MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY03

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009469	TGCGG	2	10	3455	3464	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009469	CGGTG	2	10	4147	4156	0 %	20 %	60 %	20 %	148243981
3	NC_009469	TGATC	2	10	5420	5429	20 %	40 %	20 %	20 %	148243983
4	NC_009469	ACATT	2	10	6179	6188	40 %	40 %	0 %	20 %	148243984
5	NC_009469	GCGAT	2	10	6316	6325	20 %	20 %	40 %	20 %	148243984
6	NC_009469	AGCCA	2	10	8665	8674	40 %	0 %	20 %	40 %	148243986
7	NC_009469	CGGCT	2	10	10665	10674	0 %	20 %	40 %	40 %	148243987
8	NC_009469	CTACC	2	10	11286	11295	20 %	20 %	0 %	60 %	148243987
9	NC_009469	TGCCA	2	10	11517	11526	20 %	20 %	20 %	40 %	148243987
10	NC_009469	GCGGT	2	10	12407	12416	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_009469	CCGGC	2	10	14401	14410	0 %	0 %	40 %	60 %	148243990
12	NC_009469	GCCGT	2	10	16244	16253	0 %	20 %	40 %	40 %	148243992
13	NC_009469	TTCCA	2	10	18676	18685	20 %	40 %	0 %	40 %	148243993
14	NC_009469	GGCGG	2	10	20418	20427	0 %	0 %	80 %	20 %	148243994
15	NC_009469	CGGCG	2	10	22541	22550	0 %	0 %	60 %	40 %	148243995
16	NC_009469	TCGGC	2	10	23512	23521	0 %	20 %	40 %	40 %	148243996
17	NC_009469	ATTTT	2	10	24319	24328	20 %	80 %	0 %	0 %	148243997
18	NC_009469	ATCGT	2	10	24492	24501	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009469	CGGCG	2	10	25505	25514	0 %	0 %	60 %	40 %	148243998
20	NC_009469	CGCGG	2	10	26220	26229	0 %	0 %	60 %	40 %	148243999
21	NC_009469	CGCGG	2	10	28066	28075	0 %	0 %	60 %	40 %	148243999
22	NC_009469	GGGCG	2	10	28401	28410	0 %	0 %	80 %	20 %	148243999
23	NC_009469	TCGTG	2	10	29835	29844	0 %	40 %	40 %	20 %	148244002
24	NC_009469	CCCGA	2	10	30788	30797	20 %	0 %	20 %	60 %	148244002
25	NC_009469	GCCAG	2	10	32178	32187	20 %	0 %	40 %	40 %	148244002
26	NC_009469	TACCA	2	10	33439	33448	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009469	GCCAG	2	10	34791	34800	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009469	CGATC	2	10	35268	35277	20 %	20 %	20 %	40 %	148244006
29	NC_009469	GGCCA	2	10	35578	35587	20 %	0 %	40 %	40 %	148244006
30	NC_009469	GGCCG	2	10	37202	37211	0 %	0 %	60 %	40 %	148244007
31	NC_009469	CCGCC	2	10	38077	38086	0 %	0 %	20 %	80 %	148244008
32	NC_009469	CCTGC	2	10	38226	38235	0 %	20 %	20 %	60 %	148244008
33	NC_009469	GCTCG	2	10	38241	38250	0 %	20 %	40 %	40 %	148244008
34	NC_009469	TCCGA	2	10	38444	38453	20 %	20 %	20 %	40 %	148244008
35	NC_009469	GATCG	2	10	39340	39349	20 %	20 %	40 %	20 %	148244009
36	NC_009469	GATCA	2	10	39420	39429	40 %	20 %	20 %	20 %	148244009
37	NC_009469	CGATC	2	10	40217	40226	20 %	20 %	20 %	40 %	148244010
38	NC_009469	TGCGG	2	10	42851	42860	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009469	AACCG	2	10	42886	42895	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_009469	CTGGT	2	10	43690	43699	0 %	40 %	40 %	20 %	148244013
41	NC_009469	CGAGA	2	10	46111	46120	40 %	0 %	40 %	20 %	148244015
42	NC_009469	GGCTT	2	10	46321	46330	0 %	40 %	40 %	20 %	148244016
43	NC_009469	GACAG	2	10	46645	46654	40 %	0 %	40 %	20 %	148244017
44	NC_009469	GTTGA	2	10	49081	49090	20 %	40 %	40 %	0 %	148244021
45	NC_009469	GGGAA	2	10	50455	50464	40 %	0 %	60 %	0 %	148244022
46	NC_009469	TGCGC	2	10	51417	51426	0 %	20 %	40 %	40 %	148244023
47	NC_009469	GGGGC	2	10	53278	53287	0 %	0 %	80 %	20 %	148244026
48	NC_009469	GGGGC	2	10	53584	53593	0 %	0 %	80 %	20 %	148244027
49	NC_009469	AGGGC	2	10	54814	54823	20 %	0 %	60 %	20 %	148244027
50	NC_009469	ATCTC	2	10	57237	57246	20 %	40 %	0 %	40 %	148244029
51	NC_009469	GGCGC	2	10	58652	58661	0 %	0 %	60 %	40 %	148244031
52	NC_009469	CGAAG	2	10	58954	58963	40 %	0 %	40 %	20 %	148244031
53	NC_009469	CTCGC	2	10	60180	60189	0 %	20 %	20 %	60 %	148244032
54	NC_009469	CGGCG	2	10	60257	60266	0 %	0 %	60 %	40 %	148244032
55	NC_009469	GCCGC	2	10	60868	60877	0 %	0 %	40 %	60 %	148244034
56	NC_009469	CCGGC	2	10	60948	60957	0 %	0 %	40 %	60 %	148244034
57	NC_009469	GCTGA	2	10	63054	63063	20 %	20 %	40 %	20 %	148244035
58	NC_009469	CGGCC	2	10	63338	63347	0 %	0 %	40 %	60 %	148244035
59	NC_009469	CGCTG	2	10	63622	63631	0 %	20 %	40 %	40 %	148244035
60	NC_009469	AAAGC	2	10	64278	64287	60 %	0 %	20 %	20 %	148244036
61	NC_009469	CGGCC	2	10	65376	65385	0 %	0 %	40 %	60 %	148244037
62	NC_009469	TGCGC	2	10	65662	65671	0 %	20 %	40 %	40 %	148244038
63	NC_009469	TCCCG	2	10	67427	67436	0 %	20 %	20 %	60 %	148244039
64	NC_009469	GCGCC	2	10	68215	68224	0 %	0 %	40 %	60 %	148244040
65	NC_009469	TCGCC	2	10	68301	68310	0 %	20 %	20 %	60 %	148244040
66	NC_009469	ACCAA	2	10	70684	70693	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009469	AACGG	2	10	72131	72140	40 %	0 %	40 %	20 %	148244043
68	NC_009469	CCCAC	2	10	73158	73167	20 %	0 %	0 %	80 %	148244044
69	NC_009469	ACCCC	2	10	74072	74081	20 %	0 %	0 %	80 %	148244045
70	NC_009469	CGGAT	2	10	74111	74120	20 %	20 %	40 %	20 %	148244045
71	NC_009469	TCGCC	2	10	74577	74586	0 %	20 %	20 %	60 %	148244045
72	NC_009469	CGGCG	2	10	74626	74635	0 %	0 %	60 %	40 %	148244045
73	NC_009469	GCCCG	2	10	75342	75351	0 %	0 %	40 %	60 %	148244045
74	NC_009469	CGCGG	2	10	75843	75852	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
75	NC_009469	AGGGG	2	10	75858	75867	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009469	TGCAG	2	10	75987	75996	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009469	GCCGC	2	10	78570	78579	0 %	0 %	40 %	60 %	148244046
78	NC_009469	GGGCC	2	10	78838	78847	0 %	0 %	60 %	40 %	148244046
79	NC_009469	CGGCG	2	10	79279	79288	0 %	0 %	60 %	40 %	148244046
80	NC_009469	GGCCA	2	10	81276	81285	20 %	0 %	40 %	40 %	148244047
81	NC_009469	CCGAA	2	10	82134	82143	40 %	0 %	20 %	40 %	148244048
82	NC_009469	GGGGC	2	10	82282	82291	0 %	0 %	80 %	20 %	148244048
83	NC_009469	GGGGC	2	10	82393	82402	0 %	0 %	80 %	20 %	148244048
84	NC_009469	GCCCG	2	10	82832	82841	0 %	0 %	40 %	60 %	148244049
85	NC_009469	CCGCG	2	10	83430	83439	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_009469	AAGCT	2	10	84428	84437	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009469	GCCGG	2	10	84925	84934	0 %	0 %	60 %	40 %	148244052
88	NC_009469	GAATT	2	10	84952	84961	40 %	40 %	20 %	0 %	148244052
89	NC_009469	AGGCA	2	10	85985	85994	40 %	0 %	40 %	20 %	148244053
90	NC_009469	CGCTC	2	10	86975	86984	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_009469	AGCTG	2	10	87184	87193	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009469	GCAAG	2	10	87873	87882	40 %	0 %	40 %	20 %	148244054
93	NC_009469	GCAAG	2	10	88041	88050	40 %	0 %	40 %	20 %	148244054

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.