MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY04

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009470	TCATG	2	10	206	215	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009470	TAATA	2	10	663	672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009470	TGCAA	2	10	726	735	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009470	TCCGG	2	10	1009	1018	0 %	20 %	40 %	40 %	148244056
5	NC_009470	GAAGA	2	10	3421	3430	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009470	CCTGA	2	10	6829	6838	20 %	20 %	20 %	40 %	148244061
7	NC_009470	GCCGC	2	10	7972	7981	0 %	0 %	40 %	60 %	148244063
8	NC_009470	CAACA	2	10	9457	9466	60 %	0 %	0 %	40 %	148244064
9	NC_009470	TCCGG	2	10	11472	11481	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_009470	TCGCC	2	10	13437	13446	0 %	20 %	20 %	60 %	148244069
11	NC_009470	GCCGT	2	10	15503	15512	0 %	20 %	40 %	40 %	148244070
12	NC_009470	TCAGG	2	10	17326	17335	20 %	20 %	40 %	20 %	148244071
13	NC_009470	CCCGA	2	10	17649	17658	20 %	0 %	20 %	60 %	148244071
14	NC_009470	GCCAG	2	10	19039	19048	20 %	0 %	40 %	40 %	148244071
15	NC_009470	CGCCC	2	10	19537	19546	0 %	0 %	20 %	80 %	148244071
16	NC_009470	GGCCA	2	10	23435	23444	20 %	0 %	40 %	40 %	148244076
17	NC_009470	GGCCA	2	10	24640	24649	20 %	0 %	40 %	40 %	148244077
18	NC_009470	GGGCC	2	10	25306	25315	0 %	0 %	60 %	40 %	148244077
19	NC_009470	CCGGG	2	10	25465	25474	0 %	0 %	60 %	40 %	148244077
20	NC_009470	CATAT	2	10	25654	25663	40 %	40 %	0 %	20 %	148244077
21	NC_009470	GTGAA	2	10	26198	26207	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009470	GCAGG	2	10	27522	27531	20 %	0 %	60 %	20 %	148244080
23	NC_009470	GTCCG	2	10	28409	28418	0 %	20 %	40 %	40 %	148244080
24	NC_009470	TACCG	2	10	30201	30210	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009470	GACAT	2	10	31932	31941	40 %	20 %	20 %	20 %	148244083
26	NC_009470	TCCGT	2	10	33234	33243	0 %	40 %	20 %	40 %	148244085
27	NC_009470	GCGAT	2	10	35062	35071	20 %	20 %	40 %	20 %	148244086
28	NC_009470	CCTTG	2	10	35537	35546	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009470	TGACG	2	10	37276	37285	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.