MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY03

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009469	CG	4	8	334	341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009469	CG	3	6	494	499	0 %	0 %	50 %	50 %	148243978
3	NC_009469	CG	3	6	1998	2003	0 %	0 %	50 %	50 %	148243979
4	NC_009469	AT	3	6	2552	2557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009469	GC	3	6	2877	2882	0 %	0 %	50 %	50 %	148243980
6	NC_009469	GC	3	6	3350	3355	0 %	0 %	50 %	50 %	148243980
7	NC_009469	AG	3	6	3827	3832	50 %	0 %	50 %	0 %	148243981
8	NC_009469	AC	3	6	4311	4316	50 %	0 %	0 %	50 %	148243982
9	NC_009469	GC	3	6	4404	4409	0 %	0 %	50 %	50 %	148243982
10	NC_009469	TC	3	6	4701	4706	0 %	50 %	0 %	50 %	148243982
11	NC_009469	GC	3	6	5063	5068	0 %	0 %	50 %	50 %	148243982
12	NC_009469	CG	3	6	5400	5405	0 %	0 %	50 %	50 %	148243983
13	NC_009469	CG	4	8	5675	5682	0 %	0 %	50 %	50 %	148243983
14	NC_009469	GC	3	6	6011	6016	0 %	0 %	50 %	50 %	148243983
15	NC_009469	CT	3	6	6412	6417	0 %	50 %	0 %	50 %	148243984
16	NC_009469	TC	3	6	6467	6472	0 %	50 %	0 %	50 %	148243984
17	NC_009469	CA	3	6	6796	6801	50 %	0 %	0 %	50 %	148243984
18	NC_009469	GC	3	6	7064	7069	0 %	0 %	50 %	50 %	148243984
19	NC_009469	TA	3	6	7492	7497	50 %	50 %	0 %	0 %	148243985
20	NC_009469	GA	3	6	8237	8242	50 %	0 %	50 %	0 %	148243985
21	NC_009469	CG	3	6	8546	8551	0 %	0 %	50 %	50 %	148243986
22	NC_009469	CG	3	6	8855	8860	0 %	0 %	50 %	50 %	148243986
23	NC_009469	GC	3	6	9565	9570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009469	TA	3	6	9590	9595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009469	GT	3	6	11403	11408	0 %	50 %	50 %	0 %	148243987
26	NC_009469	AC	3	6	12175	12180	50 %	0 %	0 %	50 %	148243988
27	NC_009469	AG	3	6	12284	12289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009469	GT	3	6	12777	12782	0 %	50 %	50 %	0 %	148243989
29	NC_009469	GC	3	6	12830	12835	0 %	0 %	50 %	50 %	148243989
30	NC_009469	TC	3	6	13746	13751	0 %	50 %	0 %	50 %	148243990
31	NC_009469	CG	3	6	14051	14056	0 %	0 %	50 %	50 %	148243990
32	NC_009469	GC	4	8	15007	15014	0 %	0 %	50 %	50 %	148243991
33	NC_009469	CG	3	6	15350	15355	0 %	0 %	50 %	50 %	148243991
34	NC_009469	GC	4	8	15567	15574	0 %	0 %	50 %	50 %	148243992
35	NC_009469	CG	3	6	15734	15739	0 %	0 %	50 %	50 %	148243992
36	NC_009469	CG	3	6	15816	15821	0 %	0 %	50 %	50 %	148243992
37	NC_009469	GC	3	6	16258	16263	0 %	0 %	50 %	50 %	148243992
38	NC_009469	GC	3	6	17809	17814	0 %	0 %	50 %	50 %	148243993
39	NC_009469	GT	3	6	18088	18093	0 %	50 %	50 %	0 %	148243993
40	NC_009469	CG	3	6	18396	18401	0 %	0 %	50 %	50 %	148243993
41	NC_009469	GC	3	6	18647	18652	0 %	0 %	50 %	50 %	148243993
42	NC_009469	CG	3	6	18969	18974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009469	GC	3	6	19979	19984	0 %	0 %	50 %	50 %	148243994
44	NC_009469	GC	3	6	20055	20060	0 %	0 %	50 %	50 %	148243994
45	NC_009469	TC	3	6	20958	20963	0 %	50 %	0 %	50 %	148243994
46	NC_009469	CG	3	6	21360	21365	0 %	0 %	50 %	50 %	148243995
47	NC_009469	GC	3	6	21606	21611	0 %	0 %	50 %	50 %	148243995
48	NC_009469	CG	4	8	22562	22569	0 %	0 %	50 %	50 %	148243995
49	NC_009469	GC	3	6	22603	22608	0 %	0 %	50 %	50 %	148243995
50	NC_009469	GC	3	6	22917	22922	0 %	0 %	50 %	50 %	148243995
51	NC_009469	GC	3	6	23011	23016	0 %	0 %	50 %	50 %	148243995
52	NC_009469	TC	3	6	23144	23149	0 %	50 %	0 %	50 %	148243995
53	NC_009469	CG	3	6	23687	23692	0 %	0 %	50 %	50 %	148243996
54	NC_009469	AT	3	6	24992	24997	50 %	50 %	0 %	0 %	148243998
55	NC_009469	GA	3	6	25892	25897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009469	GC	3	6	26053	26058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009469	CG	3	6	26137	26142	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
58	NC_009469	GC	3	6	26283	26288	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
59	NC_009469	CG	3	6	26694	26699	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
60	NC_009469	GC	4	8	26805	26812	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
61	NC_009469	GC	4	8	26922	26929	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
62	NC_009469	CG	4	8	27096	27103	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
63	NC_009469	GC	3	6	27155	27160	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
64	NC_009469	CG	3	6	27220	27225	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
65	NC_009469	CG	3	6	27555	27560	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
66	NC_009469	CG	3	6	27601	27606	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
67	NC_009469	GC	3	6	27914	27919	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
68	NC_009469	GC	3	6	28329	28334	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
69	NC_009469	CG	3	6	28422	28427	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
70	NC_009469	GC	3	6	28428	28433	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
71	NC_009469	CG	3	6	28572	28577	0 %	0 %	50 %	50 %	148243999
72	NC_009469	CG	3	6	29036	29041	0 %	0 %	50 %	50 %	148244000
73	NC_009469	AT	3	6	29366	29371	50 %	50 %	0 %	0 %	148244000
74	NC_009469	GT	3	6	29467	29472	0 %	50 %	50 %	0 %	148244001
75	NC_009469	GC	3	6	29692	29697	0 %	0 %	50 %	50 %	148244001
76	NC_009469	GA	3	6	29948	29953	50 %	0 %	50 %	0 %	148244002
77	NC_009469	GT	3	6	30021	30026	0 %	50 %	50 %	0 %	148244002
78	NC_009469	GA	3	6	30671	30676	50 %	0 %	50 %	0 %	148244002
79	NC_009469	AG	3	6	30798	30803	50 %	0 %	50 %	0 %	148244002
80	NC_009469	GC	3	6	31550	31555	0 %	0 %	50 %	50 %	148244002
81	NC_009469	CG	3	6	31567	31572	0 %	0 %	50 %	50 %	148244002
82	NC_009469	GC	4	8	31784	31791	0 %	0 %	50 %	50 %	148244002
83	NC_009469	CG	3	6	32082	32087	0 %	0 %	50 %	50 %	148244002
84	NC_009469	GC	4	8	32287	32294	0 %	0 %	50 %	50 %	148244002
85	NC_009469	CG	3	6	32451	32456	0 %	0 %	50 %	50 %	148244002
86	NC_009469	TG	3	6	32564	32569	0 %	50 %	50 %	0 %	148244002
87	NC_009469	AG	3	6	32859	32864	50 %	0 %	50 %	0 %	148244003
88	NC_009469	CG	3	6	33543	33548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009469	TA	3	6	34592	34597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009469	GC	3	6	35061	35066	0 %	0 %	50 %	50 %	148244006
91	NC_009469	GC	4	8	35421	35428	0 %	0 %	50 %	50 %	148244006
92	NC_009469	CG	3	6	36654	36659	0 %	0 %	50 %	50 %	148244007
93	NC_009469	GC	3	6	36766	36771	0 %	0 %	50 %	50 %	148244007
94	NC_009469	GC	5	10	37098	37107	0 %	0 %	50 %	50 %	148244007
95	NC_009469	GA	3	6	37120	37125	50 %	0 %	50 %	0 %	148244007
96	NC_009469	GC	3	6	37288	37293	0 %	0 %	50 %	50 %	148244007
97	NC_009469	CG	3	6	38164	38169	0 %	0 %	50 %	50 %	148244008
98	NC_009469	CG	3	6	38181	38186	0 %	0 %	50 %	50 %	148244008
99	NC_009469	TC	3	6	38304	38309	0 %	50 %	0 %	50 %	148244008
100	NC_009469	GC	4	8	39372	39379	0 %	0 %	50 %	50 %	148244009
101	NC_009469	CG	3	6	39742	39747	0 %	0 %	50 %	50 %	148244010
102	NC_009469	CG	3	6	39882	39887	0 %	0 %	50 %	50 %	148244010
103	NC_009469	GC	3	6	40551	40556	0 %	0 %	50 %	50 %	148244011
104	NC_009469	AT	3	6	40615	40620	50 %	50 %	0 %	0 %	148244011
105	NC_009469	CG	3	6	40822	40827	0 %	0 %	50 %	50 %	148244011
106	NC_009469	CG	3	6	41008	41013	0 %	0 %	50 %	50 %	148244011
107	NC_009469	CG	3	6	41444	41449	0 %	0 %	50 %	50 %	148244011
108	NC_009469	GC	3	6	41515	41520	0 %	0 %	50 %	50 %	148244011
109	NC_009469	GC	3	6	41845	41850	0 %	0 %	50 %	50 %	148244012
110	NC_009469	CG	3	6	42657	42662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009469	CG	3	6	42769	42774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009469	CG	3	6	43027	43032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009469	GC	4	8	43542	43549	0 %	0 %	50 %	50 %	148244013
114	NC_009469	CG	3	6	43796	43801	0 %	0 %	50 %	50 %	148244013
115	NC_009469	GC	3	6	43977	43982	0 %	0 %	50 %	50 %	148244013
116	NC_009469	GC	3	6	44106	44111	0 %	0 %	50 %	50 %	148244013
117	NC_009469	CG	3	6	44432	44437	0 %	0 %	50 %	50 %	148244013
118	NC_009469	GC	3	6	44532	44537	0 %	0 %	50 %	50 %	148244013
119	NC_009469	CG	3	6	45495	45500	0 %	0 %	50 %	50 %	148244014
120	NC_009469	CG	3	6	45683	45688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009469	AT	3	6	46489	46494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009469	GC	3	6	47122	47127	0 %	0 %	50 %	50 %	148244017
123	NC_009469	GA	3	6	47595	47600	50 %	0 %	50 %	0 %	148244018
124	NC_009469	AT	3	6	48462	48467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009469	AC	3	6	48872	48877	50 %	0 %	0 %	50 %	148244021
126	NC_009469	GC	3	6	49783	49788	0 %	0 %	50 %	50 %	148244022
127	NC_009469	GC	3	6	49964	49969	0 %	0 %	50 %	50 %	148244022
128	NC_009469	TG	3	6	50270	50275	0 %	50 %	50 %	0 %	148244022
129	NC_009469	CG	3	6	50305	50310	0 %	0 %	50 %	50 %	148244022
130	NC_009469	GT	3	6	50730	50735	0 %	50 %	50 %	0 %	148244023
131	NC_009469	CG	3	6	51611	51616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009469	GC	3	6	53184	53189	0 %	0 %	50 %	50 %	148244026
133	NC_009469	CG	3	6	54010	54015	0 %	0 %	50 %	50 %	148244027
134	NC_009469	AG	3	6	54420	54425	50 %	0 %	50 %	0 %	148244027
135	NC_009469	CG	3	6	54542	54547	0 %	0 %	50 %	50 %	148244027
136	NC_009469	GC	3	6	54580	54585	0 %	0 %	50 %	50 %	148244027
137	NC_009469	GC	3	6	54727	54732	0 %	0 %	50 %	50 %	148244027
138	NC_009469	GC	4	8	55055	55062	0 %	0 %	50 %	50 %	148244027
139	NC_009469	GC	4	8	58500	58507	0 %	0 %	50 %	50 %	148244031
140	NC_009469	GC	4	8	59000	59007	0 %	0 %	50 %	50 %	148244031
141	NC_009469	GC	3	6	59518	59523	0 %	0 %	50 %	50 %	148244032
142	NC_009469	CG	3	6	60147	60152	0 %	0 %	50 %	50 %	148244032
143	NC_009469	AT	3	6	60347	60352	50 %	50 %	0 %	0 %	148244032
144	NC_009469	AC	3	6	60392	60397	50 %	0 %	0 %	50 %	148244032
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.