MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Vesicomyosocius okutanii HA

Total Repeats: 920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009465	ATCTT	2	10	1309	1318	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009465	GAAAG	2	10	5237	5246	60 %	0 %	40 %	0 %	148244173
3	NC_009465	CACTT	2	10	6267	6276	20 %	40 %	0 %	40 %	148244174
4	NC_009465	AAATA	2	10	6732	6741	80 %	20 %	0 %	0 %	148244174
5	NC_009465	AGCAT	2	10	7003	7012	40 %	20 %	20 %	20 %	148244174
6	NC_009465	CCAAT	2	10	7858	7867	40 %	20 %	0 %	40 %	148244174
7	NC_009465	ATTTT	2	10	10383	10392	20 %	80 %	0 %	0 %	148244177
8	NC_009465	TTAGC	2	10	10456	10465	20 %	40 %	20 %	20 %	148244177
9	NC_009465	GTCAT	2	10	10685	10694	20 %	40 %	20 %	20 %	148244178
10	NC_009465	TAAAA	2	10	11625	11634	80 %	20 %	0 %	0 %	148244179
11	NC_009465	GCAAT	2	10	12126	12135	40 %	20 %	20 %	20 %	148244180
12	NC_009465	AAAAC	2	10	13629	13638	80 %	0 %	0 %	20 %	148244181
13	NC_009465	GCGGG	2	10	14944	14953	0 %	0 %	80 %	20 %	148244183
14	NC_009465	CAAAC	2	10	16734	16743	60 %	0 %	0 %	40 %	148244183
15	NC_009465	AAAGA	2	10	16798	16807	80 %	0 %	20 %	0 %	148244183
16	NC_009465	TATTT	2	10	17168	17177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009465	ATTTT	2	10	17264	17273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009465	TGGTT	2	10	20958	20967	0 %	60 %	40 %	0 %	148244186
19	NC_009465	GGTTG	2	10	22338	22347	0 %	40 %	60 %	0 %	148244188
20	NC_009465	TTTGG	2	10	22603	22612	0 %	60 %	40 %	0 %	148244188
21	NC_009465	GATTA	2	10	23187	23196	40 %	40 %	20 %	0 %	148244189
22	NC_009465	GAATT	2	10	25727	25736	40 %	40 %	20 %	0 %	148244192
23	NC_009465	AGTGA	2	10	26901	26910	40 %	20 %	40 %	0 %	148244193
24	NC_009465	TCGAT	2	10	28189	28198	20 %	40 %	20 %	20 %	148244195
25	NC_009465	AATAA	2	10	28473	28482	80 %	20 %	0 %	0 %	148244195
26	NC_009465	AAGTA	2	10	28693	28702	60 %	20 %	20 %	0 %	148244195
27	NC_009465	TAAAA	2	10	28902	28911	80 %	20 %	0 %	0 %	148244195
28	NC_009465	GTTAC	2	10	31023	31032	20 %	40 %	20 %	20 %	148244198
29	NC_009465	ATTAA	2	10	32477	32486	60 %	40 %	0 %	0 %	148244201
30	NC_009465	TAACA	2	10	32953	32962	60 %	20 %	0 %	20 %	148244201
31	NC_009465	CATTT	2	10	36618	36627	20 %	60 %	0 %	20 %	148244204
32	NC_009465	TATTC	2	10	36990	36999	20 %	60 %	0 %	20 %	148244204
33	NC_009465	ATTGT	2	10	37245	37254	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009465	CTTAT	2	10	37755	37764	20 %	60 %	0 %	20 %	148244205
35	NC_009465	TTTTA	2	10	38101	38110	20 %	80 %	0 %	0 %	148244206
36	NC_009465	TTTTC	2	10	38969	38978	0 %	80 %	0 %	20 %	148244207
37	NC_009465	CAGTT	2	10	39122	39131	20 %	40 %	20 %	20 %	148244208
38	NC_009465	TGGAA	2	10	39319	39328	40 %	20 %	40 %	0 %	148244208
39	NC_009465	TTGGT	2	10	42291	42300	0 %	60 %	40 %	0 %	148244212
40	NC_009465	TATCC	2	10	43278	43287	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009465	ATAAA	2	10	44947	44956	80 %	20 %	0 %	0 %	148244215
42	NC_009465	TATCA	2	10	46770	46779	40 %	40 %	0 %	20 %	148244216
43	NC_009465	AGTTA	2	10	47994	48003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009465	ATTGT	2	10	48404	48413	20 %	60 %	20 %	0 %	148244217
45	NC_009465	TTGGG	2	10	48578	48587	0 %	40 %	60 %	0 %	148244217
46	NC_009465	AATTG	2	10	50487	50496	40 %	40 %	20 %	0 %	148244220
47	NC_009465	TAAAA	2	10	51612	51621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009465	ATTAT	2	10	51929	51938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009465	TAAAA	2	10	52032	52041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009465	TTGAT	2	10	54229	54238	20 %	60 %	20 %	0 %	148244224
51	NC_009465	CAACA	2	10	60756	60765	60 %	0 %	0 %	40 %	148244229
52	NC_009465	AGTTT	2	10	61200	61209	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009465	TTAAT	2	10	61424	61433	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009465	TAATT	2	10	62019	62028	40 %	60 %	0 %	0 %	148244230
55	NC_009465	CTTTA	2	10	62374	62383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009465	TTTGC	2	10	63229	63238	0 %	60 %	20 %	20 %	148244231
57	NC_009465	ATTTT	2	10	63585	63594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009465	TCATT	2	10	65739	65748	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009465	TTCTT	2	10	65970	65979	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009465	TTCTT	2	10	65990	65999	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009465	TTATC	2	10	68143	68152	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009465	TTGAT	2	10	68951	68960	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009465	TAATT	2	10	69283	69292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009465	GTTGG	2	10	70237	70246	0 %	40 %	60 %	0 %	148244236
65	NC_009465	TTTTA	2	10	72536	72545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009465	TTCAA	2	10	75908	75917	40 %	40 %	0 %	20 %	148244240
67	NC_009465	AAGTA	2	10	76684	76693	60 %	20 %	20 %	0 %	148244240
68	NC_009465	TTGAT	2	10	76747	76756	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009465	TGATT	2	10	77516	77525	20 %	60 %	20 %	0 %	148244241
70	NC_009465	ATTTT	2	10	79308	79317	20 %	80 %	0 %	0 %	148244242
71	NC_009465	ATCAA	2	10	82074	82083	60 %	20 %	0 %	20 %	148244245
72	NC_009465	TATTT	2	10	82088	82097	20 %	80 %	0 %	0 %	148244245
73	NC_009465	TAAAT	2	10	82356	82365	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009465	ATGAT	2	10	83794	83803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009465	CTATT	2	10	84029	84038	20 %	60 %	0 %	20 %	148244247
76	NC_009465	TTTTA	2	10	86852	86861	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009465	ATGCA	2	10	87558	87567	40 %	20 %	20 %	20 %	148244250
78	NC_009465	TTATC	2	10	87620	87629	20 %	60 %	0 %	20 %	148244250
79	NC_009465	GTTTA	2	10	87922	87931	20 %	60 %	20 %	0 %	148244250
80	NC_009465	ATTTT	2	10	89663	89672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009465	ATTTT	2	10	90060	90069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009465	CAACA	2	10	91807	91816	60 %	0 %	0 %	40 %	148244251
83	NC_009465	GCTTA	2	10	93970	93979	20 %	40 %	20 %	20 %	148244252
84	NC_009465	TTTGT	2	10	96118	96127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009465	TGTTC	2	10	96939	96948	0 %	60 %	20 %	20 %	148244254
86	NC_009465	AGGTA	2	10	97589	97598	40 %	20 %	40 %	0 %	148244254
87	NC_009465	GTGAT	2	10	97774	97783	20 %	40 %	40 %	0 %	148244254
88	NC_009465	ATATA	2	10	97894	97903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009465	AAGAT	2	10	99258	99267	60 %	20 %	20 %	0 %	148244255
90	NC_009465	AAATT	2	10	99270	99279	60 %	40 %	0 %	0 %	148244255
91	NC_009465	TGTAT	2	10	103132	103141	20 %	60 %	20 %	0 %	148244259
92	NC_009465	AGGTT	2	10	103637	103646	20 %	40 %	40 %	0 %	148244260
93	NC_009465	ATTTT	2	10	104056	104065	20 %	80 %	0 %	0 %	148244261
94	NC_009465	TGATA	2	10	106934	106943	40 %	40 %	20 %	0 %	148244263
95	NC_009465	TTAAA	2	10	108732	108741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009465	TATCT	2	10	108872	108881	20 %	60 %	0 %	20 %	148244265
97	NC_009465	TTAAC	2	10	109159	109168	40 %	40 %	0 %	20 %	148244265
98	NC_009465	TTGTC	2	10	111337	111346	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009465	ATTGT	2	10	111553	111562	20 %	60 %	20 %	0 %	148244267
100	NC_009465	TGGGT	2	10	111723	111732	0 %	40 %	60 %	0 %	148244267
101	NC_009465	TTGAT	2	10	112677	112686	20 %	60 %	20 %	0 %	148244269
102	NC_009465	TGCAA	2	10	112969	112978	40 %	20 %	20 %	20 %	148244269
103	NC_009465	AATTT	2	10	114472	114481	40 %	60 %	0 %	0 %	148244270
104	NC_009465	GATTG	2	10	114851	114860	20 %	40 %	40 %	0 %	148244270
105	NC_009465	ATTTT	2	10	116449	116458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009465	TTTTA	2	10	116529	116538	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009465	TAAGT	2	10	116699	116708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009465	ACTAA	2	10	118299	118308	60 %	20 %	0 %	20 %	148244272
109	NC_009465	TTATT	2	10	119441	119450	20 %	80 %	0 %	0 %	148244274
110	NC_009465	ATAAA	2	10	119768	119777	80 %	20 %	0 %	0 %	148244275
111	NC_009465	TTTGA	2	10	121148	121157	20 %	60 %	20 %	0 %	148244276
112	NC_009465	TGACT	2	10	122726	122735	20 %	40 %	20 %	20 %	148244277
113	NC_009465	GTCTT	2	10	124296	124305	0 %	60 %	20 %	20 %	148244278
114	NC_009465	GGCTG	2	10	124669	124678	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009465	GAATA	2	10	128733	128742	60 %	20 %	20 %	0 %	148244283
116	NC_009465	TATTG	2	10	131438	131447	20 %	60 %	20 %	0 %	162329287
117	NC_009465	TTGGG	2	10	131503	131512	0 %	40 %	60 %	0 %	162329287
118	NC_009465	ACTCA	2	10	132254	132263	40 %	20 %	0 %	40 %	148244287
119	NC_009465	ATTTT	2	10	133772	133781	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009465	TAAAT	2	10	133787	133796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009465	ATTAG	2	10	134031	134040	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009465	ACAAA	2	10	134557	134566	80 %	0 %	0 %	20 %	148244288
123	NC_009465	ATAAA	2	10	136220	136229	80 %	20 %	0 %	0 %	148244288
124	NC_009465	GTTCC	2	10	136831	136840	0 %	40 %	20 %	40 %	148244290
125	NC_009465	AATAT	2	10	137236	137245	60 %	40 %	0 %	0 %	148244290
126	NC_009465	TTATT	2	10	137808	137817	20 %	80 %	0 %	0 %	148244290
127	NC_009465	TATTT	2	10	138489	138498	20 %	80 %	0 %	0 %	148244291
128	NC_009465	TTTGC	2	10	138792	138801	0 %	60 %	20 %	20 %	148244291
129	NC_009465	GTTTG	2	10	140123	140132	0 %	60 %	40 %	0 %	148244294
130	NC_009465	GTATG	2	10	140342	140351	20 %	40 %	40 %	0 %	148244294
131	NC_009465	TCTAT	2	10	141309	141318	20 %	60 %	0 %	20 %	148244294
132	NC_009465	TGCCT	2	10	141892	141901	0 %	40 %	20 %	40 %	148244296
133	NC_009465	AGAAA	2	10	142516	142525	80 %	0 %	20 %	0 %	148244296
134	NC_009465	ATTAA	2	10	143013	143022	60 %	40 %	0 %	0 %	148244297
135	NC_009465	ATTTT	2	10	143431	143440	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009465	TTTGT	2	10	147017	147026	0 %	80 %	20 %	0 %	148244300
137	NC_009465	ATAAA	2	10	147412	147421	80 %	20 %	0 %	0 %	148244300
138	NC_009465	TAATG	2	10	150037	150046	40 %	40 %	20 %	0 %	148244303
139	NC_009465	AGTAA	2	10	152787	152796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009465	GTATT	2	10	156888	156897	20 %	60 %	20 %	0 %	148244309
141	NC_009465	ATTTA	2	10	157231	157240	40 %	60 %	0 %	0 %	148244309
142	NC_009465	ACTAG	2	10	157268	157277	40 %	20 %	20 %	20 %	148244309
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146	NC_009465	GTTTG	2	10	159991	160000	0 %	60 %	40 %	0 %	148244312
147	NC_009465	TCTTT	2	10	162646	162655	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_009465	TGATA	2	10	163118	163127	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009465	TGATG	2	10	163493	163502	20 %	40 %	40 %	0 %	148244315
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156	NC_009465	ATATA	2	10	176518	176527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_009465	ATTAT	2	10	183548	183557	40 %	60 %	0 %	0 %	148244332
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172	NC_009465	TAATT	2	10	196765	196774	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_009465	TAAAT	2	10	198316	198325	60 %	40 %	0 %	0 %	148244358
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185	NC_009465	ATTTT	2	10	210284	210293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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