	153353	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009475	TGACC	2	10	161323	161332	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009475	CTGGT	2	10	167589	167598	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009475	GCTGC	2	10	168242	168251	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009475	CCGGC	2	10	168594	168603	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
24	NC_009475	GATCG	2	10	168692	168701	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009475	TTTGG	2	10	169632	169641	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009475	TGCCT	2	10	171265	171274	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009475	CCGCG	2	10	172901	172910	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_009475	TCGGT	2	10	175188	175197	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009475	GGCGA	2	10	176995	177004	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009475	GTTGA	2	10	190042	190051	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009475	ACAAA	2	10	190053	190062	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009475	CGGGC	2	10	192434	192443	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009475	CCGGA	2	10	194405	194414	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009475	TCCGC	2	10	200546	200555	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_009475	CAAGA	2	10	213787	213796	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009475	CGACC	2	10	220060	220069	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_009475	GAAAG	2	10	220120	220129	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009475	AGCAA	2	10	220224	220233	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009475	CTGCG	2	10	222711	222720	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.