MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY01

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009467	GGGC	2	8	118	125	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009467	AGCG	2	8	9826	9833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009467	GAGG	2	8	9855	9862	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009467	CTGG	2	8	11578	11585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009467	CGAA	2	8	11608	11615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009467	CCTG	2	8	11632	11639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009467	CTGG	2	8	11660	11667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009467	GCTC	2	8	11818	11825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009467	ACCC	2	8	11865	11872	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_009467	GGGC	2	8	15250	15257	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009467	ATGC	2	8	15342	15349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009467	GGGA	2	8	16677	16684	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009467	TGTC	2	8	16897	16904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009467	ATCG	2	8	16939	16946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009467	GGAC	2	8	17234	17241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009467	TGTC	2	8	17871	17878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009467	ACCC	2	8	20075	20082	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_009467	CAAT	2	8	20499	20506	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009467	ATTC	2	8	20668	20675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009467	GATT	2	8	21345	21352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009467	GCCC	2	8	21609	21616	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_009467	TCGC	2	8	22086	22093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009467	CGTA	2	8	22159	22166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009467	CGGA	2	8	25612	25619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009467	CGAT	2	8	25657	25664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009467	ACTC	2	8	35399	35406	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009467	CGAG	2	8	35424	35431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009467	TCCG	2	8	46086	46093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009467	CCCG	2	8	47782	47789	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_009467	CGCT	2	8	47850	47857	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009467	CCCA	2	8	51449	51456	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_009467	CGGC	2	8	51545	51552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009467	CTGT	2	8	51561	51568	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009467	GGGC	2	8	52185	52192	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009467	GGCG	2	8	52370	52377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009467	AGCG	2	8	53015	53022	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009467	AGAC	2	8	54832	54839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009467	GGGC	2	8	58386	58393	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009467	TGGA	2	8	59773	59780	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009467	TGGC	2	8	59883	59890	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009467	GAAG	2	8	60246	60253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009467	GCGA	2	8	62363	62370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009467	GCCT	2	8	62678	62685	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009467	GGGC	2	8	62885	62892	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009467	AATC	2	8	63149	63156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009467	GATT	2	8	63994	64001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009467	TGAT	2	8	64262	64269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009467	CGGG	2	8	64697	64704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009467	CGTC	2	8	69700	69707	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009467	CGCC	2	8	69748	69755	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_009467	CCGG	2	8	70077	70084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009467	TGGC	2	8	70433	70440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009467	CGGC	2	8	72936	72943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009467	CCGA	2	8	73772	73779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009467	CTCG	2	8	73834	73841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009467	GGCG	2	8	79829	79836	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009467	TCCC	2	8	79881	79888	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_009467	AGGT	2	8	80118	80125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009467	GGGA	2	8	82457	82464	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009467	GACG	2	8	83866	83873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009467	GCCC	2	8	85550	85557	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_009467	GGCA	2	8	85598	85605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009467	GCCG	2	8	85630	85637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009467	TGAT	2	8	85640	85647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009467	TCCC	2	8	85958	85965	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_009467	GAAA	2	8	88502	88509	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009467	GGCG	2	8	91191	91198	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009467	CAGC	2	8	91213	91220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009467	GTCG	2	8	92301	92308	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009467	CCGT	2	8	92555	92562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009467	CCTC	2	8	95845	95852	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_009467	CGCT	2	8	95874	95881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009467	GTCT	2	8	96649	96656	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009467	CTTA	2	8	96749	96756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009467	GGGT	2	8	96814	96821	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009467	TGGG	2	8	96857	96864	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009467	CGCT	2	8	99791	99798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009467	CGCC	2	8	100436	100443	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_009467	CGCC	2	8	100620	100627	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_009467	GACA	2	8	101244	101251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009467	GCCG	2	8	101261	101268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009467	TGGG	2	8	101357	101364	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009467	TCGA	2	8	104532	104539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009467	GACA	2	8	105388	105395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009467	GATC	2	8	105920	105927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_009467	CGCA	2	8	106504	106511	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009467	CCGG	2	8	106751	106758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009467	CCGA	2	8	106767	106774	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009467	TATT	2	8	110817	110824	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009467	CGGC	2	8	112202	112209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009467	GATC	2	8	112250	112257	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009467	CTGT	2	8	112268	112275	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009467	GCAA	2	8	112390	112397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009467	TCGA	2	8	124711	124718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009467	ATGG	2	8	124800	124807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009467	CAAA	2	8	125228	125235	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009467	AAAT	2	8	125773	125780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009467	TTGA	2	8	126421	126428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009467	TTCG	2	8	126915	126922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009467	CTTT	2	8	126953	126960	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009467	CGAG	2	8	127022	127029	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009467	CGGG	2	8	127185	127192	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009467	GATC	2	8	128819	128826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009467	CGCA	2	8	128886	128893	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009467	TCCA	2	8	128994	129001	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009467	CAGA	2	8	130348	130355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009467	AAAC	2	8	130858	130865	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009467	AAAT	2	8	130887	130894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009467	GACG	2	8	132978	132985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009467	CGGC	2	8	133444	133451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009467	GGCG	2	8	138233	138240	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009467	TCCG	2	8	138264	138271	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009467	CCAT	2	8	138317	138324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009467	TCCT	2	8	139046	139053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009467	TCAA	2	8	156551	156558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009467	ACCG	2	8	156575	156582	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009467	CAGG	2	8	156653	156660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009467	ATTC	2	8	157523	157530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009467	AGCC	2	8	157533	157540	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009467	GTGG	2	8	157705	157712	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009467	TTGC	2	8	158608	158615	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009467	CTGG	2	8	158737	158744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009467	GCCA	2	8	158990	158997	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009467	GGAT	2	8	159448	159455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009467	AGGG	2	8	161723	161730	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009467	CCAG	2	8	161739	161746	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009467	CGCC	2	8	161776	161783	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_009467	GATC	2	8	162152	162159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009467	GGGA	2	8	162638	162645	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009467	AGGT	2	8	165546	165553	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009467	TAAA	2	8	167863	167870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009467	AGAA	2	8	167982	167989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009467	GATT	2	8	167995	168002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009467	TTGG	2	8	168051	168058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009467	ATGC	2	8	168235	168242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009467	TCAG	2	8	168293	168300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009467	CGTA	2	8	168742	168749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009467	GAAG	2	8	168803	168810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009467	GGCT	2	8	168837	168844	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009467	CCGC	2	8	168928	168935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_009467	ATGA	2	8	169033	169040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009467	TCAA	2	8	170558	170565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009467	TAAT	2	8	172920	172927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009467	TGGC	2	8	172936	172943	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009467	TGAC	2	8	173326	173333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009467	CGGT	2	8	173335	173342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009467	ATGA	2	8	174205	174212	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009467	CGGA	2	8	174399	174406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009467	CCGG	2	8	175587	175594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009467	CGGC	2	8	179849	179856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_009467	TCGG	2	8	179929	179936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009467	TCCA	2	8	180219	180226	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_009467	TGCC	2	8	181961	181968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_009467	ATCA	2	8	182124	182131	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_009467	CTTC	2	8	182145	182152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
156	NC_009467	CGAT	2	8	182663	182670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_009467	GATC	2	8	185135	185142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_009467	CAAA	2	8	186611	186618	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_009467	CCCG	2	8	186712	186719	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
160	NC_009467	TGAC	2	8	186738	186745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_009467	ACCG	2	8	189020	189027	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_009467	CCTG	2	8	189498	189505	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_009467	TGCA	2	8	189660	189667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_009467	CCGG	2	8	189670	189677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_009467	TCTA	2	8	190087	190094	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_009467	GCCG	2	8	190522	190529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
167	NC_009467	TGCC	2	8	195182	195189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
168	NC_009467	CAGA	2	8	200281	200288	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_009467	GCAT	2	8	200307	200314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_009467	GGGC	2	8	200888	200895	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
171	NC_009467	ACCG	3	12	201592	201603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
172	NC_009467	GGCA	2	8	201627	201634	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.