MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009465	AAAAAT	2	12	37167	37178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009465	AATATT	2	12	51700	51711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009465	TAGTTG	2	12	59593	59604	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009465	CAATAT	2	12	64575	64586	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009465	GTAAAA	2	12	66339	66350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009465	CCATAT	3	18	66861	66878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009465	GTGTCT	2	12	67387	67398	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_009465	TTCTTA	2	12	67401	67412	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009465	ATGATT	2	12	69303	69314	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009465	TAACAA	2	12	86043	86054	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009465	TGTTTA	2	12	86882	86893	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009465	AAAAAT	2	12	89733	89744	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009465	AGAAAT	2	12	90222	90233	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009465	AATTTA	2	12	96228	96239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009465	AAGTTA	2	12	121467	121478	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009465	AATTAG	2	12	154147	154158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009465	TAATAT	2	12	159572	159583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009465	ATGTTT	2	12	163053	163064	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009465	TCGTGT	3	18	174603	174620	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009465	AAAAGT	2	12	175052	175063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009465	ATTACT	2	12	195128	195139	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009465	ATTAAT	2	12	207896	207907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009465	TTATAT	2	12	222949	222960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009465	TATCAA	2	12	226990	227001	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_009465	AAATAT	2	12	276577	276588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009465	TATTTT	2	12	277015	277026	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009465	AAAATA	2	12	279037	279048	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009465	TCTTTT	2	12	283916	283927	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009465	ATTTTA	2	12	301432	301443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009465	GGTTTT	2	12	302519	302530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009465	TTATTG	2	12	302601	302612	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009465	GTAATA	2	12	310541	310552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009465	TAAATA	2	12	318107	318118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009465	ACTAAT	2	12	338998	339009	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_009465	TATAAT	2	12	370107	370118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009465	ATAACC	2	12	381033	381044	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009465	TAATTT	2	12	411007	411018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009465	AGTATT	2	12	418978	418989	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009465	TAGTTC	3	18	419952	419969	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009465	ACTTAA	2	12	478007	478018	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_009465	TAAAAA	2	12	478284	478295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009465	TAATTT	2	12	498143	498154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009465	GGTGCT	2	12	531081	531092	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009465	CCTAAA	2	12	531389	531400	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009465	ATCCTA	2	12	531709	531720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009465	TTATTG	2	12	558037	558048	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009465	TACCAT	2	12	587351	587362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009465	TAAAAA	2	12	601342	601353	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009465	GAAAAA	2	12	603929	603940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009465	TAGGTA	2	12	608665	608676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009465	ACATAA	2	12	611558	611569	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_009465	AGCAAA	2	12	613484	613495	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_009465	TTAAAA	2	12	633564	633575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009465	AAATAA	2	12	643967	643978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009465	TACTAA	2	12	648092	648103	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_009465	ATTAAG	2	12	655463	655474	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009465	TAATTT	2	12	677070	677081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009465	AATGAT	2	12	688364	688375	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009465	TCAATA	2	12	699047	699058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009465	ACTTTA	2	12	699102	699113	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_009465	TTAAAT	2	12	701592	701603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009465	TTTGAT	2	12	705741	705752	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009465	CAAATA	2	12	708897	708908	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_009465	TTAACT	2	12	719639	719650	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009465	GTTATA	2	12	732353	732364	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009465	ATCACT	2	12	734283	734294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009465	ATTTTT	2	12	735680	735691	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009465	ATAAAA	2	12	743823	743834	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009465	AAAGCA	2	12	753116	753127	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_009465	GTATTT	2	12	760569	760580	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009465	TAACAT	2	12	789470	789481	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_009465	ATCAAC	2	12	798742	798753	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009465	TAAAAA	2	12	811928	811939	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009465	AAACTA	2	12	816705	816716	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_009465	TTCTAC	2	12	838302	838313	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009465	AAATAA	2	12	849903	849914	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009465	ATTCTA	2	12	853961	853972	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_009465	CTTAAT	2	12	873939	873950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009465	ACCTAT	2	12	877338	877349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009465	AATTAA	2	12	878361	878372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009465	TAATTT	2	12	880296	880307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009465	TTATAT	2	12	880623	880634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009465	TTAAAT	2	12	883380	883391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009465	AATTAA	2	12	887284	887295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009465	ACTAAT	2	12	903510	903521	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_009465	TAACTT	2	12	905954	905965	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_009465	AAAATA	2	12	906090	906101	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009465	AAAAAG	2	12	914103	914114	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009465	TAAAAT	2	12	919264	919275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009465	ATCCCT	2	12	927557	927568	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009465	ATAAAA	2	12	938270	938281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009465	TTTAAA	2	12	944346	944357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009465	CAATTT	2	12	945547	945558	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009465	ATAAGG	2	12	948817	948828	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009465	CTAAAA	2	12	980268	980279	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009465	AAGATG	2	12	983899	983910	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009465	TTAACT	2	12	997789	997800	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_009465	ATTACT	2	12	999749	999760	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_009465	ATGTAA	2	12	1017863	1017874	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009465	TAATAC	2	12	1022106	1022117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009465	TTAATT	2	12	1022134	1022145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.