MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY05

Total Repeats: 436

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009471	CGC	2	6	681	686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
2	NC_009471	GCC	2	6	691	696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
3	NC_009471	CGG	2	6	842	847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
4	NC_009471	TCA	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244089
5	NC_009471	GCC	2	6	865	870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
6	NC_009471	GCG	2	6	900	905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
7	NC_009471	CCT	2	6	908	913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244089
8	NC_009471	GCC	3	9	1025	1033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
9	NC_009471	GCC	2	6	1137	1142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
10	NC_009471	GTG	2	6	1168	1173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244089
11	NC_009471	TGG	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244089
12	NC_009471	GCA	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
13	NC_009471	GCC	2	6	1359	1364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
14	NC_009471	CCG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
15	NC_009471	CAG	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
16	NC_009471	CCG	2	6	1599	1604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
17	NC_009471	GCG	2	6	1618	1623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
18	NC_009471	CGA	2	6	1655	1660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
19	NC_009471	GCC	2	6	1716	1721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
20	NC_009471	GCA	2	6	1727	1732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
21	NC_009471	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244089
22	NC_009471	CCA	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
23	NC_009471	CAC	2	6	1953	1958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
24	NC_009471	TGA	2	6	2003	2008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244089
25	NC_009471	CCA	2	6	2144	2149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
26	NC_009471	GCC	2	6	2182	2187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
27	NC_009471	GAT	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244089
28	NC_009471	ATC	2	6	2230	2235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244089
29	NC_009471	CGC	2	6	2280	2285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
30	NC_009471	GCC	2	6	2344	2349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
31	NC_009471	GTC	2	6	2389	2394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244089
32	NC_009471	GAT	2	6	2457	2462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244089
33	NC_009471	GCC	2	6	2487	2492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
34	NC_009471	CGC	2	6	2552	2557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
35	NC_009471	TGA	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244089
36	NC_009471	CCG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
37	NC_009471	TCC	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244089
38	NC_009471	GCC	2	6	2768	2773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
39	NC_009471	TCG	2	6	2794	2799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244089
40	NC_009471	GCC	2	6	2826	2831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
41	NC_009471	CAG	2	6	2835	2840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
42	NC_009471	GGC	2	6	2889	2894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
43	NC_009471	CGC	2	6	2940	2945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
44	NC_009471	TCC	2	6	2953	2958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244089
45	NC_009471	GGT	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244089
46	NC_009471	CCG	2	6	3018	3023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
47	NC_009471	GCC	2	6	3303	3308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
48	NC_009471	GCC	3	9	3754	3762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
49	NC_009471	ACC	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
50	NC_009471	GCC	3	9	3892	3900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
51	NC_009471	GGC	2	6	3947	3952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
52	NC_009471	CAG	2	6	3972	3977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
53	NC_009471	CCA	2	6	4016	4021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
54	NC_009471	CCG	2	6	4024	4029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
55	NC_009471	ACA	2	6	4042	4047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244089
56	NC_009471	CAC	2	6	4068	4073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
57	NC_009471	CCG	2	6	4136	4141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
58	NC_009471	CAG	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
59	NC_009471	CGG	2	6	4189	4194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
60	NC_009471	CAC	2	6	4290	4295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
61	NC_009471	GCC	2	6	4306	4311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
62	NC_009471	CCG	2	6	4316	4321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
63	NC_009471	TCA	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244089
64	NC_009471	GCC	2	6	4453	4458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
65	NC_009471	GCC	2	6	4603	4608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
66	NC_009471	GCC	2	6	4646	4651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
67	NC_009471	GGC	2	6	4683	4688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
68	NC_009471	GGT	2	6	4707	4712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244089
69	NC_009471	GCC	2	6	4773	4778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
70	NC_009471	CGG	2	6	4799	4804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
71	NC_009471	CTC	2	6	4851	4856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244089
72	NC_009471	GCC	2	6	4858	4863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
73	NC_009471	CGG	2	6	4872	4877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
74	NC_009471	GCC	2	6	4921	4926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
75	NC_009471	ATC	2	6	4941	4946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244089
76	NC_009471	CTT	2	6	4955	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244089
77	NC_009471	ATC	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244089
78	NC_009471	GCG	2	6	4994	4999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
79	NC_009471	GCC	2	6	5032	5037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
80	NC_009471	CGG	2	6	5042	5047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
81	NC_009471	TCC	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244089
82	NC_009471	GGC	2	6	5122	5127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
83	NC_009471	GCG	2	6	5243	5248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
84	NC_009471	TCT	2	6	5279	5284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244089
85	NC_009471	CAG	2	6	5307	5312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
86	NC_009471	GCA	2	6	5365	5370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
87	NC_009471	GCC	2	6	5437	5442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
88	NC_009471	CCG	2	6	5453	5458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
89	NC_009471	GCC	2	6	5481	5486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
90	NC_009471	ATA	2	6	5508	5513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244089
91	NC_009471	TCA	2	6	5552	5557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244089
92	NC_009471	GGT	2	6	5558	5563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244089
93	NC_009471	CGG	2	6	5576	5581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
94	NC_009471	TGC	2	6	5643	5648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244090
95	NC_009471	CGT	2	6	5729	5734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244090
96	NC_009471	GGT	2	6	5753	5758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244090
97	NC_009471	TCC	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244090
98	NC_009471	ATC	2	6	5877	5882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244090
99	NC_009471	CGT	2	6	6718	6723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244091
100	NC_009471	GAC	2	6	6733	6738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244091
101	NC_009471	CCG	2	6	6777	6782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244091
102	NC_009471	ACC	2	6	6868	6873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244091
103	NC_009471	GCC	2	6	6907	6912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244091
104	NC_009471	GGC	2	6	7039	7044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244091
105	NC_009471	CCA	2	6	7059	7064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244091
106	NC_009471	GAT	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244091
107	NC_009471	GCC	2	6	7195	7200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244091
108	NC_009471	GCT	2	6	7212	7217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244091
109	NC_009471	ACT	2	6	7254	7259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244091
110	NC_009471	TCA	2	6	7307	7312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244091
111	NC_009471	GTC	2	6	7387	7392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244091
112	NC_009471	CCG	2	6	7409	7414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244091
113	NC_009471	TCG	2	6	7686	7691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244092
114	NC_009471	TCC	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244092
115	NC_009471	CTG	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244093
116	NC_009471	CGG	2	6	9004	9009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244093
117	NC_009471	CGA	2	6	9204	9209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244093
118	NC_009471	CGC	2	6	9274	9279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244093
119	NC_009471	GCG	2	6	9286	9291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244093
120	NC_009471	CGC	2	6	9299	9304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244093
121	NC_009471	GAC	2	6	9309	9314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244093
122	NC_009471	GAC	2	6	10484	10489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244094
123	NC_009471	GCC	2	6	10561	10566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244094
124	NC_009471	GGC	2	6	10593	10598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244094
125	NC_009471	CCT	2	6	10607	10612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244094
126	NC_009471	GCG	2	6	10669	10674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244094
127	NC_009471	GGC	2	6	10734	10739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244094
128	NC_009471	CCA	2	6	10795	10800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244094
129	NC_009471	CGC	2	6	10804	10809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244094
130	NC_009471	CTT	2	6	10947	10952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244094
131	NC_009471	AGG	2	6	11494	11499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244095
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380	NC_009471	CGG	2	6	32826	32831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244113
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384	NC_009471	GTC	2	6	33127	33132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244113
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436	NC_009471	GAT	2	6	37091	37096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244116

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.