MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A

Total Repeats: 818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009466	CTT	2	6	90	95	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009466	ATA	2	6	101	106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009466	TAA	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009466	TTA	2	6	139	144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009466	ATA	2	6	178	183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009466	TTA	2	6	267	272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009466	TTA	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009466	ATA	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009466	TAA	2	6	337	342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009466	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009466	TTA	2	6	371	376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009466	TCT	3	9	396	404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245108
13	NC_009466	CTG	2	6	427	432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245108
14	NC_009466	TCC	2	6	440	445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245108
15	NC_009466	GGA	2	6	467	472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148245108
16	NC_009466	TAA	2	6	571	576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245108
17	NC_009466	GCA	2	6	731	736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245108
18	NC_009466	TAT	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
19	NC_009466	TAT	2	6	757	762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
20	NC_009466	CCA	2	6	843	848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245108
21	NC_009466	CCA	2	6	873	878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245108
22	NC_009466	ATT	2	6	886	891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
23	NC_009466	TAC	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
24	NC_009466	TCT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245108
25	NC_009466	TAT	2	6	1224	1229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
26	NC_009466	TTC	2	6	1336	1341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245108
27	NC_009466	AAT	2	6	1353	1358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245108
28	NC_009466	ATT	2	6	1460	1465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
29	NC_009466	CCT	2	6	1475	1480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245108
30	NC_009466	TAG	2	6	1498	1503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245108
31	NC_009466	TGA	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245108
32	NC_009466	ATT	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245108
33	NC_009466	TGT	2	6	1749	1754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245108
34	NC_009466	TCA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
35	NC_009466	ATC	2	6	1840	1845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
36	NC_009466	ATC	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
37	NC_009466	TCC	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245108
38	NC_009466	CTG	2	6	2107	2112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245108
39	NC_009466	ATC	2	6	2164	2169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245108
40	NC_009466	TAA	2	6	2241	2246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245108
41	NC_009466	CAC	2	6	2322	2327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245108
42	NC_009466	TGG	2	6	2382	2387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245108
43	NC_009466	CTG	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245108
44	NC_009466	GTT	2	6	2413	2418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245108
45	NC_009466	TAA	2	6	2555	2560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245108
46	NC_009466	AAG	2	6	2880	2885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245108
47	NC_009466	GCC	2	6	3026	3031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245109
48	NC_009466	TAA	2	6	3074	3079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245109
49	NC_009466	ATC	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245109
50	NC_009466	TCA	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245109
51	NC_009466	TAA	2	6	3426	3431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245109
52	NC_009466	TCA	2	6	3449	3454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245109
53	NC_009466	TCT	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245109
54	NC_009466	ATC	2	6	3637	3642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245110
55	NC_009466	CAT	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245110
56	NC_009466	TTA	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245110
57	NC_009466	TTA	2	6	3869	3874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245110
58	NC_009466	TCA	2	6	3986	3991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245110
59	NC_009466	CAC	2	6	4006	4011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_009466	CTT	2	6	4037	4042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245111
61	NC_009466	AAG	2	6	4156	4161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245111
62	NC_009466	TCT	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245111
63	NC_009466	TAA	2	6	4252	4257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245111
64	NC_009466	CAG	2	6	4270	4275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148245111
65	NC_009466	TAA	2	6	4335	4340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245111
66	NC_009466	TCA	2	6	4349	4354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245111
67	NC_009466	TCC	2	6	4411	4416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245111
68	NC_009466	ATT	2	6	4483	4488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245111
69	NC_009466	CCT	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245112
70	NC_009466	CAT	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245112
71	NC_009466	ATC	2	6	4718	4723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245112
72	NC_009466	ATC	2	6	4796	4801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245112
73	NC_009466	CTC	2	6	4861	4866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_009466	CTA	2	6	5025	5030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009466	TCC	2	6	5146	5151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245113
76	NC_009466	TAA	2	6	5265	5270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245113
77	NC_009466	CTT	2	6	5297	5302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245113
78	NC_009466	TAT	2	6	5313	5318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245113
79	NC_009466	CTT	2	6	5365	5370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245113
80	NC_009466	TGC	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245113
81	NC_009466	CTT	2	6	5549	5554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009466	TAA	2	6	5568	5573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009466	TTA	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009466	TTA	2	6	5701	5706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009466	ATC	2	6	5890	5895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245114
86	NC_009466	CTT	2	6	5963	5968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245114
87	NC_009466	AAT	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009466	CAA	2	6	6093	6098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009466	CAA	2	6	6138	6143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009466	TAA	2	6	6179	6184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009466	ACC	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009466	TCT	2	6	6261	6266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009466	CCT	2	6	6325	6330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009466	CTG	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245115
95	NC_009466	TTA	4	12	6501	6512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245115
96	NC_009466	CCT	2	6	6528	6533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245115
97	NC_009466	TCC	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245115
98	NC_009466	CAT	2	6	6655	6660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245115
99	NC_009466	ATT	2	6	6683	6688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245115
100	NC_009466	TCA	2	6	6720	6725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245115
101	NC_009466	TAT	2	6	6776	6781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245115
102	NC_009466	TAA	2	6	6933	6938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245116
103	NC_009466	TTA	2	6	7004	7009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245116
104	NC_009466	TAA	2	6	7071	7076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245116
105	NC_009466	TGG	2	6	7080	7085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245116
106	NC_009466	AAT	2	6	7277	7282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245116
107	NC_009466	TTC	2	6	7374	7379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009466	CTA	2	6	7381	7386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009466	TAA	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009466	GAA	2	6	7526	7531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245117
111	NC_009466	CCT	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245117
112	NC_009466	TCT	2	6	7673	7678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245118
113	NC_009466	CAT	2	6	7746	7751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245118
114	NC_009466	AAT	2	6	7806	7811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245118
115	NC_009466	ATT	2	6	7844	7849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009466	CTA	2	6	7870	7875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245119
117	NC_009466	ATT	2	6	7883	7888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245119
118	NC_009466	CTG	2	6	7912	7917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245119
119	NC_009466	CTT	2	6	8112	8117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245120
120	NC_009466	CTT	2	6	8207	8212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245120
121	NC_009466	CCT	2	6	8264	8269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245120
122	NC_009466	TCC	2	6	8290	8295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245120
123	NC_009466	TTA	2	6	8320	8325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245120
124	NC_009466	CTA	2	6	8336	8341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245120
125	NC_009466	AAT	2	6	8373	8378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009466	CAT	2	6	8446	8451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009466	TGT	2	6	8673	8678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245121
128	NC_009466	TCT	2	6	8693	8698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245121
129	NC_009466	GTT	2	6	8879	8884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245122
130	NC_009466	TAC	2	6	8971	8976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245122
131	NC_009466	ATT	2	6	9100	9105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245122
132	NC_009466	CTC	2	6	9236	9241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245122
133	NC_009466	TCC	2	6	9247	9252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245122
134	NC_009466	ACC	2	6	9301	9306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009466	AAT	2	6	9328	9333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245123
136	NC_009466	TCC	2	6	9598	9603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245123
137	NC_009466	CTT	2	6	9669	9674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
138	NC_009466	TCC	2	6	9721	9726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245123
139	NC_009466	TAC	2	6	9844	9849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245123
140	NC_009466	GTT	2	6	9872	9877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245123
141	NC_009466	TCA	2	6	9911	9916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245123
142	NC_009466	ATG	2	6	9972	9977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148245123
143	NC_009466	AAT	2	6	10001	10006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245123
144	NC_009466	AAG	2	6	10216	10221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245123
145	NC_009466	TTC	2	6	10282	10287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
146	NC_009466	TCT	2	6	10304	10309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
147	NC_009466	AAG	2	6	10330	10335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245123
148	NC_009466	TAA	2	6	10357	10362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245123
149	NC_009466	ATT	2	6	10576	10581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245123
150	NC_009466	TTC	2	6	10723	10728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
151	NC_009466	TCT	2	6	10766	10771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
152	NC_009466	CTT	2	6	10791	10796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
153	NC_009466	CAT	2	6	10848	10853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245123
154	NC_009466	TCC	2	6	11003	11008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245123
155	NC_009466	TTC	2	6	11155	11160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
156	NC_009466	TGC	2	6	11237	11242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245123
157	NC_009466	TTC	2	6	11252	11257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
158	NC_009466	AAT	2	6	11423	11428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245123
159	NC_009466	TCT	2	6	11499	11504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
160	NC_009466	ATC	2	6	11512	11517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245123
161	NC_009466	TCC	2	6	11537	11542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245123
162	NC_009466	TTA	2	6	11604	11609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245123
163	NC_009466	ATT	2	6	11674	11679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245123
164	NC_009466	GAA	2	6	11743	11748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245123
165	NC_009466	TTC	2	6	11815	11820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
166	NC_009466	GCT	2	6	11897	11902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245123
167	NC_009466	GTT	2	6	12093	12098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245123
168	NC_009466	TCA	3	9	12134	12142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245123
169	NC_009466	GTT	2	6	12228	12233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148245123
170	NC_009466	CTT	2	6	12339	12344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
171	NC_009466	GCC	2	6	12464	12469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148245123
172	NC_009466	CTG	2	6	12693	12698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245123
173	NC_009466	TTA	2	6	12750	12755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245123
174	NC_009466	AAT	2	6	12795	12800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245123
175	NC_009466	TCT	2	6	12859	12864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245123
176	NC_009466	AAT	2	6	12949	12954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148245123
177	NC_009466	GCT	2	6	12960	12965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245123
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179	NC_009466	TCC	2	6	13099	13104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245124
180	NC_009466	TCA	2	6	13126	13131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245124
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184	NC_009466	CTC	2	6	13469	13474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148245125
185	NC_009466	TTA	2	6	13529	13534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245126
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187	NC_009466	CTT	2	6	13603	13608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245126
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193	NC_009466	AGA	2	6	14005	14010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148245126
194	NC_009466	ACC	2	6	14059	14064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148245126
195	NC_009466	CAT	2	6	14103	14108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245126
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198	NC_009466	GTG	2	6	14343	14348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148245126
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200	NC_009466	TTA	2	6	14505	14510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245127
201	NC_009466	TGT	2	6	14730	14735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
202	NC_009466	CAT	2	6	14794	14799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148245128
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205	NC_009466	TCT	2	6	15244	15249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245130
206	NC_009466	TCT	2	6	15330	15335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245130
207	NC_009466	TTA	2	6	15391	15396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245130
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209	NC_009466	CTT	2	6	15445	15450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148245130
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246	NC_009466	CTT	2	6	18211	18216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_009466	AAT	2	6	18230	18235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_009466	AGT	2	6	18313	18318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
249	NC_009466	CCT	2	6	18397	18402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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253	NC_009466	TGT	2	6	18695	18700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_009466	AGG	2	6	18743	18748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_009466	TAT	2	6	18749	18754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_009466	TAA	2	6	19214	19219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_009466	TTA	2	6	28469	28474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245152
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