MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY04

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009470	CTTC	2	8	1001	1008	0 %	50 %	0 %	50 %	148244056
2	NC_009470	GCCG	2	8	1074	1081	0 %	0 %	50 %	50 %	148244056
3	NC_009470	CGAT	2	8	1232	1239	25 %	25 %	25 %	25 %	148244056
4	NC_009470	ATTG	2	8	2964	2971	25 %	50 %	25 %	0 %	148244058
5	NC_009470	CATC	2	8	4676	4683	25 %	25 %	0 %	50 %	148244059
6	NC_009470	TCGC	3	12	4971	4982	0 %	25 %	25 %	50 %	148244060
7	NC_009470	CTTC	2	8	5641	5648	0 %	50 %	0 %	50 %	148244060
8	NC_009470	TCGC	2	8	5778	5785	0 %	25 %	25 %	50 %	148244060
9	NC_009470	CCGT	2	8	5802	5809	0 %	25 %	25 %	50 %	148244060
10	NC_009470	GCTC	2	8	6256	6263	0 %	25 %	25 %	50 %	148244060
11	NC_009470	TGGC	2	8	6370	6377	0 %	25 %	50 %	25 %	148244060
12	NC_009470	CCGC	2	8	6807	6814	0 %	0 %	25 %	75 %	148244061
13	NC_009470	TCGG	2	8	6815	6822	0 %	25 %	50 %	25 %	148244061
14	NC_009470	ATTC	2	8	7267	7274	25 %	50 %	0 %	25 %	148244062
15	NC_009470	TCAG	2	8	7397	7404	25 %	25 %	25 %	25 %	148244062
16	NC_009470	GTCG	2	8	8010	8017	0 %	25 %	50 %	25 %	148244063
17	NC_009470	TGGA	2	8	8438	8445	25 %	25 %	50 %	0 %	148244063
18	NC_009470	GGCT	2	8	8638	8645	0 %	25 %	50 %	25 %	148244063
19	NC_009470	GCCG	2	8	8754	8761	0 %	0 %	50 %	50 %	148244063
20	NC_009470	CCAA	2	8	9119	9126	50 %	0 %	0 %	50 %	148244063
21	NC_009470	GGCA	2	8	9563	9570	25 %	0 %	50 %	25 %	148244064
22	NC_009470	GCCC	2	8	9717	9724	0 %	0 %	25 %	75 %	148244064
23	NC_009470	GATG	2	8	10142	10149	25 %	25 %	50 %	0 %	148244065
24	NC_009470	GCCG	3	12	10382	10393	0 %	0 %	50 %	50 %	148244065
25	NC_009470	CGGC	2	8	10499	10506	0 %	0 %	50 %	50 %	148244065
26	NC_009470	CAAC	2	8	11085	11092	50 %	0 %	0 %	50 %	148244066
27	NC_009470	CCAG	2	8	11123	11130	25 %	0 %	25 %	50 %	148244066
28	NC_009470	TCCC	2	8	11249	11256	0 %	25 %	0 %	75 %	148244066
29	NC_009470	GGTC	2	8	11695	11702	0 %	25 %	50 %	25 %	148244067
30	NC_009470	GATC	2	8	11929	11936	25 %	25 %	25 %	25 %	148244067
31	NC_009470	GTCG	2	8	12835	12842	0 %	25 %	50 %	25 %	148244067
32	NC_009470	GATT	2	8	14021	14028	25 %	50 %	25 %	0 %	148244070
33	NC_009470	ACCG	2	8	14080	14087	25 %	0 %	25 %	50 %	148244070
34	NC_009470	CTGG	2	8	14257	14264	0 %	25 %	50 %	25 %	148244070
35	NC_009470	GACC	2	8	14326	14333	25 %	0 %	25 %	50 %	148244070
36	NC_009470	GGCT	2	8	14651	14658	0 %	25 %	50 %	25 %	148244070
37	NC_009470	GATC	2	8	14872	14879	25 %	25 %	25 %	25 %	148244070
38	NC_009470	CGGC	2	8	14995	15002	0 %	0 %	50 %	50 %	148244070
39	NC_009470	TTGC	2	8	15257	15264	0 %	50 %	25 %	25 %	148244070
40	NC_009470	GCGA	2	8	15707	15714	25 %	0 %	50 %	25 %	148244070
41	NC_009470	GTGG	2	8	16688	16695	0 %	25 %	75 %	0 %	148244071
42	NC_009470	TGAA	2	8	16980	16987	50 %	25 %	25 %	0 %	148244071
43	NC_009470	CCAG	2	8	17065	17072	25 %	0 %	25 %	50 %	148244071
44	NC_009470	CGGC	2	8	17256	17263	0 %	0 %	50 %	50 %	148244071
45	NC_009470	CCAG	2	8	18100	18107	25 %	0 %	25 %	50 %	148244071
46	NC_009470	AGTC	2	8	18136	18143	25 %	25 %	25 %	25 %	148244071
47	NC_009470	CGAA	2	8	18551	18558	50 %	0 %	25 %	25 %	148244071
48	NC_009470	CCGG	2	8	18890	18897	0 %	0 %	50 %	50 %	148244071
49	NC_009470	GATT	2	8	18924	18931	25 %	50 %	25 %	0 %	148244071
50	NC_009470	CTGG	2	8	19055	19062	0 %	25 %	50 %	25 %	148244071
51	NC_009470	CGGC	2	8	19478	19485	0 %	0 %	50 %	50 %	148244071
52	NC_009470	TCAG	2	8	19608	19615	25 %	25 %	25 %	25 %	148244071
53	NC_009470	GCGG	2	8	19812	19819	0 %	0 %	75 %	25 %	148244072
54	NC_009470	TGAA	2	8	20148	20155	50 %	25 %	25 %	0 %	148244072
55	NC_009470	CCCT	2	8	20465	20472	0 %	25 %	0 %	75 %	148244072
56	NC_009470	AGGT	2	8	20484	20491	25 %	25 %	50 %	0 %	148244072
57	NC_009470	ATCG	2	8	21270	21277	25 %	25 %	25 %	25 %	148244073
58	NC_009470	TCGG	2	8	21281	21288	0 %	25 %	50 %	25 %	148244073
59	NC_009470	CCTG	2	8	21325	21332	0 %	25 %	25 %	50 %	148244073
60	NC_009470	CCGG	2	8	21572	21579	0 %	0 %	50 %	50 %	148244073
61	NC_009470	GTCG	2	8	21681	21688	0 %	25 %	50 %	25 %	148244073
62	NC_009470	GGTT	2	8	22772	22779	0 %	50 %	50 %	0 %	148244074
63	NC_009470	GGCT	2	8	22866	22873	0 %	25 %	50 %	25 %	148244074
64	NC_009470	CCTG	2	8	23061	23068	0 %	25 %	25 %	50 %	148244075
65	NC_009470	CCGC	2	8	23146	23153	0 %	0 %	25 %	75 %	148244075
66	NC_009470	CACC	2	8	23490	23497	25 %	0 %	0 %	75 %	148244076
67	NC_009470	GGCT	2	8	23585	23592	0 %	25 %	50 %	25 %	148244076
68	NC_009470	CAAC	2	8	23877	23884	50 %	0 %	0 %	50 %	148244076
69	NC_009470	CATG	2	8	24401	24408	25 %	25 %	25 %	25 %	148244077
70	NC_009470	GCCT	2	8	24416	24423	0 %	25 %	25 %	50 %	148244077
71	NC_009470	CGAT	2	8	24708	24715	25 %	25 %	25 %	25 %	148244077
72	NC_009470	CCGC	2	8	25137	25144	0 %	0 %	25 %	75 %	148244077
73	NC_009470	GCTG	2	8	25355	25362	0 %	25 %	50 %	25 %	148244077
74	NC_009470	CCGG	2	8	25565	25572	0 %	0 %	50 %	50 %	148244077
75	NC_009470	TTGC	2	8	26166	26173	0 %	50 %	25 %	25 %	148244078
76	NC_009470	AATC	2	8	26648	26655	50 %	25 %	0 %	25 %	148244079
77	NC_009470	GCCG	2	8	27293	27300	0 %	0 %	50 %	50 %	148244080
78	NC_009470	CGGT	2	8	27591	27598	0 %	25 %	50 %	25 %	148244080
79	NC_009470	CCGC	2	8	27999	28006	0 %	0 %	25 %	75 %	148244080
80	NC_009470	CCGC	2	8	28084	28091	0 %	0 %	25 %	75 %	148244080
81	NC_009470	CATG	2	8	29306	29313	25 %	25 %	25 %	25 %	148244081
82	NC_009470	GGGC	2	8	30808	30815	0 %	0 %	75 %	25 %	148244082
83	NC_009470	CTGC	2	8	30955	30962	0 %	25 %	25 %	50 %	148244082
84	NC_009470	CGGC	2	8	31043	31050	0 %	0 %	50 %	50 %	148244082
85	NC_009470	GACG	2	8	31214	31221	25 %	0 %	50 %	25 %	148244083
86	NC_009470	CAGC	2	8	31469	31476	25 %	0 %	25 %	50 %	148244083
87	NC_009470	CAGG	2	8	31759	31766	25 %	0 %	50 %	25 %	148244083
88	NC_009470	CTGC	2	8	31947	31954	0 %	25 %	25 %	50 %	148244083
89	NC_009470	GAGG	2	8	31964	31971	25 %	0 %	75 %	0 %	148244083
90	NC_009470	TCCA	2	8	32305	32312	25 %	25 %	0 %	50 %	148244083
91	NC_009470	TCAG	2	8	32323	32330	25 %	25 %	25 %	25 %	148244083
92	NC_009470	GCCA	2	8	32460	32467	25 %	0 %	25 %	50 %	148244084
93	NC_009470	CGGG	2	8	32539	32546	0 %	0 %	75 %	25 %	148244084
94	NC_009470	CACT	2	8	33762	33769	25 %	25 %	0 %	50 %	148244085
95	NC_009470	CGAC	2	8	33997	34004	25 %	0 %	25 %	50 %	148244085
96	NC_009470	GCCT	2	8	34007	34014	0 %	25 %	25 %	50 %	148244085
97	NC_009470	AGGG	2	8	34107	34114	25 %	0 %	75 %	0 %	148244085
98	NC_009470	CTGC	2	8	34989	34996	0 %	25 %	25 %	50 %	148244086
99	NC_009470	TTCT	2	8	35868	35875	0 %	75 %	0 %	25 %	148244087
100	NC_009470	GAGC	2	8	36039	36046	25 %	0 %	50 %	25 %	148244087
101	NC_009470	ACTT	2	8	36049	36056	25 %	50 %	0 %	25 %	148244087
102	NC_009470	CTTC	2	8	36126	36133	0 %	50 %	0 %	50 %	148244087

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.