MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009466	AT	3	6	254	259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009466	TA	4	8	283	290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009466	TA	4	8	293	300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009466	AT	3	6	418	423	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
5	NC_009466	TA	4	8	688	695	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
6	NC_009466	TA	3	6	2088	2093	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
7	NC_009466	AT	3	6	2605	2610	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
8	NC_009466	AT	3	6	2690	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
9	NC_009466	TA	3	6	2767	2772	50 %	50 %	0 %	0 %	148245108
10	NC_009466	CT	3	6	3319	3324	0 %	50 %	0 %	50 %	148245109
11	NC_009466	CT	3	6	3520	3525	0 %	50 %	0 %	50 %	148245109
12	NC_009466	AT	3	6	3735	3740	50 %	50 %	0 %	0 %	148245110
13	NC_009466	TA	3	6	4056	4061	50 %	50 %	0 %	0 %	148245111
14	NC_009466	TA	3	6	4207	4212	50 %	50 %	0 %	0 %	148245111
15	NC_009466	AT	3	6	4371	4376	50 %	50 %	0 %	0 %	148245111
16	NC_009466	TA	3	6	4384	4389	50 %	50 %	0 %	0 %	148245111
17	NC_009466	TC	3	6	4638	4643	0 %	50 %	0 %	50 %	148245112
18	NC_009466	TA	3	6	4778	4783	50 %	50 %	0 %	0 %	148245112
19	NC_009466	AT	3	6	5094	5099	50 %	50 %	0 %	0 %	148245113
20	NC_009466	AC	3	6	5188	5193	50 %	0 %	0 %	50 %	148245113
21	NC_009466	AT	3	6	5385	5390	50 %	50 %	0 %	0 %	148245113
22	NC_009466	AT	3	6	5411	5416	50 %	50 %	0 %	0 %	148245113
23	NC_009466	CT	3	6	5434	5439	0 %	50 %	0 %	50 %	148245113
24	NC_009466	TC	3	6	5815	5820	0 %	50 %	0 %	50 %	148245114
25	NC_009466	AC	3	6	6300	6305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009466	TA	3	6	6800	6805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009466	AT	3	6	7092	7097	50 %	50 %	0 %	0 %	148245116
28	NC_009466	AC	3	6	7435	7440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009466	AT	3	6	7779	7784	50 %	50 %	0 %	0 %	148245118
30	NC_009466	TC	3	6	8153	8158	0 %	50 %	0 %	50 %	148245120
31	NC_009466	GA	3	6	8239	8244	50 %	0 %	50 %	0 %	148245120
32	NC_009466	CA	3	6	8249	8254	50 %	0 %	0 %	50 %	148245120
33	NC_009466	TC	3	6	9121	9126	0 %	50 %	0 %	50 %	148245122
34	NC_009466	TC	3	6	9436	9441	0 %	50 %	0 %	50 %	148245123
35	NC_009466	AT	3	6	9828	9833	50 %	50 %	0 %	0 %	148245123
36	NC_009466	TC	3	6	9886	9891	0 %	50 %	0 %	50 %	148245123
37	NC_009466	CT	3	6	10266	10271	0 %	50 %	0 %	50 %	148245123
38	NC_009466	AT	3	6	10881	10886	50 %	50 %	0 %	0 %	148245123
39	NC_009466	AT	3	6	11133	11138	50 %	50 %	0 %	0 %	148245123
40	NC_009466	CA	3	6	13519	13524	50 %	0 %	0 %	50 %	148245125
41	NC_009466	AT	3	6	13806	13811	50 %	50 %	0 %	0 %	148245126
42	NC_009466	TA	3	6	14280	14285	50 %	50 %	0 %	0 %	148245126
43	NC_009466	AT	3	6	14488	14493	50 %	50 %	0 %	0 %	148245127
44	NC_009466	TA	3	6	15182	15187	50 %	50 %	0 %	0 %	148245129
45	NC_009466	AT	3	6	15349	15354	50 %	50 %	0 %	0 %	148245130
46	NC_009466	CA	3	6	15832	15837	50 %	0 %	0 %	50 %	148245131
47	NC_009466	TA	3	6	16589	16594	50 %	50 %	0 %	0 %	148245134
48	NC_009466	AT	3	6	16740	16745	50 %	50 %	0 %	0 %	148245134
49	NC_009466	TC	3	6	17168	17173	0 %	50 %	0 %	50 %	148245135
50	NC_009466	CT	3	6	17757	17762	0 %	50 %	0 %	50 %	148245137
51	NC_009466	AT	3	6	19280	19285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009466	TG	3	6	19286	19291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009466	CA	4	8	19329	19336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009466	TA	3	6	19471	19476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009466	TA	3	6	19478	19483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009466	AT	3	6	19601	19606	50 %	50 %	0 %	0 %	148245140
57	NC_009466	AT	3	6	19857	19862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009466	AT	3	6	19927	19932	50 %	50 %	0 %	0 %	148245141
59	NC_009466	AT	3	6	21215	21220	50 %	50 %	0 %	0 %	148245142
60	NC_009466	TA	3	6	21570	21575	50 %	50 %	0 %	0 %	148245142
61	NC_009466	TG	3	6	21698	21703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009466	CT	3	6	21704	21709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009466	TC	3	6	21809	21814	0 %	50 %	0 %	50 %	148245143
64	NC_009466	CT	3	6	21986	21991	0 %	50 %	0 %	50 %	148245143
65	NC_009466	TA	3	6	22753	22758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009466	TA	4	8	22841	22848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009466	AT	3	6	22938	22943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009466	CA	3	6	22982	22987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009466	AT	3	6	23439	23444	50 %	50 %	0 %	0 %	148245144
70	NC_009466	TA	3	6	23478	23483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009466	TG	3	6	23616	23621	0 %	50 %	50 %	0 %	148245145
72	NC_009466	AC	3	6	23727	23732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_009466	TA	3	6	23876	23881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009466	GA	3	6	23918	23923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009466	TA	3	6	23968	23973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009466	TA	3	6	24387	24392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009466	TG	3	6	24641	24646	0 %	50 %	50 %	0 %	148245147
78	NC_009466	AT	3	6	24807	24812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009466	TA	3	6	24915	24920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009466	TA	3	6	24948	24953	50 %	50 %	0 %	0 %	148245148
81	NC_009466	TA	4	8	25073	25080	50 %	50 %	0 %	0 %	148245148
82	NC_009466	AT	3	6	25443	25448	50 %	50 %	0 %	0 %	148245149
83	NC_009466	AT	3	6	25871	25876	50 %	50 %	0 %	0 %	148245149
84	NC_009466	TC	3	6	25949	25954	0 %	50 %	0 %	50 %	148245149
85	NC_009466	TA	3	6	26811	26816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009466	AT	3	6	26900	26905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009466	TA	4	8	26992	26999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009466	AT	3	6	27882	27887	50 %	50 %	0 %	0 %	148245152
89	NC_009466	TA	3	6	28003	28008	50 %	50 %	0 %	0 %	148245152
90	NC_009466	AT	3	6	28249	28254	50 %	50 %	0 %	0 %	148245152
91	NC_009466	TA	3	6	28829	28834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009466	AT	3	6	28924	28929	50 %	50 %	0 %	0 %	148245153
93	NC_009466	AT	3	6	29440	29445	50 %	50 %	0 %	0 %	148245153
94	NC_009466	TA	3	6	29787	29792	50 %	50 %	0 %	0 %	148245155
95	NC_009466	TA	4	8	29847	29854	50 %	50 %	0 %	0 %	148245155
96	NC_009466	AT	3	6	29911	29916	50 %	50 %	0 %	0 %	148245155
97	NC_009466	TA	4	8	29980	29987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009466	TA	3	6	30009	30014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009466	TA	3	6	30016	30021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101	NC_009466	AT	3	6	30542	30547	50 %	50 %	0 %	0 %	148245156
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104	NC_009466	TA	3	6	30892	30897	50 %	50 %	0 %	0 %	148245156
105	NC_009466	TA	3	6	30959	30964	50 %	50 %	0 %	0 %	148245156
106	NC_009466	CT	3	6	31324	31329	0 %	50 %	0 %	50 %	148245157
107	NC_009466	AT	3	6	31688	31693	50 %	50 %	0 %	0 %	148245158
108	NC_009466	TA	3	6	32214	32219	50 %	50 %	0 %	0 %	148245158
109	NC_009466	TA	3	6	32853	32858	50 %	50 %	0 %	0 %	148245159
110	NC_009466	AT	4	8	33342	33349	50 %	50 %	0 %	0 %	148245160
111	NC_009466	AT	3	6	33607	33612	50 %	50 %	0 %	0 %	148245160
112	NC_009466	TA	3	6	35259	35264	50 %	50 %	0 %	0 %	148245162
113	NC_009466	AC	3	6	35287	35292	50 %	0 %	0 %	50 %	148245162
114	NC_009466	AG	3	6	35383	35388	50 %	0 %	50 %	0 %	148245162
115	NC_009466	TC	3	6	36566	36571	0 %	50 %	0 %	50 %	148245162
116	NC_009466	TA	3	6	36727	36732	50 %	50 %	0 %	0 %	148245162
117	NC_009466	AT	3	6	37025	37030	50 %	50 %	0 %	0 %	148245163
118	NC_009466	AT	3	6	37475	37480	50 %	50 %	0 %	0 %	148245163
119	NC_009466	CT	3	6	37579	37584	0 %	50 %	0 %	50 %	148245163
120	NC_009466	TA	3	6	38153	38158	50 %	50 %	0 %	0 %	148245164
121	NC_009466	TA	3	6	38284	38289	50 %	50 %	0 %	0 %	148245164
122	NC_009466	GT	3	6	38595	38600	0 %	50 %	50 %	0 %	148245164
123	NC_009466	AT	3	6	38704	38709	50 %	50 %	0 %	0 %	148245164
124	NC_009466	TA	5	10	38882	38891	50 %	50 %	0 %	0 %	148245164
125	NC_009466	AT	3	6	39396	39401	50 %	50 %	0 %	0 %	148245165
126	NC_009466	AT	3	6	40418	40423	50 %	50 %	0 %	0 %	148245165
127	NC_009466	TA	3	6	41642	41647	50 %	50 %	0 %	0 %	148245165
128	NC_009466	TA	3	6	41667	41672	50 %	50 %	0 %	0 %	148245165
129	NC_009466	AT	3	6	43908	43913	50 %	50 %	0 %	0 %	148245165
130	NC_009466	TA	3	6	44639	44644	50 %	50 %	0 %	0 %	148245165
131	NC_009466	TA	3	6	46785	46790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009466	AT	3	6	47221	47226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009466	AT	3	6	47249	47254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009466	AT	3	6	47619	47624	50 %	50 %	0 %	0 %	148245167
135	NC_009466	AT	3	6	48580	48585	50 %	50 %	0 %	0 %	148245168
136	NC_009466	AT	3	6	48774	48779	50 %	50 %	0 %	0 %	148245168
137	NC_009466	TA	3	6	49299	49304	50 %	50 %	0 %	0 %	148245170
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147	NC_009466	AT	3	6	55743	55748	50 %	50 %	0 %	0 %	148245177
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.