MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY05

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009471	TCGCC	2	10	1517	1526	0 %	20 %	20 %	60 %	148244089
2	NC_009471	GCCGT	2	10	1666	1675	0 %	20 %	40 %	40 %	148244089
3	NC_009471	CACGC	2	10	2132	2141	20 %	0 %	20 %	60 %	148244089
4	NC_009471	AGCCG	2	10	2683	2692	20 %	0 %	40 %	40 %	148244089
5	NC_009471	GCCGC	2	10	2972	2981	0 %	0 %	40 %	60 %	148244089
6	NC_009471	GCGCC	2	10	3524	3533	0 %	0 %	40 %	60 %	148244089
7	NC_009471	CGCCC	2	10	3825	3834	0 %	0 %	20 %	80 %	148244089
8	NC_009471	AGCGC	2	10	6404	6413	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009471	TTCTT	2	10	6529	6538	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009471	TTTCG	2	10	6614	6623	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009471	GCGCC	2	10	8362	8371	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_009471	TGGGA	2	10	10169	10178	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009471	TTGGT	2	10	10284	10293	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009471	TGGGG	2	10	10351	10360	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009471	TGCCA	2	10	10983	10992	20 %	20 %	20 %	40 %	148244094
16	NC_009471	CATGG	2	10	11012	11021	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_009471	GCATG	2	10	12952	12961	20 %	20 %	40 %	20 %	148244096
18	NC_009471	GCTTG	2	10	14429	14438	0 %	40 %	40 %	20 %	148244097
19	NC_009471	ATCCG	2	10	14925	14934	20 %	20 %	20 %	40 %	148244098
20	NC_009471	CTCGG	2	10	15863	15872	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009471	CGCAC	2	10	16155	16164	20 %	0 %	20 %	60 %	148244100
22	NC_009471	CTGGC	2	10	17422	17431	0 %	20 %	40 %	40 %	148244102
23	NC_009471	CAGGG	2	10	17747	17756	20 %	0 %	60 %	20 %	148244103
24	NC_009471	AACGG	2	10	18719	18728	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009471	CGCTG	2	10	19834	19843	0 %	20 %	40 %	40 %	148244104
26	NC_009471	TCGTG	2	10	20315	20324	0 %	40 %	40 %	20 %	148244105
27	NC_009471	CCCGA	2	10	21268	21277	20 %	0 %	20 %	60 %	148244105
28	NC_009471	GCCAG	2	10	22658	22667	20 %	0 %	40 %	40 %	148244105
29	NC_009471	TACCA	2	10	23919	23928	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009471	CTCTC	2	10	24641	24650	0 %	40 %	0 %	60 %	148244107
31	NC_009471	ATTTT	2	10	27235	27244	20 %	80 %	0 %	0 %	148244108
32	NC_009471	AATAT	2	10	28112	28121	60 %	40 %	0 %	0 %	148244108
33	NC_009471	CAAAT	2	10	28257	28266	60 %	20 %	0 %	20 %	148244108
34	NC_009471	ATGAT	2	10	28637	28646	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009471	GGCGC	2	10	29457	29466	0 %	0 %	60 %	40 %	148244110
36	NC_009471	CAGGG	2	10	32927	32936	20 %	0 %	60 %	20 %	148244113
37	NC_009471	TGTCG	2	10	36751	36760	0 %	40 %	40 %	20 %	148244116
38	NC_009471	AGCGG	2	10	36903	36912	20 %	0 %	60 %	20 %	148244116

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.