MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009466	TTATTG	2	12	2849	2860	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148245108
2	NC_009466	ATTTTA	2	12	3971	3982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245110
3	NC_009466	CATTTC	2	12	6380	6391	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148245115
4	NC_009466	TTAGTT	2	12	8357	8368	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148245120
5	NC_009466	AGTTTT	2	12	9136	9147	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148245122
6	NC_009466	ATTTTT	2	12	10807	10818	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148245123
7	NC_009466	CATCTG	2	12	13109	13120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148245124
8	NC_009466	ATCTTT	2	12	14287	14298	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148245126
9	NC_009466	TTGCTT	2	12	16454	16465	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148245133
10	NC_009466	ATTTTT	2	12	21925	21936	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148245143
11	NC_009466	TTACCA	2	12	25610	25621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245149
12	NC_009466	TTAACT	2	12	26015	26026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148245149
13	NC_009466	TTAAAT	2	12	26267	26278	50 %	50 %	0 %	0 %	148245149
14	NC_009466	ATTTTT	2	12	27221	27232	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148245150
15	NC_009466	GCATTT	2	12	27782	27793	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148245152
16	NC_009466	TATATC	2	12	28555	28566	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148245152
17	NC_009466	GCTTTA	2	12	32443	32454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148245158
18	NC_009466	TGATTG	2	12	34438	34449	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148245162
19	NC_009466	CACCAT	2	12	34650	34661	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148245162
20	NC_009466	TTCAAA	2	12	37148	37159	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148245163
21	NC_009466	CCAGCT	2	12	44770	44781	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	148245165
22	NC_009466	TTTCTA	2	12	48999	49010	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148245169
23	NC_009466	ATCATT	2	12	49839	49850	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148245171
24	NC_009466	TTTCAC	2	12	50353	50364	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148245173
25	NC_009466	TGCTTT	2	12	51387	51398	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148245174
26	NC_009466	TTTTTG	2	12	52411	52422	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	148245175
27	NC_009466	GTTTAA	2	12	58184	58195	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148245181

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.