MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY03

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009469	CGAGGC	2	12	4644	4655	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148243982
2	NC_009469	GCAGTG	2	12	7632	7643	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243985
3	NC_009469	GCGAGT	2	12	14979	14990	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243991
4	NC_009469	TCTCGA	2	12	15930	15941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148243992
5	NC_009469	CCTCGG	2	12	17460	17471	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243993
6	NC_009469	TGCCGC	2	12	17799	17810	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243993
7	NC_009469	CGTCAT	2	12	21201	21212	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148243994
8	NC_009469	GGCGCG	2	12	23816	23827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243996
9	NC_009469	CCGGCA	2	12	24784	24795	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148243998
10	NC_009469	CAACCT	2	12	25421	25432	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148243998
11	NC_009469	CGGTGG	2	12	27112	27123	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148243999
12	NC_009469	CGGCTG	2	12	27949	27960	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148243999
13	NC_009469	GGGGCT	2	12	28554	28565	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148243999
14	NC_009469	GATCGA	2	12	29096	29107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148244000
15	NC_009469	GATATA	2	12	29375	29386	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148244000
16	NC_009469	AGATCG	2	12	31955	31966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148244002
17	NC_009469	GCCGGC	2	12	31986	31997	0 %	0 %	50 %	50 %	148244002
18	NC_009469	CCGGAA	2	12	34391	34402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244005
19	NC_009469	CGACGG	2	12	36833	36844	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148244007
20	NC_009469	CTGCGC	2	12	37479	37490	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148244007
21	NC_009469	CTTGCC	2	12	40933	40944	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148244011
22	NC_009469	CCTTCG	2	12	44947	44958	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148244014
23	NC_009469	TCCCCC	2	12	46216	46227	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	148244016
24	NC_009469	GCCGAA	2	12	48880	48891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244021
25	NC_009469	GAGCCA	2	12	48954	48965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244021
26	NC_009469	CTGGTG	2	12	52956	52967	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148244025
27	NC_009469	GATCGA	2	12	64299	64310	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148244036
28	NC_009469	ATCGAG	2	12	68938	68949	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148244040
29	NC_009469	ACCCAC	2	12	71279	71290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244043
30	NC_009469	AAATAC	2	12	72928	72939	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148244044
31	NC_009469	TCGGTG	2	12	77639	77650	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148244046
32	NC_009469	CATCCT	2	12	79854	79865	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148244046

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.