MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY01

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009467	ACGAA	2	10	18033	18042	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009467	TCCTA	2	10	20713	20722	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009467	GAGTG	2	10	27706	27715	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009467	GTCTT	2	10	35355	35364	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009467	GTTCG	2	10	47314	47323	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009467	TACCG	2	10	47875	47884	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009467	CTCAC	2	10	51507	51516	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_009467	CGGCG	2	10	52253	52262	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009467	TTCTG	2	10	55424	55433	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009467	TAGGA	2	10	63779	63788	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009467	GGCAT	2	10	65787	65796	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_009467	CGGTG	2	10	68696	68705	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009467	CGGAT	2	10	79845	79854	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009467	TGGTG	2	10	85686	85695	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009467	CACAT	2	10	85871	85880	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_009467	CCTGG	2	10	92243	92252	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_009467	AGAAT	2	10	96060	96069	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009467	GTGAG	2	10	101297	101306	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009467	GTTTC	2	10	105274	105283	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009467	AAATA	2	10	110794	110803	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009467	GTGGC	2	10	112433	112442	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009467	GGCGC	2	10	114850	114859	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_009467	GATCG	2	10	125483	125492	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009467	TGCGG	2	10	131158	131167	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_009467	CGCGC	2	10	131182	131191	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009467	TTGCC	2	10	133164	133173	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_009467	ATGCC	2	10	137594	137603	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_009467	CCGCG	2	10	146283	146292	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_009467	GTCTG	2	10	158208	158217	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_009467	ACGCA	2	10	162921	162930	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009467	TATTC	2	10	167476	167485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009467	TATAT	2	10	167528	167537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009467	ACCAA	2	10	172731	172740	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_009467	TCCCA	2	10	172846	172855	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_009467	GCCGG	2	10	172947	172956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_009467	AAGCT	2	10	173917	173926	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009467	CGCAT	2	10	174471	174480	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009467	TGCGG	2	10	179969	179978	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009467	AACCG	2	10	180004	180013	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_009467	TTCCT	2	10	193621	193630	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009467	CGGTC	2	10	193702	193711	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_009467	AGGAG	2	10	195234	195243	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009467	TGAGG	2	10	202063	202072	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.