MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009466	ATCA	2	8	1030	1037	50 %	25 %	0 %	25 %	148245108
2	NC_009466	TTTA	2	8	1051	1058	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
3	NC_009466	TAAT	2	8	1395	1402	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
4	NC_009466	AATT	2	8	1512	1519	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
5	NC_009466	CAAA	2	8	1602	1609	75 %	0 %	0 %	25 %	148245108
6	NC_009466	TTAT	2	8	1637	1644	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
7	NC_009466	TAAA	2	8	1777	1784	75 %	25 %	0 %	0 %	148245108
8	NC_009466	ATTT	2	8	1809	1816	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
9	NC_009466	ATTT	2	8	2121	2128	25 %	75 %	0 %	0 %	148245108
10	NC_009466	CCAG	2	8	2187	2194	25 %	0 %	25 %	50 %	148245108
11	NC_009466	CTTT	2	8	2478	2485	0 %	75 %	0 %	25 %	148245108
12	NC_009466	TGGA	2	8	2896	2903	25 %	25 %	50 %	0 %	148245108
13	NC_009466	ACTG	2	8	3784	3791	25 %	25 %	25 %	25 %	148245110
14	NC_009466	ATTC	2	8	3921	3928	25 %	50 %	0 %	25 %	148245110
15	NC_009466	TTTA	2	8	4168	4175	25 %	75 %	0 %	0 %	148245111
16	NC_009466	TTCT	2	8	4183	4190	0 %	75 %	0 %	25 %	148245111
17	NC_009466	ATTT	2	8	4258	4265	25 %	75 %	0 %	0 %	148245111
18	NC_009466	TTAT	2	8	4457	4464	25 %	75 %	0 %	0 %	148245111
19	NC_009466	TTGC	2	8	4672	4679	0 %	50 %	25 %	25 %	148245112
20	NC_009466	ATTT	2	8	4696	4703	25 %	75 %	0 %	0 %	148245112
21	NC_009466	AAAT	2	8	5216	5223	75 %	25 %	0 %	0 %	148245113
22	NC_009466	TTTG	2	8	5828	5835	0 %	75 %	25 %	0 %	148245114
23	NC_009466	ACCT	2	8	5928	5935	25 %	25 %	0 %	50 %	148245114
24	NC_009466	TTCT	2	8	6878	6885	0 %	75 %	0 %	25 %	148245116
25	NC_009466	TCCT	2	8	7105	7112	0 %	50 %	0 %	50 %	148245116
26	NC_009466	AAAT	2	8	7539	7546	75 %	25 %	0 %	0 %	148245117
27	NC_009466	GCCT	2	8	8773	8780	0 %	25 %	25 %	50 %	148245121
28	NC_009466	TTAT	2	8	9158	9165	25 %	75 %	0 %	0 %	148245122
29	NC_009466	ACCT	2	8	9381	9388	25 %	25 %	0 %	50 %	148245123
30	NC_009466	AATA	2	8	9508	9515	75 %	25 %	0 %	0 %	148245123
31	NC_009466	CTTT	2	8	10614	10621	0 %	75 %	0 %	25 %	148245123
32	NC_009466	TTAG	2	8	10775	10782	25 %	50 %	25 %	0 %	148245123
33	NC_009466	TCTT	2	8	11063	11070	0 %	75 %	0 %	25 %	148245123
34	NC_009466	CTTT	2	8	11172	11179	0 %	75 %	0 %	25 %	148245123
35	NC_009466	AGTA	2	8	11272	11279	50 %	25 %	25 %	0 %	148245123
36	NC_009466	ATTT	2	8	11544	11551	25 %	75 %	0 %	0 %	148245123
37	NC_009466	ATTA	2	8	11908	11915	50 %	50 %	0 %	0 %	148245123
38	NC_009466	TTGT	2	8	12022	12029	0 %	75 %	25 %	0 %	148245123
39	NC_009466	CTGA	2	8	12714	12721	25 %	25 %	25 %	25 %	148245123
40	NC_009466	TATT	2	8	12723	12730	25 %	75 %	0 %	0 %	148245123
41	NC_009466	ATTT	2	8	12975	12982	25 %	75 %	0 %	0 %	148245123
42	NC_009466	CCCA	2	8	13199	13206	25 %	0 %	0 %	75 %	148245124
43	NC_009466	AGTA	2	8	13282	13289	50 %	25 %	25 %	0 %	148245125
44	NC_009466	TTTC	2	8	13483	13490	0 %	75 %	0 %	25 %	148245125
45	NC_009466	AGTG	2	8	14254	14261	25 %	25 %	50 %	0 %	148245126
46	NC_009466	TTGA	2	8	14320	14327	25 %	50 %	25 %	0 %	148245126
47	NC_009466	TCAT	2	8	14405	14412	25 %	50 %	0 %	25 %	148245126
48	NC_009466	GTTT	2	8	15116	15123	0 %	75 %	25 %	0 %	148245129
49	NC_009466	TCCA	2	8	15301	15308	25 %	25 %	0 %	50 %	148245130
50	NC_009466	CTTT	2	8	16288	16295	0 %	75 %	0 %	25 %	148245132
51	NC_009466	AAGC	2	8	16712	16719	50 %	0 %	25 %	25 %	148245134
52	NC_009466	GCTA	2	8	16859	16866	25 %	25 %	25 %	25 %	148245134
53	NC_009466	TAAT	2	8	17939	17946	50 %	50 %	0 %	0 %	148245137
54	NC_009466	TTGC	2	8	17953	17960	0 %	50 %	25 %	25 %	148245137
55	NC_009466	AAAT	2	8	18487	18494	75 %	25 %	0 %	0 %	148245138
56	NC_009466	GAAA	2	8	18883	18890	75 %	0 %	25 %	0 %	148245139
57	NC_009466	AATG	2	8	19095	19102	50 %	25 %	25 %	0 %	148245139
58	NC_009466	TAAT	2	8	20583	20590	50 %	50 %	0 %	0 %	148245142
59	NC_009466	ACAA	2	8	20606	20613	75 %	0 %	0 %	25 %	148245142
60	NC_009466	TAAA	2	8	20670	20677	75 %	25 %	0 %	0 %	148245142
61	NC_009466	ATTT	2	8	20687	20694	25 %	75 %	0 %	0 %	148245142
62	NC_009466	TAAA	2	8	21291	21298	75 %	25 %	0 %	0 %	148245142
63	NC_009466	ATAG	2	8	21685	21692	50 %	25 %	25 %	0 %	148245142
64	NC_009466	ATTT	2	8	22231	22238	25 %	75 %	0 %	0 %	148245143
65	NC_009466	ATCC	2	8	23642	23649	25 %	25 %	0 %	50 %	148245145
66	NC_009466	TAAT	2	8	23667	23674	50 %	50 %	0 %	0 %	148245145
67	NC_009466	ACTT	2	8	24044	24051	25 %	50 %	0 %	25 %	148245146
68	NC_009466	TAAA	2	8	24083	24090	75 %	25 %	0 %	0 %	148245146
69	NC_009466	ATAC	2	8	24405	24412	50 %	25 %	0 %	25 %	148245147
70	NC_009466	AATT	2	8	24471	24478	50 %	50 %	0 %	0 %	148245147
71	NC_009466	AAGG	2	8	25222	25229	50 %	0 %	50 %	0 %	148245148
72	NC_009466	AATT	2	8	25579	25586	50 %	50 %	0 %	0 %	148245149
73	NC_009466	TTGG	2	8	25709	25716	0 %	50 %	50 %	0 %	148245149
74	NC_009466	GTTA	2	8	26110	26117	25 %	50 %	25 %	0 %	148245149
75	NC_009466	AACT	2	8	27700	27707	50 %	25 %	0 %	25 %	148245151
76	NC_009466	TTTA	2	8	28288	28295	25 %	75 %	0 %	0 %	148245152
77	NC_009466	ATTT	2	8	28401	28408	25 %	75 %	0 %	0 %	148245152
78	NC_009466	AGAT	2	8	29298	29305	50 %	25 %	25 %	0 %	148245153
79	NC_009466	TAGT	2	8	29455	29462	25 %	50 %	25 %	0 %	148245153
80	NC_009466	AAGA	2	8	30427	30434	75 %	0 %	25 %	0 %	148245156
81	NC_009466	TCTT	2	8	30663	30670	0 %	75 %	0 %	25 %	148245156
82	NC_009466	TGTC	2	8	30745	30752	0 %	50 %	25 %	25 %	148245156
83	NC_009466	ATCC	2	8	31026	31033	25 %	25 %	0 %	50 %	148245156
84	NC_009466	AATT	2	8	31137	31144	50 %	50 %	0 %	0 %	148245157
85	NC_009466	TTTA	2	8	31253	31260	25 %	75 %	0 %	0 %	148245157
86	NC_009466	TAAC	2	8	31934	31941	50 %	25 %	0 %	25 %	148245158
87	NC_009466	AATA	2	8	32231	32238	75 %	25 %	0 %	0 %	148245158
88	NC_009466	TATT	2	8	32608	32615	25 %	75 %	0 %	0 %	148245159
89	NC_009466	TTCT	2	8	33302	33309	0 %	75 %	0 %	25 %	148245160
90	NC_009466	AAAG	2	8	33572	33579	75 %	0 %	25 %	0 %	148245160
91	NC_009466	TCCA	2	8	33616	33623	25 %	25 %	0 %	50 %	148245160
92	NC_009466	CAAA	2	8	34371	34378	75 %	0 %	0 %	25 %	148245162
93	NC_009466	AGTA	2	8	34926	34933	50 %	25 %	25 %	0 %	148245162
94	NC_009466	TAGT	2	8	35396	35403	25 %	50 %	25 %	0 %	148245162
95	NC_009466	TAAT	2	8	35405	35412	50 %	50 %	0 %	0 %	148245162
96	NC_009466	ATTT	2	8	35779	35786	25 %	75 %	0 %	0 %	148245162
97	NC_009466	CTAT	2	8	36017	36024	25 %	50 %	0 %	25 %	148245162
98	NC_009466	CCTT	2	8	36154	36161	0 %	50 %	0 %	50 %	148245162
99	NC_009466	TGTT	2	8	36331	36338	0 %	75 %	25 %	0 %	148245162
100	NC_009466	CTTT	2	8	36609	36616	0 %	75 %	0 %	25 %	148245162
101	NC_009466	TCTA	2	8	36664	36671	25 %	50 %	0 %	25 %	148245162
102	NC_009466	ATCC	2	8	36746	36753	25 %	25 %	0 %	50 %	148245162
103	NC_009466	AATG	2	8	37124	37131	50 %	25 %	25 %	0 %	148245163
104	NC_009466	TACT	2	8	38389	38396	25 %	50 %	0 %	25 %	148245164
105	NC_009466	CTAT	2	8	40054	40061	25 %	50 %	0 %	25 %	148245165
106	NC_009466	ATTC	2	8	40073	40080	25 %	50 %	0 %	25 %	148245165
107	NC_009466	CTTT	2	8	40866	40873	0 %	75 %	0 %	25 %	148245165
108	NC_009466	TTGC	2	8	42457	42464	0 %	50 %	25 %	25 %	148245165
109	NC_009466	TTGT	2	8	42827	42834	0 %	75 %	25 %	0 %	148245165
110	NC_009466	TCGC	2	8	43726	43733	0 %	25 %	25 %	50 %	148245165
111	NC_009466	AAAT	2	8	44028	44035	75 %	25 %	0 %	0 %	148245165
112	NC_009466	TTTG	2	8	44231	44238	0 %	75 %	25 %	0 %	148245165
113	NC_009466	CAAA	2	8	44588	44595	75 %	0 %	0 %	25 %	148245165
114	NC_009466	CTTG	2	8	45981	45988	0 %	50 %	25 %	25 %	148245165
115	NC_009466	TTAT	2	8	46060	46067	25 %	75 %	0 %	0 %	148245165
116	NC_009466	TTGT	2	8	46072	46079	0 %	75 %	25 %	0 %	148245165
117	NC_009466	CTTT	2	8	46477	46484	0 %	75 %	0 %	25 %	148245165
118	NC_009466	ATAA	2	8	47199	47206	75 %	25 %	0 %	0 %	148245166
119	NC_009466	AGTT	2	8	47579	47586	25 %	50 %	25 %	0 %	148245167
120	NC_009466	AGAC	2	8	47600	47607	50 %	0 %	25 %	25 %	148245167
121	NC_009466	TAAT	2	8	47884	47891	50 %	50 %	0 %	0 %	148245168
122	NC_009466	GGTT	2	8	48098	48105	0 %	50 %	50 %	0 %	148245168
123	NC_009466	CTTG	2	8	48936	48943	0 %	50 %	25 %	25 %	148245169
124	NC_009466	AGTT	2	8	49271	49278	25 %	50 %	25 %	0 %	148245170
125	NC_009466	TCAA	2	8	49480	49487	50 %	25 %	0 %	25 %	148245170
126	NC_009466	TTCA	2	8	50188	50195	25 %	50 %	0 %	25 %	148245172
127	NC_009466	CATA	2	8	50846	50853	50 %	25 %	0 %	25 %	148245174
128	NC_009466	ATTT	2	8	51059	51066	25 %	75 %	0 %	0 %	148245174
129	NC_009466	CAGT	2	8	51548	51555	25 %	25 %	25 %	25 %	148245174
130	NC_009466	TTTC	3	12	51742	51753	0 %	75 %	0 %	25 %	148245175
131	NC_009466	ATAG	2	8	51998	52005	50 %	25 %	25 %	0 %	148245175
132	NC_009466	ATAA	2	8	52354	52361	75 %	25 %	0 %	0 %	148245175
133	NC_009466	CAAA	2	8	52912	52919	75 %	0 %	0 %	25 %	148245176
134	NC_009466	AAAT	2	8	52936	52943	75 %	25 %	0 %	0 %	148245176
135	NC_009466	TTTC	2	8	52975	52982	0 %	75 %	0 %	25 %	148245176
136	NC_009466	TTAC	2	8	53376	53383	25 %	50 %	0 %	25 %	148245176
137	NC_009466	AAAT	2	8	53621	53628	75 %	25 %	0 %	0 %	148245176
138	NC_009466	AACT	2	8	53661	53668	50 %	25 %	0 %	25 %	148245177
139	NC_009466	ATTA	2	8	53698	53705	50 %	50 %	0 %	0 %	148245177
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141	NC_009466	ATTG	2	8	54298	54305	25 %	50 %	25 %	0 %	148245177
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.