MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY08

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009474	ATT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009474	AGG	2	6	197	202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009474	GGC	2	6	255	260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009474	GAT	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009474	CGG	2	6	316	321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009474	GGC	2	6	442	447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009474	GCG	2	6	460	465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009474	CCT	2	6	560	565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_009474	TAG	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009474	TGG	2	6	629	634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009474	CCG	2	6	643	648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009474	CTG	2	6	658	663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009474	CCG	2	6	682	687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009474	CAG	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009474	ACA	2	6	857	862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009474	GCA	2	6	1018	1023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009474	GCG	2	6	1180	1185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244134
18	NC_009474	CGG	2	6	1244	1249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244134
19	NC_009474	AGC	2	6	1262	1267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244134
20	NC_009474	CGT	2	6	1328	1333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244134
21	NC_009474	GCC	2	6	1356	1361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244134
22	NC_009474	GCC	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244134
23	NC_009474	AGG	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244134
24	NC_009474	GGT	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244134
25	NC_009474	TGA	2	6	1521	1526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244134
26	NC_009474	ATC	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244134
27	NC_009474	TGC	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009474	CGC	2	6	1733	1738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009474	GTG	2	6	1780	1785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244135
30	NC_009474	GAG	2	6	1905	1910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244135
31	NC_009474	GGT	2	6	1931	1936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244135
32	NC_009474	AGC	2	6	1970	1975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244135
33	NC_009474	TGA	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244135
34	NC_009474	GCA	2	6	2211	2216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244135
35	NC_009474	ATC	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009474	CGA	3	9	2535	2543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009474	GCG	2	6	2566	2571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009474	ATG	2	6	2593	2598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009474	CAT	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009474	GCC	2	6	2634	2639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_009474	CAT	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009474	CAT	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009474	CAT	2	6	2689	2694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009474	CAT	2	6	2701	2706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009474	GTT	2	6	2954	2959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009474	GTG	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009474	CAT	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009474	TGC	2	6	3075	3080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009474	CAT	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009474	CAT	2	6	3124	3129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009474	CAT	2	6	3136	3141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009474	GTA	2	6	3158	3163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009474	GCG	2	6	3179	3184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009474	TGC	2	6	3228	3233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009474	ACG	2	6	3253	3258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009474	CAT	2	6	3318	3323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009474	CAT	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244136
58	NC_009474	GGT	2	6	3439	3444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244136
59	NC_009474	TCG	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244136
60	NC_009474	CGG	2	6	3614	3619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244136
61	NC_009474	GAG	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244136
62	NC_009474	GGC	2	6	3666	3671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244136
63	NC_009474	GGC	2	6	3849	3854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244137
64	NC_009474	CAG	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244137
65	NC_009474	AGC	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244137
66	NC_009474	CCT	2	6	3976	3981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244137
67	NC_009474	TGG	2	6	4071	4076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244137
68	NC_009474	GGC	2	6	4211	4216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244137
69	NC_009474	CGG	2	6	4322	4327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244138
70	NC_009474	GGC	2	6	4392	4397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244138
71	NC_009474	TCG	3	9	4428	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244138
72	NC_009474	CCG	2	6	4447	4452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244138
73	NC_009474	TGT	2	6	4526	4531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244138
74	NC_009474	CAT	2	6	4619	4624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244138
75	NC_009474	TGC	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244138

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.