MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 plasmid pBBta01

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009475	GC	3	6	82	87	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009475	TC	3	6	149	154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009475	CG	3	6	5200	5205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009475	CG	4	8	7176	7183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009475	GC	3	6	11739	11744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009475	AG	3	6	11788	11793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009475	GC	3	6	11850	11855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009475	GA	3	6	12013	12018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009475	GC	3	6	26557	26562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009475	AT	3	6	27170	27175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009475	GA	3	6	30393	30398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009475	GC	3	6	38279	38284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009475	GC	3	6	41563	41568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009475	CG	4	8	41598	41605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009475	CG	4	8	42107	42114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009475	AC	3	6	42117	42122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009475	GA	3	6	51011	51016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009475	GC	3	6	54134	54139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009475	GC	3	6	59939	59944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009475	AT	3	6	60037	60042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009475	GC	3	6	61331	61336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009475	GC	3	6	61354	61359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009475	GA	3	6	61692	61697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009475	CG	3	6	62036	62041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009475	GC	3	6	65293	65298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009475	TG	3	6	65742	65747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009475	TC	3	6	66430	66435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009475	CG	3	6	76917	76922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009475	AG	3	6	76982	76987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009475	AG	3	6	81204	81209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009475	GC	3	6	81577	81582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009475	GA	3	6	83307	83312	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009475	GC	3	6	90408	90413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009475	AC	3	6	90431	90436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009475	GC	3	6	92856	92861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009475	CG	3	6	103406	103411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009475	GC	3	6	104615	104620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009475	TC	3	6	105814	105819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009475	GA	3	6	106686	106691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009475	AT	3	6	109963	109968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009475	CA	3	6	110371	110376	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009475	AG	3	6	113798	113803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009475	GC	3	6	115258	115263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009475	GC	3	6	115367	115372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009475	GC	3	6	118768	118773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009475	GC	3	6	118784	118789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009475	TA	3	6	120478	120483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009475	CG	3	6	120600	120605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009475	TC	3	6	120930	120935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009475	GC	3	6	123177	123182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009475	CA	3	6	125983	125988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009475	CG	3	6	136821	136826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009475	GC	3	6	137402	137407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009475	GC	3	6	137815	137820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009475	GC	3	6	141643	141648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009475	CG	4	8	149359	149366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009475	TG	4	8	153381	153388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009475	TC	3	6	158565	158570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009475	TC	3	6	161716	161721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009475	AC	3	6	166647	166652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009475	GC	3	6	167345	167350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009475	GC	4	8	168250	168257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009475	GC	3	6	168266	168271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009475	AG	3	6	168274	168279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009475	GC	3	6	168818	168823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009475	TC	3	6	168922	168927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009475	GC	3	6	170155	170160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009475	GC	3	6	170339	170344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009475	TG	3	6	171481	171486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009475	CT	3	6	173820	173825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009475	CG	3	6	176944	176949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009475	CG	3	6	191461	191466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009475	GC	3	6	193161	193166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009475	AG	3	6	193223	193228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009475	CG	4	8	200655	200662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009475	GC	3	6	207496	207501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009475	GC	3	6	207909	207914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009475	CG	3	6	208250	208255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009475	GC	3	6	208436	208441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_009475	TC	3	6	208564	208569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009475	CG	3	6	208644	208649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009475	CT	3	6	208805	208810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009475	TG	3	6	213573	213578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009475	GC	3	6	220004	220009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009475	CT	3	6	225205	225210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009475	TA	3	6	226080	226085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009475	GC	3	6	226233	226238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009475	GC	3	6	228729	228734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009475	AT	3	6	228739	228744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.