MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY02

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009468	TCGGCC	2	12	739	750	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243808
2	NC_009468	GCGAGC	2	12	8088	8099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148243811
3	NC_009468	CACCTT	2	12	11387	11398	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	148243814
4	NC_009468	CGGCTG	2	12	14353	14364	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009468	CAATCT	2	12	15270	15281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243818
6	NC_009468	TGCGGC	2	12	23883	23894	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148243825
7	NC_009468	GGGAGG	2	12	27290	27301	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	148243829
8	NC_009468	CTGGAT	2	12	28021	28032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148243829
9	NC_009468	ATCCAG	2	12	37791	37802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009468	GTTGGC	2	12	40235	40246	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148243837
11	NC_009468	GCTCAC	2	12	42177	42188	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243839
12	NC_009468	CGCAAG	2	12	42910	42921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243840
13	NC_009468	AAGGCC	2	12	42940	42951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243840
14	NC_009468	CCTGAG	2	12	43675	43686	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009468	CGGCGC	2	12	46755	46766	0 %	0 %	50 %	50 %	148243845
16	NC_009468	CACGGC	2	12	48095	48106	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148243846
17	NC_009468	CGGTCC	2	12	48641	48652	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243847
18	NC_009468	GTGGGT	2	12	50945	50956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243848
19	NC_009468	AATTGG	2	12	52292	52303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243849
20	NC_009468	TGGCGA	2	12	53928	53939	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243851
21	NC_009468	GAGGAT	2	12	54659	54670	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148243852
22	NC_009468	GACGCC	2	12	54734	54745	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148243852
23	NC_009468	CGGCCT	2	12	72211	72222	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243872
24	NC_009468	GGTCGA	2	12	73916	73927	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243873
25	NC_009468	CAGCGG	2	12	76875	76886	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148243876
26	NC_009468	GGCCTC	2	12	77481	77492	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148243877
27	NC_009468	GGCATT	2	12	87478	87489	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148243884
28	NC_009468	GCGCCG	2	12	89206	89217	0 %	0 %	50 %	50 %	148243886
29	NC_009468	TCCTCG	2	12	89457	89468	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148243887
30	NC_009468	GATCGC	2	12	90407	90418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009468	CGGCTA	2	12	91438	91449	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243889
32	NC_009468	GTTGAT	2	12	91901	91912	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148243889
33	NC_009468	ATGTCA	2	12	92487	92498	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148243889
34	NC_009468	CTCCGC	2	12	94215	94226	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	148243891
35	NC_009468	CCTGAT	2	12	97143	97154	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148243893
36	NC_009468	TCTCCG	2	12	98585	98596	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009468	CCTCGA	2	12	104574	104585	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243898
38	NC_009468	CGATCT	2	12	105694	105705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148243899
39	NC_009468	ACCAAC	2	12	106320	106331	50 %	0 %	0 %	50 %	148243900
40	NC_009468	GCTGAC	2	12	109511	109522	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009468	CGCCTA	2	12	110337	110348	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243902
42	NC_009468	GGAGAT	2	12	115275	115286	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148243906
43	NC_009468	TCGAGA	2	12	117964	117975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148243909
44	NC_009468	ACTCGC	2	12	118915	118926	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243910
45	NC_009468	TGTCGT	2	12	126469	126480	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148243918
46	NC_009468	AGACGG	2	12	133278	133289	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009468	CGACCT	2	12	143543	143554	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148243938
48	NC_009468	CCGGCC	2	12	144220	144231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243938
49	NC_009468	GGGCGT	2	12	145849	145860	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148243940
50	NC_009468	GCGGCC	2	12	146025	146036	0 %	0 %	50 %	50 %	148243940
51	NC_009468	CGCCGG	2	12	147457	147468	0 %	0 %	50 %	50 %	148243941
52	NC_009468	CCGGGC	2	12	147489	147500	0 %	0 %	50 %	50 %	148243941
53	NC_009468	CCCCGC	2	12	147785	147796	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	148243942
54	NC_009468	GCGAGG	2	12	153022	153033	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_009468	CAGCCG	2	12	155466	155477	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	148243949
56	NC_009468	AGGCCG	2	12	156549	156560	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148243950
57	NC_009468	AGATCG	2	12	156561	156572	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148243950
58	NC_009468	CCGGCG	2	12	156598	156609	0 %	0 %	50 %	50 %	148243950
59	NC_009468	TCGAGA	2	12	157216	157227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148243950
60	NC_009468	GCCGCG	2	12	158430	158441	0 %	0 %	50 %	50 %	148243950
61	NC_009468	CCGGTG	2	12	163299	163310	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148243954
62	NC_009468	GGTCGA	2	12	163408	163419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243954
63	NC_009468	ACCCGA	2	12	169348	169359	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148243960
64	NC_009468	TCACCC	2	12	170249	170260	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	148243962
65	NC_009468	AGCAGG	2	12	171831	171842	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148243964
66	NC_009468	CGAGAG	2	12	172058	172069	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148243964
67	NC_009468	GATGCC	2	12	173598	173609	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148243966
68	NC_009468	GCGGAT	2	12	173682	173693	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243966
69	NC_009468	CTTTCC	2	12	175568	175579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009468	AGGCCG	2	12	178145	178156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148243969
71	NC_009468	ATCTCG	2	12	181720	181731	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148243972
72	NC_009468	GAGCGT	2	12	182317	182328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243972
73	NC_009468	GAGAAA	2	12	182809	182820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243972

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.