MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY03

Total Repeats: 259

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009469	TTAA	2	8	448	455	50 %	50 %	0 %	0 %	148243978
2	NC_009469	GGCT	2	8	650	657	0 %	25 %	50 %	25 %	148243978
3	NC_009469	CCAC	2	8	932	939	25 %	0 %	0 %	75 %	148243978
4	NC_009469	CCAC	2	8	1389	1396	25 %	0 %	0 %	75 %	148243979
5	NC_009469	ATCT	2	8	2143	2150	25 %	50 %	0 %	25 %	148243979
6	NC_009469	TGAA	2	8	2360	2367	50 %	25 %	25 %	0 %	148243979
7	NC_009469	GAGT	2	8	2586	2593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009469	CGCC	2	8	3296	3303	0 %	0 %	25 %	75 %	148243980
9	NC_009469	CCGA	2	8	3659	3666	25 %	0 %	25 %	50 %	148243981
10	NC_009469	CCGG	2	8	4718	4725	0 %	0 %	50 %	50 %	148243982
11	NC_009469	GGCA	2	8	5467	5474	25 %	0 %	50 %	25 %	148243983
12	NC_009469	GCCG	2	8	6278	6285	0 %	0 %	50 %	50 %	148243984
13	NC_009469	GTGC	2	8	6787	6794	0 %	25 %	50 %	25 %	148243984
14	NC_009469	GATG	2	8	6818	6825	25 %	25 %	50 %	0 %	148243984
15	NC_009469	GCCG	2	8	7204	7211	0 %	0 %	50 %	50 %	148243984
16	NC_009469	GACG	2	8	7469	7476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009469	TGGG	2	8	7570	7577	0 %	25 %	75 %	0 %	148243985
18	NC_009469	CGGC	2	8	8149	8156	0 %	0 %	50 %	50 %	148243985
19	NC_009469	CGTC	2	8	8186	8193	0 %	25 %	25 %	50 %	148243985
20	NC_009469	CGTG	2	8	8647	8654	0 %	25 %	50 %	25 %	148243986
21	NC_009469	GATT	2	8	9811	9818	25 %	50 %	25 %	0 %	148243987
22	NC_009469	TGCT	2	8	9928	9935	0 %	50 %	25 %	25 %	148243987
23	NC_009469	GATC	2	8	10633	10640	25 %	25 %	25 %	25 %	148243987
24	NC_009469	TTGC	2	8	10722	10729	0 %	50 %	25 %	25 %	148243987
25	NC_009469	GCAT	2	8	10730	10737	25 %	25 %	25 %	25 %	148243987
26	NC_009469	AGCC	2	8	11383	11390	25 %	0 %	25 %	50 %	148243987
27	NC_009469	TTCT	2	8	11602	11609	0 %	75 %	0 %	25 %	148243988
28	NC_009469	CGGC	2	8	11831	11838	0 %	0 %	50 %	50 %	148243988
29	NC_009469	GGTT	2	8	11883	11890	0 %	50 %	50 %	0 %	148243988
30	NC_009469	CGAG	2	8	12070	12077	25 %	0 %	50 %	25 %	148243988
31	NC_009469	GGTG	2	8	12089	12096	0 %	25 %	75 %	0 %	148243988
32	NC_009469	TTCG	2	8	12209	12216	0 %	50 %	25 %	25 %	148243988
33	NC_009469	TGAT	2	8	12627	12634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009469	TGAT	2	8	14158	14165	25 %	50 %	25 %	0 %	148243990
35	NC_009469	GGCC	2	8	14317	14324	0 %	0 %	50 %	50 %	148243990
36	NC_009469	TTGC	2	8	14684	14691	0 %	50 %	25 %	25 %	148243991
37	NC_009469	CTGG	2	8	14813	14820	0 %	25 %	50 %	25 %	148243991
38	NC_009469	GCCA	2	8	15066	15073	25 %	0 %	25 %	50 %	148243991
39	NC_009469	GGAT	2	8	15525	15532	25 %	25 %	50 %	0 %	148243992
40	NC_009469	CGAC	2	8	15696	15703	25 %	0 %	25 %	50 %	148243992
41	NC_009469	CGGC	2	8	15996	16003	0 %	0 %	50 %	50 %	148243992
42	NC_009469	GACG	2	8	16065	16072	25 %	0 %	50 %	25 %	148243992
43	NC_009469	CAGC	2	8	16087	16094	25 %	0 %	25 %	50 %	148243992
44	NC_009469	AGGC	2	8	16301	16308	25 %	0 %	50 %	25 %	148243992
45	NC_009469	GTCG	2	8	16497	16504	0 %	25 %	50 %	25 %	148243992
46	NC_009469	TCCG	2	8	16636	16643	0 %	25 %	25 %	50 %	148243992
47	NC_009469	AGGG	2	8	17002	17009	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009469	CCAG	2	8	17018	17025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009469	CGCC	2	8	17055	17062	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_009469	CGGC	2	8	17586	17593	0 %	0 %	50 %	50 %	148243993
51	NC_009469	GGAA	2	8	17612	17619	50 %	0 %	50 %	0 %	148243993
52	NC_009469	CCTT	2	8	18107	18114	0 %	50 %	0 %	50 %	148243993
53	NC_009469	GGTC	2	8	18917	18924	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009469	GTTG	2	8	19186	19193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009469	AATG	2	8	19206	19213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009469	TTCT	2	8	19255	19262	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009469	CATG	2	8	19270	19277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009469	ATCT	2	8	19391	19398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009469	CGGG	2	8	20222	20229	0 %	0 %	75 %	25 %	148243994
60	NC_009469	TCTT	2	8	20366	20373	0 %	75 %	0 %	25 %	148243994
61	NC_009469	CGGG	2	8	20436	20443	0 %	0 %	75 %	25 %	148243994
62	NC_009469	CCGA	2	8	21163	21170	25 %	0 %	25 %	50 %	148243994
63	NC_009469	GCCG	2	8	21234	21241	0 %	0 %	50 %	50 %	148243994
64	NC_009469	GGCG	2	8	21812	21819	0 %	0 %	75 %	25 %	148243995
65	NC_009469	CTGG	2	8	21863	21870	0 %	25 %	50 %	25 %	148243995
66	NC_009469	CTCG	2	8	22328	22335	0 %	25 %	25 %	50 %	148243995
67	NC_009469	AGCG	2	8	22724	22731	25 %	0 %	50 %	25 %	148243995
68	NC_009469	GCAA	2	8	22987	22994	50 %	0 %	25 %	25 %	148243995
69	NC_009469	CGAG	2	8	23347	23354	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009469	CGGC	2	8	23877	23884	0 %	0 %	50 %	50 %	148243996
71	NC_009469	ATTT	2	8	24288	24295	25 %	75 %	0 %	0 %	148243997
72	NC_009469	ATTT	2	8	24360	24367	25 %	75 %	0 %	0 %	148243997
73	NC_009469	CGGC	2	8	24611	24618	0 %	0 %	50 %	50 %	148243998
74	NC_009469	TCGG	2	8	25029	25036	0 %	25 %	50 %	25 %	148243998
75	NC_009469	CGGC	2	8	26349	26356	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
76	NC_009469	CCGG	2	8	26682	26689	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
77	NC_009469	CCGG	2	8	26721	26728	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
78	NC_009469	GCGG	2	8	26952	26959	0 %	0 %	75 %	25 %	148243999
79	NC_009469	GCCG	2	8	27200	27207	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
80	NC_009469	GCGG	2	8	27537	27544	0 %	0 %	75 %	25 %	148243999
81	NC_009469	GTCG	2	8	28452	28459	0 %	25 %	50 %	25 %	148243999
82	NC_009469	CCGA	2	8	29085	29092	25 %	0 %	25 %	50 %	148244000
83	NC_009469	GCTG	2	8	29247	29254	0 %	25 %	50 %	25 %	148244000
84	NC_009469	TGCT	2	8	29565	29572	0 %	50 %	25 %	25 %	148244001
85	NC_009469	GTGG	2	8	29827	29834	0 %	25 %	75 %	0 %	148244002
86	NC_009469	TGAA	2	8	30119	30126	50 %	25 %	25 %	0 %	148244002
87	NC_009469	CCAG	2	8	30204	30211	25 %	0 %	25 %	50 %	148244002
88	NC_009469	CGGC	2	8	30395	30402	0 %	0 %	50 %	50 %	148244002
89	NC_009469	CCAG	2	8	31239	31246	25 %	0 %	25 %	50 %	148244002
90	NC_009469	CGAA	2	8	31690	31697	50 %	0 %	25 %	25 %	148244002
91	NC_009469	CCGG	2	8	32029	32036	0 %	0 %	50 %	50 %	148244002
92	NC_009469	GATT	2	8	32063	32070	25 %	50 %	25 %	0 %	148244002
93	NC_009469	CTGG	2	8	32194	32201	0 %	25 %	50 %	25 %	148244002
94	NC_009469	CGGT	2	8	32399	32406	0 %	25 %	50 %	25 %	148244002
95	NC_009469	CGGC	2	8	32617	32624	0 %	0 %	50 %	50 %	148244002
96	NC_009469	ACAG	2	8	32711	32718	50 %	0 %	25 %	25 %	148244002
97	NC_009469	TCCC	2	8	32812	32819	0 %	25 %	0 %	75 %	148244003
98	NC_009469	CCTG	2	8	32821	32828	0 %	25 %	25 %	50 %	148244003
99	NC_009469	ATCG	2	8	32963	32970	25 %	25 %	25 %	25 %	148244003
100	NC_009469	CCTG	2	8	33018	33025	0 %	25 %	25 %	50 %	148244003
101	NC_009469	GTCG	2	8	33374	33381	0 %	25 %	50 %	25 %	148244003
102	NC_009469	GGGA	2	8	34835	34842	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009469	CGGC	2	8	35115	35122	0 %	0 %	50 %	50 %	148244006
104	NC_009469	CTTG	2	8	35211	35218	0 %	50 %	25 %	25 %	148244006
105	NC_009469	TGCT	2	8	35375	35382	0 %	50 %	25 %	25 %	148244006
106	NC_009469	ACCG	2	8	35514	35521	25 %	0 %	25 %	50 %	148244006
107	NC_009469	CATC	2	8	35836	35843	25 %	25 %	0 %	50 %	148244006
108	NC_009469	TTAG	2	8	35975	35982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009469	ATCG	2	8	36329	36336	25 %	25 %	25 %	25 %	148244007
110	NC_009469	GGCG	2	8	36596	36603	0 %	0 %	75 %	25 %	148244007
111	NC_009469	CCGC	2	8	38133	38140	0 %	0 %	25 %	75 %	148244008
112	NC_009469	CGCC	2	8	38193	38200	0 %	0 %	25 %	75 %	148244008
113	NC_009469	CCGG	2	8	38469	38476	0 %	0 %	50 %	50 %	148244008
114	NC_009469	CGAG	2	8	38695	38702	25 %	0 %	50 %	25 %	148244009
115	NC_009469	TTCC	2	8	39042	39049	0 %	50 %	0 %	50 %	148244009
116	NC_009469	TCGC	2	8	39637	39644	0 %	25 %	25 %	50 %	148244010
117	NC_009469	GATG	2	8	40184	40191	25 %	25 %	50 %	0 %	148244010
118	NC_009469	GAAG	2	8	41211	41218	50 %	0 %	50 %	0 %	148244011
119	NC_009469	GCTG	2	8	41385	41392	0 %	25 %	50 %	25 %	148244011
120	NC_009469	GGGC	2	8	42059	42066	0 %	0 %	75 %	25 %	148244012
121	NC_009469	TCGG	2	8	42811	42818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009469	GACA	2	8	43262	43269	50 %	0 %	25 %	25 %	148244013
123	NC_009469	CGGC	2	8	43371	43378	0 %	0 %	50 %	50 %	148244013
124	NC_009469	CGCC	2	8	44247	44254	0 %	0 %	25 %	75 %	148244013
125	NC_009469	CGGC	2	8	44313	44320	0 %	0 %	50 %	50 %	148244013
126	NC_009469	GGCA	2	8	44332	44339	25 %	0 %	50 %	25 %	148244013
127	NC_009469	GCCG	2	8	44581	44588	0 %	0 %	50 %	50 %	148244013
128	NC_009469	CGCA	2	8	44720	44727	25 %	0 %	25 %	50 %	148244014
129	NC_009469	TGGC	2	8	45110	45117	0 %	25 %	50 %	25 %	148244014
130	NC_009469	CCCA	2	8	45485	45492	25 %	0 %	0 %	75 %	148244014
131	NC_009469	TGTC	2	8	45831	45838	0 %	50 %	25 %	25 %	148244015
132	NC_009469	CTCG	2	8	45981	45988	0 %	25 %	25 %	50 %	148244015
133	NC_009469	CGCC	2	8	46541	46548	0 %	0 %	25 %	75 %	148244017
134	NC_009469	GCAG	2	8	46602	46609	25 %	0 %	50 %	25 %	148244017
135	NC_009469	GCCG	2	8	46998	47005	0 %	0 %	50 %	50 %	148244017
136	NC_009469	GATC	2	8	47015	47022	25 %	25 %	25 %	25 %	148244017
137	NC_009469	ACGC	2	8	47087	47094	25 %	0 %	25 %	50 %	148244017
138	NC_009469	GCCG	2	8	47109	47116	0 %	0 %	50 %	50 %	148244017
139	NC_009469	ATCG	2	8	47927	47934	25 %	25 %	25 %	25 %	148244019
140	NC_009469	AGCG	2	8	48063	48070	25 %	0 %	50 %	25 %	148244019
141	NC_009469	TTTC	2	8	48176	48183	0 %	75 %	0 %	25 %	148244019
142	NC_009469	CCGC	2	8	48561	48568	0 %	0 %	25 %	75 %	148244020
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.