MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA

Total Repeats: 477

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009465	TCACTA	2	12	1141	1152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244170
2	NC_009465	AATTTA	2	12	4532	4543	50 %	50 %	0 %	0 %	148244172
3	NC_009465	TATTTT	2	12	6137	6148	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148244174
4	NC_009465	CTTTAA	2	12	7202	7213	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148244174
5	NC_009465	TAAAAA	2	12	9670	9681	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148244176
6	NC_009465	TTAATT	2	12	13836	13847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244182
7	NC_009465	TATTAG	2	12	16196	16207	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148244183
8	NC_009465	ACAAAC	2	12	16766	16777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244183
9	NC_009465	CCTTGT	2	12	16830	16841	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148244183
10	NC_009465	TGATTT	2	12	21890	21901	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148244187
11	NC_009465	CAAATT	2	12	24528	24539	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244191
12	NC_009465	CAATAG	2	12	24837	24848	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148244191
13	NC_009465	TGCTGT	2	12	28170	28181	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148244195
14	NC_009465	CGATTA	2	12	28970	28981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148244196
15	NC_009465	TTATGA	2	12	29727	29738	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148244197
16	NC_009465	TAAAGC	2	12	30897	30908	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148244198
17	NC_009465	TTTGAT	2	12	33736	33747	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148244202
18	NC_009465	TTGCTA	2	12	34576	34587	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148244203
19	NC_009465	GGCAAT	2	12	39554	39565	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148244208
20	NC_009465	TTTTGC	2	12	39995	40006	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148244209
21	NC_009465	TCGTAA	2	12	40253	40264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148244209
22	NC_009465	AGGTAA	2	12	42696	42707	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148244212
23	NC_009465	TATAGG	2	12	44209	44220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244215
24	NC_009465	TATTAA	2	12	44454	44465	50 %	50 %	0 %	0 %	148244215
25	NC_009465	ATCATA	2	12	44873	44884	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244215
26	NC_009465	ACCTAG	2	12	45322	45333	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148244215
27	NC_009465	CGTGTT	2	12	48819	48830	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	148244217
28	NC_009465	TTTTTA	2	12	50652	50663	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148244221
29	NC_009465	ATTTTT	2	12	53574	53585	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148244223
30	NC_009465	ATGGGT	2	12	56625	56636	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148244226
31	NC_009465	AGAACA	2	12	58306	58317	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148244227
32	NC_009465	TGGGGG	2	12	59833	59844	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	148244229
33	NC_009465	TAATAT	2	12	59947	59958	50 %	50 %	0 %	0 %	148244229
34	NC_009465	GTATTA	2	12	64167	64178	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148244232
35	NC_009465	ATATTT	2	12	66666	66677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244234
36	NC_009465	TTGGTT	2	12	70149	70160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244236
37	NC_009465	ATCAAG	2	12	71175	71186	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148244236
38	NC_009465	GCAAAA	2	12	71369	71380	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	148244236
39	NC_009465	GATGTA	2	12	71768	71779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244237
40	NC_009465	AGATTT	2	12	72964	72975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148244238
41	NC_009465	TTAGAT	2	12	76125	76136	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148244240
42	NC_009465	GTTATT	2	12	76785	76796	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148244241
43	NC_009465	TTCTAT	2	12	78581	78592	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148244241
44	NC_009465	TTTTAC	2	12	83606	83617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148244246
45	NC_009465	AGGTAA	2	12	88291	88302	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148244250
46	NC_009465	AGATTG	2	12	90733	90744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244251
47	NC_009465	AACAAA	2	12	97564	97575	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148244254
48	NC_009465	CTTTAG	2	12	98136	98147	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148244255
49	NC_009465	GTAATG	2	12	98519	98530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244255
50	NC_009465	TGAGCC	2	12	100761	100772	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148244257
51	NC_009465	ATCGTA	2	12	102700	102711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148244258
52	NC_009465	TGAAAT	2	12	103030	103041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148244259
53	NC_009465	CCATTG	2	12	104650	104661	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148244262
54	NC_009465	TGGTAA	2	12	112087	112098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244268
55	NC_009465	CTTCAA	2	12	114400	114411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244270
56	NC_009465	AATACA	2	12	120937	120948	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148244276
57	NC_009465	ATCTTG	2	12	125385	125396	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148244279
58	NC_009465	TTCAAA	2	12	127814	127825	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244282
59	NC_009465	GCAAAT	2	12	129028	129039	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148244283
60	NC_009465	ATCACT	2	12	130036	130047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244284
61	NC_009465	TGATTT	2	12	131185	131196	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148244285
62	NC_009465	AATACT	2	12	135633	135644	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244288
63	NC_009465	AATATC	2	12	137251	137262	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244290
64	NC_009465	CACTAC	2	12	137541	137552	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148244290
65	NC_009465	ACGGGA	2	12	141866	141877	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	148244296
66	NC_009465	TTTTAT	2	12	144859	144870	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148244298
67	NC_009465	TTTTAC	2	12	144946	144957	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148244298
68	NC_009465	TTGATT	2	12	147712	147723	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148244301
69	NC_009465	GTTATT	2	12	148935	148946	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148244302
70	NC_009465	TAATGC	2	12	151097	151108	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148244304
71	NC_009465	TTGTGT	2	12	153545	153556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244305
72	NC_009465	GTATTG	2	12	154612	154623	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148244306
73	NC_009465	ATTAAT	2	12	155967	155978	50 %	50 %	0 %	0 %	148244308
74	NC_009465	CAAAAA	2	12	156735	156746	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	148244308
75	NC_009465	AATATT	2	12	157954	157965	50 %	50 %	0 %	0 %	148244310
76	NC_009465	GATTTT	2	12	158346	158357	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148244311
77	NC_009465	TGCCAG	2	12	160671	160682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148244313
78	NC_009465	ATGGTG	2	12	165252	165263	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	148244317
79	NC_009465	TTAACA	2	12	170498	170509	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244320
80	NC_009465	ATGCTT	2	12	172891	172902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148244322
81	NC_009465	TAAAAA	2	12	173468	173479	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148244322
82	NC_009465	CAAGAG	2	12	178021	178032	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148244326
83	NC_009465	TATTAC	2	12	178038	178049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148244326
84	NC_009465	TAAAGG	2	12	181949	181960	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148244329
85	NC_009465	AGTTAA	2	12	184962	184973	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148244335
86	NC_009465	TATTGT	2	12	188178	188189	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148244343
87	NC_009465	GTAAAA	2	12	189096	189107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148244345
88	NC_009465	ATGGTA	2	12	189370	189381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244346
89	NC_009465	CAAGAG	2	12	192117	192128	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148244351
90	NC_009465	TGAGTC	2	12	197005	197016	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148244358
91	NC_009465	CATAGC	2	12	199639	199650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148244359
92	NC_009465	TAGTGT	2	12	199748	199759	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148244359
93	NC_009465	ATGAAA	2	12	205483	205494	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148244365
94	NC_009465	GAAAGT	2	12	205976	205987	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148244365
95	NC_009465	ATATTC	2	12	206731	206742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148244365
96	NC_009465	TCTAAT	2	12	208064	208075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	148244367
97	NC_009465	GGTAAT	2	12	208703	208714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244367
98	NC_009465	AAACCA	2	12	211944	211955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244371
99	NC_009465	CAAGTC	2	12	211990	212001	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148244371
100	NC_009465	GGCAAT	2	12	212644	212655	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148244372
101	NC_009465	GGTTAT	2	12	213718	213729	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148244373
102	NC_009465	GCTAAG	2	12	217343	217354	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148244376
103	NC_009465	TTGAAA	2	12	221945	221956	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148244382
104	NC_009465	GGTGCT	2	12	222415	222426	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148244382
105	NC_009465	AAATTT	2	12	222534	222545	50 %	50 %	0 %	0 %	148244382
106	NC_009465	TTACAG	2	12	228062	228073	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148244387
107	NC_009465	TTAAAG	3	18	229067	229084	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	148244387
108	NC_009465	CGTGAA	2	12	232920	232931	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148244392
109	NC_009465	AAAATA	2	12	233883	233894	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148244393
110	NC_009465	CGTGGT	2	12	234400	234411	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148244394
111	NC_009465	AGGTGC	2	12	234738	234749	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148244394
112	NC_009465	ATGGTA	2	12	235337	235348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244394
113	NC_009465	TGATCG	2	12	236296	236307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148244395
114	NC_009465	TTATTT	2	12	239573	239584	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148244398
115	NC_009465	GTATGA	2	12	244307	244318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244402
116	NC_009465	TTTCCA	2	12	245587	245598	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148244403
117	NC_009465	AAAATA	2	12	245737	245748	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	148244403
118	NC_009465	ATTAGC	2	12	245867	245878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148244403
119	NC_009465	TTTCTT	2	12	248529	248540	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	148244406
120	NC_009465	TACCTG	2	12	249285	249296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148244407
121	NC_009465	GATATT	2	12	249821	249832	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148244408
122	NC_009465	CTGGTG	2	12	251457	251468	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148244408
123	NC_009465	GTTTTA	2	12	251952	251963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148244408
124	NC_009465	TGTATC	2	12	253181	253192	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148244409
125	NC_009465	TGGATT	2	12	255244	255255	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148244411
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127	NC_009465	CTTTTG	2	12	259676	259687	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148244417
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130	NC_009465	TTCGTA	2	12	264461	264472	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148244421
131	NC_009465	TGACTA	2	12	265143	265154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148244422
132	NC_009465	AAGATA	2	12	267691	267702	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148244424
133	NC_009465	TTCGTA	2	12	270425	270436	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148244426
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136	NC_009465	TTTGTC	2	12	279961	279972	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	148244439
137	NC_009465	ATTTTT	2	12	281011	281022	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148244440
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142	NC_009465	TGGTTG	2	12	287798	287809	0 %	50 %	50 %	0 %	148244446
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144	NC_009465	TTATCG	2	12	288658	288669	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148244446
145	NC_009465	GTCAGA	2	12	289275	289286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148244447
146	NC_009465	GGTAAA	2	12	289528	289539	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	148244447
147	NC_009465	AATGCT	2	12	291945	291956	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148244448
148	NC_009465	GTATTA	2	12	303339	303350	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	148244458
149	NC_009465	TTGAGT	2	12	305714	305725	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148244460
150	NC_009465	GCTTAC	2	12	311791	311802	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148244467
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175	NC_009465	CCTTGA	2	12	357270	357281	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148244505
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217	NC_009465	ATGACC	2	12	437904	437915	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148244575
218	NC_009465	CATTTT	3	18	438266	438283	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148244575
219	NC_009465	CTGCTT	2	12	442425	442436	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	148244578
220	NC_009465	TAGTGT	3	18	445710	445727	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148244580
221	NC_009465	AGCAAT	2	12	451533	451544	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148244583
222	NC_009465	TTAATT	2	12	454434	454445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244587
223	NC_009465	AGGTAG	2	12	455639	455650	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148244587
224	NC_009465	TAAAAT	2	12	456814	456825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244588
225	NC_009465	ATGGTT	2	12	457426	457437	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	148244589
226	NC_009465	TCTTTA	2	12	458818	458829	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	148244590
227	NC_009465	TTGTTA	5	30	458939	458968	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	148244590
228	NC_009465	AATCAA	2	12	459386	459397	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148244590
229	NC_009465	ATTTTT	2	12	459670	459681	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	148244590
230	NC_009465	AGCACC	2	12	463371	463382	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	148244595
231	NC_009465	TAAATC	2	12	463632	463643	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	148244595
232	NC_009465	GCTACG	2	12	469130	469141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148244602
233	NC_009465	TTTACC	2	12	471129	471140	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	148244603
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454	NC_009465	TTGACC	2	12	961549	961560	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	148245048
455	NC_009465	CTAAAA	2	12	963572	963583	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148245051
456	NC_009465	ATTTTA	2	12	964004	964015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148245051
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459	NC_009465	ACAACC	2	12	969228	969239	50 %	0 %	0 %	50 %	148245055
460	NC_009465	ATATTA	2	12	971748	971759	50 %	50 %	0 %	0 %	148245058
461	NC_009465	TGCAAC	2	12	972812	972823	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	148245059
462	NC_009465	AAATCA	2	12	972897	972908	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	148245059
463	NC_009465	AATGCG	2	12	974989	975000	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148245060
464	NC_009465	CCGTTG	2	12	977870	977881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245062
465	NC_009465	AACGTA	2	12	984223	984234	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148245067
466	NC_009465	TGCGCT	2	12	993943	993954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148245078
467	NC_009465	ATACCA	2	12	994455	994466	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	148245079
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