MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009466	TTTA	2	8	51	58	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009466	ACTA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009466	ACGT	2	8	245	252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009466	ATCA	2	8	1030	1037	50 %	25 %	0 %	25 %	148245108
5	NC_009466	TTTA	2	8	1051	1058	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
6	NC_009466	TAAT	2	8	1395	1402	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
7	NC_009466	AATT	2	8	1512	1519	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
8	NC_009466	CAAA	2	8	1602	1609	75 %	0 %	0 %	25 %	148245108
9	NC_009466	TTAT	2	8	1637	1644	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
10	NC_009466	TAAA	2	8	1777	1784	75 %	25 %	0 %	0 %	148245108
11	NC_009466	ATTT	2	8	1809	1816	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
12	NC_009466	ATTT	2	8	2121	2128	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
13	NC_009466	CCAG	2	8	2187	2194	25 %	0 %	25 %	50 %	148245108
14	NC_009466	CTTT	2	8	2478	2485	0 %	75 %	0 %	25 %	148245108
15	NC_009466	TGGA	2	8	2896	2903	25 %	25 %	50 %	0 %	148245108
16	NC_009466	ACTG	2	8	3784	3791	25 %	25 %	25 %	25 %	148245110
17	NC_009466	ATTC	2	8	3921	3928	25 %	50 %	0 %	25 %	148245110
18	NC_009466	TTTA	2	8	4168	4175	25 %	75 %	0 %	0 %	148245111
19	NC_009466	TTCT	2	8	4183	4190	0 %	75 %	0 %	25 %	148245111
20	NC_009466	ATTT	2	8	4258	4265	25 %	75 %	0 %	0 %	148245111
21	NC_009466	TTAT	2	8	4457	4464	25 %	75 %	0 %	0 %	148245111
22	NC_009466	TTGC	2	8	4672	4679	0 %	50 %	25 %	25 %	148245112
23	NC_009466	ATTT	2	8	4696	4703	25 %	75 %	0 %	0 %	148245112
24	NC_009466	AAAT	2	8	5216	5223	75 %	25 %	0 %	0 %	148245113
25	NC_009466	TAAT	2	8	5610	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009466	TTTG	2	8	5828	5835	0 %	75 %	25 %	0 %	148245114
27	NC_009466	ACCT	2	8	5928	5935	25 %	25 %	0 %	50 %	148245114
28	NC_009466	ACCC	2	8	6789	6796	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_009466	TTCT	2	8	6878	6885	0 %	75 %	0 %	25 %	148245116
30	NC_009466	TCCT	2	8	7105	7112	0 %	50 %	0 %	50 %	148245116
31	NC_009466	AAAT	2	8	7396	7403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009466	ATTT	2	8	7424	7431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009466	AAAT	2	8	7539	7546	75 %	25 %	0 %	0 %	148245117
34	NC_009466	GCCT	2	8	8773	8780	0 %	25 %	25 %	50 %	148245121
35	NC_009466	TTAT	2	8	9158	9165	25 %	75 %	0 %	0 %	148245122
36	NC_009466	ACCT	2	8	9381	9388	25 %	25 %	0 %	50 %	148245123
37	NC_009466	AATA	2	8	9508	9515	75 %	25 %	0 %	0 %	148245123
38	NC_009466	CTTT	2	8	10614	10621	0 %	75 %	0 %	25 %	148245123
39	NC_009466	TTAG	2	8	10775	10782	25 %	50 %	25 %	0 %	148245123
40	NC_009466	TCTT	2	8	11063	11070	0 %	75 %	0 %	25 %	148245123
41	NC_009466	CTTT	2	8	11172	11179	0 %	75 %	0 %	25 %	148245123
42	NC_009466	AGTA	2	8	11272	11279	50 %	25 %	25 %	0 %	148245123
43	NC_009466	ATTT	2	8	11544	11551	25 %	75 %	0 %	0 %	148245123
44	NC_009466	ATTA	2	8	11908	11915	50 %	50 %	0 %	0 %	148245123
45	NC_009466	TTGT	2	8	12022	12029	0 %	75 %	25 %	0 %	148245123
46	NC_009466	CTGA	2	8	12714	12721	25 %	25 %	25 %	25 %	148245123
47	NC_009466	TATT	2	8	12723	12730	25 %	75 %	0 %	0 %	148245123
48	NC_009466	ATTT	2	8	12975	12982	25 %	75 %	0 %	0 %	148245123
49	NC_009466	CCCA	2	8	13199	13206	25 %	0 %	0 %	75 %	148245124
50	NC_009466	AGTA	2	8	13282	13289	50 %	25 %	25 %	0 %	148245125
51	NC_009466	TTTC	2	8	13483	13490	0 %	75 %	0 %	25 %	148245125
52	NC_009466	AGTG	2	8	14254	14261	25 %	25 %	50 %	0 %	148245126
53	NC_009466	TTGA	2	8	14320	14327	25 %	50 %	25 %	0 %	148245126
54	NC_009466	TCAT	2	8	14405	14412	25 %	50 %	0 %	25 %	148245126
55	NC_009466	ATTT	2	8	14715	14722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009466	GTTT	2	8	15116	15123	0 %	75 %	25 %	0 %	148245129
57	NC_009466	TCCA	2	8	15301	15308	25 %	25 %	0 %	50 %	148245130
58	NC_009466	CTTT	2	8	16288	16295	0 %	75 %	0 %	25 %	148245132
59	NC_009466	AAGC	2	8	16712	16719	50 %	0 %	25 %	25 %	148245134
60	NC_009466	GCTA	2	8	16859	16866	25 %	25 %	25 %	25 %	148245134
61	NC_009466	TAAT	2	8	17939	17946	50 %	50 %	0 %	0 %	148245137
62	NC_009466	TTGC	2	8	17953	17960	0 %	50 %	25 %	25 %	148245137
63	NC_009466	CTTT	2	8	18346	18353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009466	CCCA	2	8	18407	18414	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_009466	TGCT	2	8	18425	18432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009466	AAAT	2	8	18487	18494	75 %	25 %	0 %	0 %	148245138
67	NC_009466	GAAA	2	8	18883	18890	75 %	0 %	25 %	0 %	148245139
68	NC_009466	AATG	2	8	19095	19102	50 %	25 %	25 %	0 %	148245139
69	NC_009466	AATT	2	8	19170	19177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009466	TAAT	2	8	19232	19239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009466	TAAT	2	8	19257	19264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009466	TTAT	2	8	19319	19326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009466	TAAT	2	8	20583	20590	50 %	50 %	0 %	0 %	148245142
74	NC_009466	ACAA	2	8	20606	20613	75 %	0 %	0 %	25 %	148245142
75	NC_009466	TAAA	2	8	20670	20677	75 %	25 %	0 %	0 %	148245142
76	NC_009466	ATTT	2	8	20687	20694	25 %	75 %	0 %	0 %	148245142
77	NC_009466	TAAA	2	8	21291	21298	75 %	25 %	0 %	0 %	148245142
78	NC_009466	ATAG	2	8	21685	21692	50 %	25 %	25 %	0 %	148245142
79	NC_009466	ATTT	2	8	22231	22238	25 %	75 %	0 %	0 %	148245143
80	NC_009466	ATCC	2	8	23642	23649	25 %	25 %	0 %	50 %	148245145
81	NC_009466	TAAT	2	8	23667	23674	50 %	50 %	0 %	0 %	148245145
82	NC_009466	ACTT	2	8	24044	24051	25 %	50 %	0 %	25 %	148245146
83	NC_009466	TAAA	2	8	24083	24090	75 %	25 %	0 %	0 %	148245146
84	NC_009466	ATAC	2	8	24405	24412	50 %	25 %	0 %	25 %	148245147
85	NC_009466	AATT	2	8	24471	24478	50 %	50 %	0 %	0 %	148245147
86	NC_009466	AAGG	2	8	25222	25229	50 %	0 %	50 %	0 %	148245148
87	NC_009466	AATT	2	8	25579	25586	50 %	50 %	0 %	0 %	148245149
88	NC_009466	TTGG	2	8	25709	25716	0 %	50 %	50 %	0 %	148245149
89	NC_009466	GTTA	2	8	26110	26117	25 %	50 %	25 %	0 %	148245149
90	NC_009466	TAAT	2	8	26744	26751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009466	AACT	2	8	27700	27707	50 %	25 %	0 %	25 %	148245151
92	NC_009466	TTTA	2	8	28288	28295	25 %	75 %	0 %	0 %	148245152
93	NC_009466	ATTT	2	8	28401	28408	25 %	75 %	0 %	0 %	148245152
94	NC_009466	ATTA	2	8	28694	28701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009466	AAAT	2	8	28796	28803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009466	AGAT	2	8	29298	29305	50 %	25 %	25 %	0 %	148245153
97	NC_009466	TAGT	2	8	29455	29462	25 %	50 %	25 %	0 %	148245153
98	NC_009466	TAAT	2	8	29996	30003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009466	AATA	2	8	30230	30237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009466	AAGA	2	8	30427	30434	75 %	0 %	25 %	0 %	148245156
101	NC_009466	TCTT	2	8	30663	30670	0 %	75 %	0 %	25 %	148245156
102	NC_009466	TGTC	2	8	30745	30752	0 %	50 %	25 %	25 %	148245156
103	NC_009466	ATCC	2	8	31026	31033	25 %	25 %	0 %	50 %	148245156
104	NC_009466	AATT	2	8	31137	31144	50 %	50 %	0 %	0 %	148245157
105	NC_009466	TTTA	2	8	31253	31260	25 %	75 %	0 %	0 %	148245157
106	NC_009466	TAAC	2	8	31934	31941	50 %	25 %	0 %	25 %	148245158
107	NC_009466	AATA	2	8	32231	32238	75 %	25 %	0 %	0 %	148245158
108	NC_009466	TATT	2	8	32608	32615	25 %	75 %	0 %	0 %	148245159
109	NC_009466	TTCT	2	8	33302	33309	0 %	75 %	0 %	25 %	148245160
110	NC_009466	AAAG	2	8	33572	33579	75 %	0 %	25 %	0 %	148245160
111	NC_009466	TCCA	2	8	33616	33623	25 %	25 %	0 %	50 %	148245160
112	NC_009466	CAAA	2	8	34371	34378	75 %	0 %	0 %	25 %	148245162
113	NC_009466	AGTA	2	8	34926	34933	50 %	25 %	25 %	0 %	148245162
114	NC_009466	TAGT	2	8	35396	35403	25 %	50 %	25 %	0 %	148245162
115	NC_009466	TAAT	2	8	35405	35412	50 %	50 %	0 %	0 %	148245162
116	NC_009466	ATTT	2	8	35779	35786	25 %	75 %	0 %	0 %	148245162
117	NC_009466	CTAT	2	8	36017	36024	25 %	50 %	0 %	25 %	148245162
118	NC_009466	CCTT	2	8	36154	36161	0 %	50 %	0 %	50 %	148245162
119	NC_009466	TGTT	2	8	36331	36338	0 %	75 %	25 %	0 %	148245162
120	NC_009466	CTTT	2	8	36609	36616	0 %	75 %	0 %	25 %	148245162
121	NC_009466	TCTA	2	8	36664	36671	25 %	50 %	0 %	25 %	148245162
122	NC_009466	ATCC	2	8	36746	36753	25 %	25 %	0 %	50 %	148245162
123	NC_009466	AATG	2	8	37124	37131	50 %	25 %	25 %	0 %	148245163
124	NC_009466	TACT	2	8	38389	38396	25 %	50 %	0 %	25 %	148245164
125	NC_009466	CTAT	2	8	40054	40061	25 %	50 %	0 %	25 %	148245165
126	NC_009466	ATTC	2	8	40073	40080	25 %	50 %	0 %	25 %	148245165
127	NC_009466	CTTT	2	8	40866	40873	0 %	75 %	0 %	25 %	148245165
128	NC_009466	TTGC	2	8	42457	42464	0 %	50 %	25 %	25 %	148245165
129	NC_009466	TTGT	2	8	42827	42834	0 %	75 %	25 %	0 %	148245165
130	NC_009466	TCGC	2	8	43726	43733	0 %	25 %	25 %	50 %	148245165
131	NC_009466	AAAT	2	8	44028	44035	75 %	25 %	0 %	0 %	148245165
132	NC_009466	TTTG	2	8	44231	44238	0 %	75 %	25 %	0 %	148245165
133	NC_009466	CAAA	2	8	44588	44595	75 %	0 %	0 %	25 %	148245165
134	NC_009466	CTTG	2	8	45981	45988	0 %	50 %	25 %	25 %	148245165
135	NC_009466	TTAT	2	8	46060	46067	25 %	75 %	0 %	0 %	148245165
136	NC_009466	TTGT	2	8	46072	46079	0 %	75 %	25 %	0 %	148245165
137	NC_009466	CTTT	2	8	46477	46484	0 %	75 %	0 %	25 %	148245165
138	NC_009466	ATAA	2	8	47199	47206	75 %	25 %	0 %	0 %	148245166
139	NC_009466	AGTT	2	8	47579	47586	25 %	50 %	25 %	0 %	148245167
140	NC_009466	AGAC	2	8	47600	47607	50 %	0 %	25 %	25 %	148245167
141	NC_009466	TAAT	2	8	47884	47891	50 %	50 %	0 %	0 %	148245168
142	NC_009466	GGTT	2	8	48098	48105	0 %	50 %	50 %	0 %	148245168
143	NC_009466	CTTG	2	8	48936	48943	0 %	50 %	25 %	25 %	148245169
144	NC_009466	AGTT	2	8	49271	49278	25 %	50 %	25 %	0 %	148245170
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.