MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009466	CTTTT	2	10	2517	2526	0 %	80 %	0 %	20 %	148245108
2	NC_009466	ATTTT	3	15	2910	2924	20 %	80 %	0 %	0 %	148245108
3	NC_009466	ATACC	2	10	3831	3840	40 %	20 %	0 %	40 %	148245110
4	NC_009466	GCACT	2	10	5162	5171	20 %	20 %	20 %	40 %	148245113
5	NC_009466	ATTCT	2	10	6235	6244	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009466	TCAAT	2	10	7561	7570	40 %	40 %	0 %	20 %	148245117
7	NC_009466	TCACC	2	10	8802	8811	20 %	20 %	0 %	60 %	148245122
8	NC_009466	TTTTC	2	10	9878	9887	0 %	80 %	0 %	20 %	148245123
9	NC_009466	TTTTC	2	10	10656	10665	0 %	80 %	0 %	20 %	148245123
10	NC_009466	TATCT	2	10	11098	11107	20 %	60 %	0 %	20 %	148245123
11	NC_009466	TAAAT	2	10	14380	14389	60 %	40 %	0 %	0 %	148245126
12	NC_009466	TTAAT	2	10	14650	14659	40 %	60 %	0 %	0 %	148245127
13	NC_009466	ATTTT	2	10	14753	14762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009466	TTTGC	2	10	15101	15110	0 %	60 %	20 %	20 %	148245129
15	NC_009466	TTATC	2	10	16177	16186	20 %	60 %	0 %	20 %	148245132
16	NC_009466	ATCTT	2	10	16333	16342	20 %	60 %	0 %	20 %	148245132
17	NC_009466	ATTTA	2	10	16346	16355	40 %	60 %	0 %	0 %	148245132
18	NC_009466	ATTTT	2	10	17037	17046	20 %	80 %	0 %	0 %	148245134
19	NC_009466	AACTT	2	10	17494	17503	40 %	40 %	0 %	20 %	148245137
20	NC_009466	AAGAA	2	10	18783	18792	80 %	0 %	20 %	0 %	148245139
21	NC_009466	AAAAG	2	10	20130	20139	80 %	0 %	20 %	0 %	148245141
22	NC_009466	CTTTT	2	10	20540	20549	0 %	80 %	0 %	20 %	148245142
23	NC_009466	GTACG	2	10	21359	21368	20 %	20 %	40 %	20 %	148245142
24	NC_009466	AAATA	2	10	21532	21541	80 %	20 %	0 %	0 %	148245142
25	NC_009466	ATAGA	2	10	22743	22752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009466	TATAA	2	10	22965	22974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009466	ATTAT	2	10	23706	23715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009466	ATAAA	2	10	24507	24516	80 %	20 %	0 %	0 %	148245147
29	NC_009466	ATTTT	2	10	25169	25178	20 %	80 %	0 %	0 %	148245148
30	NC_009466	ATTAT	2	10	27051	27060	40 %	60 %	0 %	0 %	148245150
31	NC_009466	CTCCA	2	10	27856	27865	20 %	20 %	0 %	60 %	148245152
32	NC_009466	AATAC	2	10	28089	28098	60 %	20 %	0 %	20 %	148245152
33	NC_009466	TTTGC	2	10	30132	30141	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009466	ATTTT	2	10	30278	30287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009466	GGTTT	2	10	32000	32009	0 %	60 %	40 %	0 %	148245158
36	NC_009466	AAGTA	2	10	32766	32775	60 %	20 %	20 %	0 %	148245159
37	NC_009466	CCTCA	2	10	33184	33193	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_009466	TCCCT	2	10	34666	34675	0 %	40 %	0 %	60 %	148245162
39	NC_009466	TACCA	2	10	35221	35230	40 %	20 %	0 %	40 %	148245162
40	NC_009466	ATCAC	2	10	35279	35288	40 %	20 %	0 %	40 %	148245162
41	NC_009466	AATCT	2	10	35811	35820	40 %	40 %	0 %	20 %	148245162
42	NC_009466	TCATG	2	10	36081	36090	20 %	40 %	20 %	20 %	148245162
43	NC_009466	AAATC	2	10	36708	36717	60 %	20 %	0 %	20 %	148245162
44	NC_009466	CTTGT	2	10	37565	37574	0 %	60 %	20 %	20 %	148245163
45	NC_009466	TAATG	2	10	38855	38864	40 %	40 %	20 %	0 %	148245164
46	NC_009466	ACTAT	2	10	39088	39097	40 %	40 %	0 %	20 %	148245165
47	NC_009466	AATTG	2	10	40153	40162	40 %	40 %	20 %	0 %	148245165
48	NC_009466	TCCAG	2	10	41851	41860	20 %	20 %	20 %	40 %	148245165
49	NC_009466	TTTTG	2	10	41951	41960	0 %	80 %	20 %	0 %	148245165
50	NC_009466	AGTTA	2	10	42339	42348	40 %	40 %	20 %	0 %	148245165
51	NC_009466	TTTTG	2	10	43158	43167	0 %	80 %	20 %	0 %	148245165
52	NC_009466	TTACT	2	10	43781	43790	20 %	60 %	0 %	20 %	148245165
53	NC_009466	TTTCA	2	10	44325	44334	20 %	60 %	0 %	20 %	148245165
54	NC_009466	GTCTG	2	10	44611	44620	0 %	40 %	40 %	20 %	148245165
55	NC_009466	AGCCA	2	10	44895	44904	40 %	0 %	20 %	40 %	148245165
56	NC_009466	TTCCA	2	10	45681	45690	20 %	40 %	0 %	40 %	148245165
57	NC_009466	TGTAT	2	10	46132	46141	20 %	60 %	20 %	0 %	148245165
58	NC_009466	AATCA	2	10	46958	46967	60 %	20 %	0 %	20 %	148245166
59	NC_009466	TAAAA	2	10	47177	47186	80 %	20 %	0 %	0 %	148245166
60	NC_009466	CTTCT	2	10	47292	47301	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_009466	TTTAA	2	10	47824	47833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009466	GCTGT	2	10	48310	48319	0 %	40 %	40 %	20 %	148245168
63	NC_009466	AATAT	2	10	48985	48994	60 %	40 %	0 %	0 %	148245169
64	NC_009466	AAAAC	2	10	50560	50569	80 %	0 %	0 %	20 %	148245174
65	NC_009466	TTCTG	2	10	51475	51484	0 %	60 %	20 %	20 %	148245174
66	NC_009466	TTTCA	2	10	51654	51663	20 %	60 %	0 %	20 %	148245174
67	NC_009466	AGTCA	2	10	54076	54085	40 %	20 %	20 %	20 %	148245177
68	NC_009466	ATAAA	2	10	54162	54171	80 %	20 %	0 %	0 %	148245177
69	NC_009466	TTTAA	2	10	55136	55145	40 %	60 %	0 %	0 %	148245177
70	NC_009466	AAATC	2	10	55758	55767	60 %	20 %	0 %	20 %	148245177
71	NC_009466	GCCTT	2	10	58057	58066	0 %	40 %	20 %	40 %	148245181
72	NC_009466	GCCTT	2	10	58705	58714	0 %	40 %	20 %	40 %	148245182

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.