MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY02

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009468	GTGCA	2	10	3253	3262	20 %	20 %	40 %	20 %	148243808
2	NC_009468	CCGGC	2	10	4888	4897	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_009468	ACCCG	2	10	8801	8810	20 %	0 %	20 %	60 %	148243812
4	NC_009468	CTGGT	2	10	10132	10141	0 %	40 %	40 %	20 %	148243813
5	NC_009468	CTTCG	2	10	15846	15855	0 %	40 %	20 %	40 %	148243819
6	NC_009468	TGGGT	2	10	16336	16345	0 %	40 %	60 %	0 %	148243819
7	NC_009468	GGCCG	2	10	17011	17020	0 %	0 %	60 %	40 %	148243820
8	NC_009468	CCTCA	2	10	17667	17676	20 %	20 %	0 %	60 %	148243820
9	NC_009468	GCCTC	2	10	19768	19777	0 %	20 %	20 %	60 %	148243822
10	NC_009468	CTGGC	2	10	21716	21725	0 %	20 %	40 %	40 %	148243823
11	NC_009468	CATAT	2	10	21912	21921	40 %	40 %	0 %	20 %	148243823
12	NC_009468	GTTGG	2	10	22685	22694	0 %	40 %	60 %	0 %	148243824
13	NC_009468	TATCT	2	10	22857	22866	20 %	60 %	0 %	20 %	148243824
14	NC_009468	GCTGA	2	10	24214	24223	20 %	20 %	40 %	20 %	148243825
15	NC_009468	GCGGT	2	10	24428	24437	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009468	GATTG	2	10	26773	26782	20 %	40 %	40 %	0 %	148243829
17	NC_009468	GGCGC	2	10	28241	28250	0 %	0 %	60 %	40 %	148243829
18	NC_009468	CCGAC	2	10	28474	28483	20 %	0 %	20 %	60 %	148243829
19	NC_009468	GGACG	2	10	29177	29186	20 %	0 %	60 %	20 %	148243830
20	NC_009468	GAAAG	2	10	30704	30713	60 %	0 %	40 %	0 %	148243830
21	NC_009468	GGCTT	2	10	33404	33413	0 %	40 %	40 %	20 %	148243834
22	NC_009468	GATGG	2	10	34550	34559	20 %	20 %	60 %	0 %	148243835
23	NC_009468	CGCGC	2	10	38964	38973	0 %	0 %	40 %	60 %	148243836
24	NC_009468	GGATC	2	10	39746	39755	20 %	20 %	40 %	20 %	148243836
25	NC_009468	CCGCG	2	10	40051	40060	0 %	0 %	40 %	60 %	148243836
26	NC_009468	CTGGC	2	10	40148	40157	0 %	20 %	40 %	40 %	148243836
27	NC_009468	GAAGC	2	10	43525	43534	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009468	ATTAT	2	10	43799	43808	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009468	CGGCC	2	10	44177	44186	0 %	0 %	40 %	60 %	148243841
30	NC_009468	TCCGG	2	10	44470	44479	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009468	TCATA	2	10	47022	47031	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009468	CAATT	2	10	47350	47359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009468	TGCTA	2	10	47609	47618	20 %	40 %	20 %	20 %	148243846
34	NC_009468	CCGGG	2	10	49107	49116	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009468	CCGTT	2	10	50095	50104	0 %	40 %	20 %	40 %	148243848
36	NC_009468	CTTTC	2	10	51229	51238	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009468	TGTAT	2	10	59343	59352	20 %	60 %	20 %	0 %	148243859
38	NC_009468	TGATT	2	10	61219	61228	20 %	60 %	20 %	0 %	148243861
39	NC_009468	GCAGA	2	10	61875	61884	40 %	0 %	40 %	20 %	148243862
40	NC_009468	CCGGG	2	10	63622	63631	0 %	0 %	60 %	40 %	148243863
41	NC_009468	ATCCA	2	10	63910	63919	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009468	CGGCG	2	10	66366	66375	0 %	0 %	60 %	40 %	148243864
43	NC_009468	TATGA	2	10	68766	68775	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009468	CCGGC	2	10	69345	69354	0 %	0 %	40 %	60 %	148243868
45	NC_009468	CAGGC	2	10	71337	71346	20 %	0 %	40 %	40 %	148243871
46	NC_009468	ATTTT	2	10	73217	73226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009468	TACAA	2	10	74447	74456	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_009468	GCCGG	2	10	74854	74863	0 %	0 %	60 %	40 %	148243874
49	NC_009468	TCCGC	2	10	76203	76212	0 %	20 %	20 %	60 %	148243875
50	NC_009468	AAAGC	2	10	76865	76874	60 %	0 %	20 %	20 %	148243876
51	NC_009468	TGCTC	2	10	77797	77806	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009468	CGCAT	2	10	78329	78338	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_009468	AATGA	2	10	78818	78827	60 %	20 %	20 %	0 %	148243878
54	NC_009468	TTGCG	2	10	79004	79013	0 %	40 %	40 %	20 %	148243878
55	NC_009468	CCCCG	2	10	79361	79370	0 %	0 %	20 %	80 %	148243878
56	NC_009468	GATGA	2	10	83969	83978	40 %	20 %	40 %	0 %	148243882
57	NC_009468	CCGCG	2	10	84824	84833	0 %	0 %	40 %	60 %	148243883
58	NC_009468	GGCGC	2	10	85409	85418	0 %	0 %	60 %	40 %	148243883
59	NC_009468	TTGCC	2	10	85641	85650	0 %	40 %	20 %	40 %	148243883
60	NC_009468	GGGAA	2	10	86481	86490	40 %	0 %	60 %	0 %	148243883
61	NC_009468	AATGC	2	10	87048	87057	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009468	TAATG	2	10	87864	87873	40 %	40 %	20 %	0 %	148243885
63	NC_009468	ACCCC	2	10	89719	89728	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
64	NC_009468	CTTGG	2	10	92064	92073	0 %	40 %	40 %	20 %	148243889
65	NC_009468	TCGTT	2	10	94234	94243	0 %	60 %	20 %	20 %	148243891
66	NC_009468	TGTTC	2	10	96255	96264	0 %	60 %	20 %	20 %	148243892
67	NC_009468	GGCGA	2	10	97186	97195	20 %	0 %	60 %	20 %	148243893
68	NC_009468	CCCCG	2	10	100487	100496	0 %	0 %	20 %	80 %	148243895
69	NC_009468	GTGCC	2	10	100962	100971	0 %	20 %	40 %	40 %	148243896
70	NC_009468	GGCGG	2	10	101005	101014	0 %	0 %	80 %	20 %	148243896
71	NC_009468	CGCGC	2	10	101027	101036	0 %	0 %	40 %	60 %	148243896
72	NC_009468	TCGTC	2	10	101055	101064	0 %	40 %	20 %	40 %	148243896
73	NC_009468	CGTGC	2	10	102334	102343	0 %	20 %	40 %	40 %	148243896
74	NC_009468	CATTG	2	10	103112	103121	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009468	ACCCA	2	10	106341	106350	40 %	0 %	0 %	60 %	148243900
76	NC_009468	GGGCT	2	10	107893	107902	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009468	ATGCG	2	10	109703	109712	20 %	20 %	40 %	20 %	148243902
78	NC_009468	GCTCT	2	10	110212	110221	0 %	40 %	20 %	40 %	148243902
79	NC_009468	TGGCG	2	10	111456	111465	0 %	20 %	60 %	20 %	148243902
80	NC_009468	ATCAG	2	10	114829	114838	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009468	CAGTC	2	10	115536	115545	20 %	20 %	20 %	40 %	148243906
82	NC_009468	CGTCC	2	10	115657	115666	0 %	20 %	20 %	60 %	148243906
83	NC_009468	TCCGC	2	10	115823	115832	0 %	20 %	20 %	60 %	148243906
84	NC_009468	CCTGA	2	10	115987	115996	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009468	ACGGC	2	10	117652	117661	20 %	0 %	40 %	40 %	148243909
86	NC_009468	ACCGC	2	10	122514	122523	20 %	0 %	20 %	60 %	148243913
87	NC_009468	CGGCG	2	10	124855	124864	0 %	0 %	60 %	40 %	148243916
88	NC_009468	CGGAT	2	10	126354	126363	20 %	20 %	40 %	20 %	148243917
89	NC_009468	ACGGA	2	10	127215	127224	40 %	0 %	40 %	20 %	148243918
90	NC_009468	GCGGA	2	10	129045	129054	20 %	0 %	60 %	20 %	148243921
91	NC_009468	CCGCT	2	10	132118	132127	0 %	20 %	20 %	60 %	148243926
92	NC_009468	TCCGG	2	10	132295	132304	0 %	20 %	40 %	40 %	148243926
93	NC_009468	ATCCG	2	10	132808	132817	20 %	20 %	20 %	40 %	148243927
94	NC_009468	CCGGC	2	10	133116	133125	0 %	0 %	40 %	60 %	148243927
95	NC_009468	GATCG	2	10	136965	136974	20 %	20 %	40 %	20 %	148243931
96	NC_009468	ATAAC	2	10	139479	139488	60 %	20 %	0 %	20 %	148243933
97	NC_009468	CCGAA	2	10	139578	139587	40 %	0 %	20 %	40 %	148243933
98	NC_009468	CGCGG	2	10	143975	143984	0 %	0 %	60 %	40 %	148243938
99	NC_009468	GCCGA	2	10	145874	145883	20 %	0 %	40 %	40 %	148243940
100	NC_009468	GAAGG	2	10	146084	146093	40 %	0 %	60 %	0 %	148243940
101	NC_009468	GCGCC	2	10	146227	146236	0 %	0 %	40 %	60 %	148243940
102	NC_009468	CGCGA	2	10	146733	146742	20 %	0 %	40 %	40 %	148243941
103	NC_009468	CCGAC	2	10	147346	147355	20 %	0 %	20 %	60 %	148243941
104	NC_009468	TCGCC	2	10	148107	148116	0 %	20 %	20 %	60 %	148243942
105	NC_009468	GCCCT	2	10	148435	148444	0 %	20 %	20 %	60 %	148243942
106	NC_009468	CCCAC	2	10	149066	149075	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
107	NC_009468	GACCG	2	10	150025	150034	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009468	ACCAG	2	10	150981	150990	40 %	0 %	20 %	40 %	148243945
109	NC_009468	TCAAT	2	10	151540	151549	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009468	CACAG	2	10	152594	152603	40 %	0 %	20 %	40 %	148243946
111	NC_009468	AGGGG	2	10	152830	152839	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009468	GGCCA	2	10	155480	155489	20 %	0 %	40 %	40 %	148243949
113	NC_009468	GGCCA	2	10	155894	155903	20 %	0 %	40 %	40 %	148243949
114	NC_009468	TCGGC	2	10	157231	157240	0 %	20 %	40 %	40 %	148243950
115	NC_009468	AGGCC	2	10	160530	160539	20 %	0 %	40 %	40 %	148243952
116	NC_009468	ATGGC	2	10	160694	160703	20 %	20 %	40 %	20 %	148243952
117	NC_009468	GATCG	2	10	160915	160924	20 %	20 %	40 %	20 %	148243952
118	NC_009468	GCGCC	2	10	162431	162440	0 %	0 %	40 %	60 %	148243953
119	NC_009468	CTGAG	2	10	163143	163152	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009468	AGGGG	2	10	165369	165378	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009468	GGCAA	2	10	166802	166811	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_009468	GGCGC	2	10	167584	167593	0 %	0 %	60 %	40 %	148243957
123	NC_009468	TAGAA	2	10	167767	167776	60 %	20 %	20 %	0 %	148243958
124	NC_009468	GATCT	2	10	168312	168321	20 %	40 %	20 %	20 %	148243959
125	NC_009468	GCCTG	2	10	169626	169635	0 %	20 %	40 %	40 %	148243961
126	NC_009468	TCCGT	2	10	170903	170912	0 %	40 %	20 %	40 %	148243963
127	NC_009468	GCGAT	2	10	171349	171358	20 %	20 %	40 %	20 %	148243963
128	NC_009468	CGGGG	2	10	171409	171418	0 %	0 %	80 %	20 %	148243963
129	NC_009468	GGCGA	2	10	172568	172577	20 %	0 %	60 %	20 %	148243965
130	NC_009468	AGTGC	2	10	173309	173318	20 %	20 %	40 %	20 %	148243965
131	NC_009468	CGCGG	2	10	174873	174882	0 %	0 %	60 %	40 %	148243967
132	NC_009468	TTACG	2	10	176619	176628	20 %	40 %	20 %	20 %	148243968
133	NC_009468	TATTC	2	10	177103	177112	20 %	60 %	0 %	20 %	148243969
134	NC_009468	TCCAG	2	10	177378	177387	20 %	20 %	20 %	40 %	148243969
135	NC_009468	GGTGA	2	10	177583	177592	20 %	20 %	60 %	0 %	148243969
136	NC_009468	GAGCC	2	10	178127	178136	20 %	0 %	40 %	40 %	148243969
137	NC_009468	CGGCG	2	10	178693	178702	0 %	0 %	60 %	40 %	148243969
138	NC_009468	GCGTG	2	10	184389	184398	0 %	20 %	60 %	20 %	148243974
139	NC_009468	TCCGC	2	10	184594	184603	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_009468	GGTCG	2	10	184909	184918	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009468	TGTCA	2	10	187338	187347	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.