MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY05

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009471	GGCG	2	8	134	141	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009471	GCCC	2	8	481	488	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_009471	CCGC	2	8	528	535	0 %	0 %	25 %	75 %	148244089
4	NC_009471	GCGG	2	8	888	895	0 %	0 %	75 %	25 %	148244089
5	NC_009471	CCGT	2	8	1120	1127	0 %	25 %	25 %	50 %	148244089
6	NC_009471	CCGG	2	8	1224	1231	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
7	NC_009471	TCGA	2	8	1837	1844	25 %	25 %	25 %	25 %	148244089
8	NC_009471	GCCG	2	8	1982	1989	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
9	NC_009471	CGCC	2	8	2035	2042	0 %	0 %	25 %	75 %	148244089
10	NC_009471	GCCA	2	8	2093	2100	25 %	0 %	25 %	50 %	148244089
11	NC_009471	TGCC	2	8	2171	2178	0 %	25 %	25 %	50 %	148244089
12	NC_009471	GCCT	2	8	2334	2341	0 %	25 %	25 %	50 %	148244089
13	NC_009471	GCCG	2	8	2568	2575	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
14	NC_009471	CCGC	2	8	2624	2631	0 %	0 %	25 %	75 %	148244089
15	NC_009471	GCGG	2	8	3243	3250	0 %	0 %	75 %	25 %	148244089
16	NC_009471	TCGG	2	8	3406	3413	0 %	25 %	50 %	25 %	148244089
17	NC_009471	CCGC	2	8	3536	3543	0 %	0 %	25 %	75 %	148244089
18	NC_009471	GGCG	2	8	3699	3706	0 %	0 %	75 %	25 %	148244089
19	NC_009471	CCGC	2	8	3787	3794	0 %	0 %	25 %	75 %	148244089
20	NC_009471	CGGA	2	8	4338	4345	25 %	0 %	50 %	25 %	148244089
21	NC_009471	CCGC	2	8	4668	4675	0 %	0 %	25 %	75 %	148244089
22	NC_009471	ATCG	2	8	4824	4831	25 %	25 %	25 %	25 %	148244089
23	NC_009471	GTGC	2	8	5009	5016	0 %	25 %	50 %	25 %	148244089
24	NC_009471	CGGC	2	8	5141	5148	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
25	NC_009471	CGCC	2	8	5632	5639	0 %	0 %	25 %	75 %	148244090
26	NC_009471	CCCG	2	8	6852	6859	0 %	0 %	25 %	75 %	148244091
27	NC_009471	CGGC	2	8	6882	6889	0 %	0 %	50 %	50 %	148244091
28	NC_009471	GCCG	2	8	7503	7510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009471	TACC	2	8	8182	8189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009471	GACA	2	8	8442	8449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009471	ACCT	2	8	9032	9039	25 %	25 %	0 %	50 %	148244093
32	NC_009471	ACCG	2	8	9682	9689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009471	GTCA	2	8	9691	9698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009471	ATTA	2	8	10097	10104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009471	GCCG	2	8	11241	11248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009471	CTGA	2	8	11273	11280	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009471	GCCG	2	8	11519	11526	0 %	0 %	50 %	50 %	148244095
38	NC_009471	GCCG	2	8	12658	12665	0 %	0 %	50 %	50 %	148244095
39	NC_009471	CCCG	2	8	12726	12733	0 %	0 %	25 %	75 %	148244095
40	NC_009471	ACCA	2	8	12901	12908	50 %	0 %	0 %	50 %	148244096
41	NC_009471	TGGC	2	8	13022	13029	0 %	25 %	50 %	25 %	148244096
42	NC_009471	CCAG	2	8	13500	13507	25 %	0 %	25 %	50 %	148244096
43	NC_009471	TCGA	2	8	13566	13573	25 %	25 %	25 %	25 %	148244096
44	NC_009471	CAGT	2	8	13810	13817	25 %	25 %	25 %	25 %	148244097
45	NC_009471	TCGA	2	8	14178	14185	25 %	25 %	25 %	25 %	148244097
46	NC_009471	GATC	2	8	14272	14279	25 %	25 %	25 %	25 %	148244097
47	NC_009471	CCAT	2	8	14954	14961	25 %	25 %	0 %	50 %	148244098
48	NC_009471	CCGC	2	8	15548	15555	0 %	0 %	25 %	75 %	148244099
49	NC_009471	CCAT	2	8	15752	15759	25 %	25 %	0 %	50 %	148244099
50	NC_009471	TAGA	2	8	16348	16355	50 %	25 %	25 %	0 %	148244100
51	NC_009471	TCCA	2	8	16738	16745	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009471	AGGC	2	8	16772	16779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009471	TGCC	2	8	16782	16789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009471	TGCG	2	8	17149	17156	0 %	25 %	50 %	25 %	148244102
55	NC_009471	GCCG	2	8	17632	17639	0 %	0 %	50 %	50 %	148244103
56	NC_009471	ACCT	2	8	17928	17935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009471	CGGG	2	8	18458	18465	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009471	GCTG	2	8	18640	18647	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009471	CCCG	2	8	19020	19027	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_009471	AGGA	2	8	19054	19061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009471	CGGC	2	8	19225	19232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009471	GCTT	2	8	19495	19502	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009471	GGCC	2	8	20131	20138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009471	GTGG	2	8	20307	20314	0 %	25 %	75 %	0 %	148244105
65	NC_009471	TGAA	2	8	20599	20606	50 %	25 %	25 %	0 %	148244105
66	NC_009471	CCAG	2	8	20684	20691	25 %	0 %	25 %	50 %	148244105
67	NC_009471	CGGC	2	8	20875	20882	0 %	0 %	50 %	50 %	148244105
68	NC_009471	CCAG	2	8	21719	21726	25 %	0 %	25 %	50 %	148244105
69	NC_009471	CGAA	2	8	22170	22177	50 %	0 %	25 %	25 %	148244105
70	NC_009471	CCGG	2	8	22509	22516	0 %	0 %	50 %	50 %	148244105
71	NC_009471	GATT	2	8	22543	22550	25 %	50 %	25 %	0 %	148244105
72	NC_009471	CTGG	2	8	22674	22681	0 %	25 %	50 %	25 %	148244105
73	NC_009471	CGGT	2	8	22879	22886	0 %	25 %	50 %	25 %	148244105
74	NC_009471	CGGC	2	8	23097	23104	0 %	0 %	50 %	50 %	148244105
75	NC_009471	ACAG	2	8	23191	23198	50 %	0 %	25 %	25 %	148244105
76	NC_009471	TCCC	2	8	23292	23299	0 %	25 %	0 %	75 %	148244106
77	NC_009471	CCTG	2	8	23301	23308	0 %	25 %	25 %	50 %	148244106
78	NC_009471	ATCG	2	8	23443	23450	25 %	25 %	25 %	25 %	148244106
79	NC_009471	CCTG	2	8	23498	23505	0 %	25 %	25 %	50 %	148244106
80	NC_009471	GTCG	2	8	23854	23861	0 %	25 %	50 %	25 %	148244106
81	NC_009471	AACG	2	8	24155	24162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009471	CGGC	2	8	25097	25104	0 %	0 %	50 %	50 %	148244107
83	NC_009471	GCCG	2	8	25638	25645	0 %	0 %	50 %	50 %	148244107
84	NC_009471	TCAA	2	8	26379	26386	50 %	25 %	0 %	25 %	148244108
85	NC_009471	TCTT	2	8	26649	26656	0 %	75 %	0 %	25 %	148244108
86	NC_009471	ATTC	2	8	27419	27426	25 %	50 %	0 %	25 %	148244108
87	NC_009471	GCCG	2	8	28875	28882	0 %	0 %	50 %	50 %	148244109
88	NC_009471	ATGA	2	8	28923	28930	50 %	25 %	25 %	0 %	148244109
89	NC_009471	GCCG	2	8	30116	30123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009471	ACCT	2	8	30708	30715	25 %	25 %	0 %	50 %	148244111
91	NC_009471	GAGG	2	8	30726	30733	25 %	0 %	75 %	0 %	148244111
92	NC_009471	TTCA	2	8	31044	31051	25 %	50 %	0 %	25 %	148244111
93	NC_009471	CCGC	2	8	31380	31387	0 %	0 %	25 %	75 %	148244111
94	NC_009471	GACG	2	8	31471	31478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009471	TTCC	2	8	32391	32398	0 %	50 %	0 %	50 %	148244112
96	NC_009471	AACG	2	8	32427	32434	50 %	0 %	25 %	25 %	148244112
97	NC_009471	GCGG	2	8	33163	33170	0 %	0 %	75 %	25 %	148244113
98	NC_009471	CGTT	2	8	34134	34141	0 %	50 %	25 %	25 %	148244114
99	NC_009471	GGAA	2	8	34170	34177	50 %	0 %	50 %	0 %	148244114
100	NC_009471	GTTC	2	8	34494	34501	0 %	50 %	25 %	25 %	148244114
101	NC_009471	CCAG	2	8	35093	35100	25 %	0 %	25 %	50 %	148244114
102	NC_009471	GCAA	2	8	35280	35287	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009471	TGTT	2	8	36304	36311	0 %	75 %	25 %	0 %	148244116
104	NC_009471	GGGT	2	8	37032	37039	0 %	25 %	75 %	0 %	148244116

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.