MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY02

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009468	GCCT	2	8	5193	5200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009468	ATCG	2	8	5340	5347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009468	GGCG	2	8	5505	5512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009468	CGGG	2	8	5629	5636	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009468	GCCC	2	8	5754	5761	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_009468	TGCG	2	8	14407	14414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009468	GTGC	2	8	14460	14467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009468	GGTG	2	8	17749	17756	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009468	ATCG	2	8	18412	18419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009468	CGCA	2	8	18959	18966	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009468	CCCT	2	8	20446	20453	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_009468	GCCC	2	8	20560	20567	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_009468	TGGG	2	8	20601	20608	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009468	AGTC	2	8	20830	20837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009468	GGCC	2	8	20961	20968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009468	GACG	2	8	24449	24456	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009468	CGAC	2	8	24527	24534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009468	GCGG	2	8	25137	25144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009468	ACGC	2	8	25691	25698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009468	TCTA	2	8	35581	35588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009468	ATTG	2	8	35650	35657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009468	GCTC	2	8	35773	35780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009468	TCGC	2	8	37105	37112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009468	TTGG	2	8	41630	41637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009468	GGGT	2	8	43743	43750	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009468	GCCC	2	8	46237	46244	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_009468	CGCC	2	8	46299	46306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_009468	CCCT	2	8	46661	46668	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_009468	ATTT	2	8	47382	47389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009468	GGCA	2	8	48944	48951	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009468	CAAA	2	8	49592	49599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009468	GATA	2	8	49769	49776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009468	ATAA	3	12	49819	49830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009468	CTAT	2	8	49839	49846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009468	ATTT	2	8	49863	49870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009468	ATCC	2	8	51050	51057	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009468	CGAG	2	8	51263	51270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009468	AAAG	2	8	52559	52566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009468	GGCC	2	8	52739	52746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009468	GTCC	2	8	52854	52861	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009468	TTGT	2	8	53018	53025	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009468	GGGC	2	8	59852	59859	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009468	AGGG	2	8	64125	64132	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009468	GGTC	2	8	64855	64862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009468	ATCT	2	8	65391	65398	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009468	GCCC	2	8	67070	67077	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_009468	GATC	2	8	70511	70518	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009468	CGGC	2	8	70547	70554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009468	AGCC	2	8	70558	70565	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009468	TGAT	2	8	76980	76987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009468	GGCT	2	8	77089	77096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009468	TCGG	2	8	78231	78238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009468	ATTC	2	8	78522	78529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009468	GTAG	2	8	78663	78670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009468	GCTT	2	8	81597	81604	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009468	GCCG	2	8	89294	89301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009468	GCCC	2	8	89388	89395	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_009468	CTCC	2	8	89707	89714	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_009468	AAGG	2	8	89967	89974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009468	TGGC	2	8	93862	93869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009468	TCGG	2	8	93929	93936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009468	CCCT	2	8	94064	94071	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_009468	CTTG	2	8	94779	94786	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009468	CTGC	2	8	96974	96981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009468	CAGC	2	8	97039	97046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009468	GGCC	2	8	97612	97619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009468	GCCA	2	8	97730	97737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009468	GCCG	2	8	98516	98523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009468	CGGC	2	8	98570	98577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009468	CGGA	2	8	98645	98652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009468	AGCC	2	8	99071	99078	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009468	ATCA	2	8	102975	102982	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009468	CGCA	2	8	103073	103080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009468	TGGA	2	8	107767	107774	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009468	TGGC	2	8	107877	107884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009468	GAAG	2	8	108246	108253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009468	CGAC	2	8	108433	108440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009468	TCGC	2	8	108559	108566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009468	TGGC	2	8	108581	108588	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009468	TCAG	2	8	109242	109249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009468	CCGA	2	8	109415	109422	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009468	AGGC	2	8	112512	112519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009468	CGTC	2	8	114086	114093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009468	CCAA	2	8	114285	114292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009468	TAGC	2	8	114421	114428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009468	CCAA	2	8	114701	114708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009468	CAAC	2	8	116015	116022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009468	GGCG	2	8	116843	116850	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009468	TCCC	2	8	116895	116902	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_009468	TCAG	2	8	119733	119740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009468	CCGA	2	8	119906	119913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009468	TCGA	2	8	121488	121495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009468	CTTG	2	8	121867	121874	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009468	TCAC	2	8	121927	121934	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009468	GCAG	2	8	129337	129344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009468	GACA	2	8	129413	129420	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009468	CCTG	2	8	130270	130277	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009468	CACT	2	8	131595	131602	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009468	TATC	2	8	131684	131691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009468	TGCA	2	8	137746	137753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009468	CATT	2	8	137811	137818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009468	AGGG	2	8	138534	138541	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009468	GACC	2	8	139772	139779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009468	CAGG	2	8	144328	144335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009468	TATT	2	8	145150	145157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009468	TTTG	2	8	145180	145187	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009468	CTGG	2	8	145402	145409	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009468	ACCG	2	8	147683	147690	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009468	CACC	2	8	150601	150608	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
110	NC_009468	GGCC	2	8	150614	150621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009468	CGCC	2	8	151491	151498	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_009468	AGAC	2	8	151565	151572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009468	GCAC	2	8	151666	151673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009468	AATT	2	8	151787	151794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009468	GGCC	2	8	152754	152761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009468	GGGC	2	8	154465	154472	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009468	CCGA	2	8	154616	154623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009468	GCCG	2	8	155339	155346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009468	CCTG	2	8	156521	156528	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009468	ATTT	2	8	159801	159808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009468	CCGA	2	8	163132	163139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009468	GGCG	2	8	165406	165413	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009468	CGGA	2	8	165503	165510	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009468	ATCC	2	8	166831	166838	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009468	CCAA	2	8	167067	167074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009468	TCGT	2	8	169860	169867	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009468	TCGA	2	8	170072	170079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009468	ATCC	2	8	170674	170681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009468	TACA	2	8	170858	170865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009468	CGGG	2	8	174299	174306	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009468	CATA	2	8	175612	175619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009468	ATTC	2	8	175637	175644	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009468	AATA	2	8	175713	175720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009468	ATGC	2	8	178993	179000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009468	GCGG	2	8	180067	180074	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009468	GGTT	2	8	181060	181067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009468	AGGA	2	8	184767	184774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009468	GAGC	2	8	184784	184791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009468	GTTC	2	8	187258	187265	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.