MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 2051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009464	TACAG	2	10	1495	1504	40 %	20 %	20 %	20 %	147918684
2	NC_009464	GCAGA	2	10	1535	1544	40 %	0 %	40 %	20 %	147918684
3	NC_009464	CCACT	2	10	3876	3885	20 %	20 %	0 %	60 %	147918686
4	NC_009464	CCGGG	2	10	4558	4567	0 %	0 %	60 %	40 %	147918686
5	NC_009464	ATATT	3	15	6849	6863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009464	GGACA	2	10	8046	8055	40 %	0 %	40 %	20 %	147918689
7	NC_009464	GCCGG	2	10	10705	10714	0 %	0 %	60 %	40 %	147918692
8	NC_009464	TCTCC	2	10	10859	10868	0 %	40 %	0 %	60 %	147918692
9	NC_009464	CAAGG	2	10	12522	12531	40 %	0 %	40 %	20 %	147918693
10	NC_009464	TCCAG	2	10	14634	14643	20 %	20 %	20 %	40 %	147918695
11	NC_009464	CGCTG	2	10	15864	15873	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_009464	CAGCG	2	10	16113	16122	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009464	GCCGG	2	10	16408	16417	0 %	0 %	60 %	40 %	147918697
14	NC_009464	CAGCT	2	10	16570	16579	20 %	20 %	20 %	40 %	147918697
15	NC_009464	TTATA	2	10	16966	16975	40 %	60 %	0 %	0 %	147918698
16	NC_009464	CGAGG	2	10	20292	20301	20 %	0 %	60 %	20 %	147918702
17	NC_009464	GGCAG	2	10	20909	20918	20 %	0 %	60 %	20 %	147918703
18	NC_009464	GGCGA	2	10	21079	21088	20 %	0 %	60 %	20 %	147918703
19	NC_009464	TCTTT	2	10	23425	23434	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_009464	GCGCG	2	10	23927	23936	0 %	0 %	60 %	40 %	147918706
21	NC_009464	AAGAA	2	10	24980	24989	80 %	0 %	20 %	0 %	147918708
22	NC_009464	CTGTA	2	10	28447	28456	20 %	40 %	20 %	20 %	147918712
23	NC_009464	CCGGA	2	10	29437	29446	20 %	0 %	40 %	40 %	147918713
24	NC_009464	GGCCT	2	10	29765	29774	0 %	20 %	40 %	40 %	147918714
25	NC_009464	CTGCC	2	10	29967	29976	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009464	AGTAG	2	10	32317	32326	40 %	20 %	40 %	0 %	147918715
27	NC_009464	TGGAT	2	10	32922	32931	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009464	GGGAT	2	10	33207	33216	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009464	CGCTG	2	10	36950	36959	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009464	CGCTG	2	10	37003	37012	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_009464	CGCTG	2	10	37056	37065	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009464	CAGCG	2	10	37303	37312	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_009464	GGCTG	2	10	37978	37987	0 %	20 %	60 %	20 %	147918719
34	NC_009464	ACATC	2	10	38428	38437	40 %	20 %	0 %	40 %	147918719
35	NC_009464	TGCTG	2	10	40726	40735	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009464	CGCTG	2	10	40779	40788	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009464	CAGCG	2	10	41030	41039	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009464	ATTTC	2	10	44316	44325	20 %	60 %	0 %	20 %	147918725
39	NC_009464	CGCTG	2	10	44751	44760	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_009464	CAGCG	2	10	44901	44910	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009464	TATAA	2	10	48116	48125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009464	CATGC	2	10	48502	48511	20 %	20 %	20 %	40 %	147918729
43	NC_009464	AGCTT	2	10	51147	51156	20 %	40 %	20 %	20 %	147918730
44	NC_009464	GTATA	2	10	51656	51665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009464	ACAGC	2	10	52055	52064	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009464	GCTCA	2	10	52820	52829	20 %	20 %	20 %	40 %	147918731
47	NC_009464	CAGAT	2	10	58017	58026	40 %	20 %	20 %	20 %	147918735
48	NC_009464	TCTTT	2	10	58206	58215	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009464	CTATT	2	10	61978	61987	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009464	CTGCC	2	10	63427	63436	0 %	20 %	20 %	60 %	147918741
51	NC_009464	TCACG	2	10	66245	66254	20 %	20 %	20 %	40 %	147918744
52	NC_009464	CCTGG	2	10	67883	67892	0 %	20 %	40 %	40 %	147918745
53	NC_009464	GCTGT	2	10	69515	69524	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009464	CGCTG	2	10	69587	69596	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009464	CAGCG	2	10	69852	69861	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_009464	CGCTG	2	10	79370	79379	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_009464	TTCGT	2	10	79895	79904	0 %	60 %	20 %	20 %	147918756
58	NC_009464	GGAGG	2	10	83022	83031	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009464	ACTGG	2	10	83608	83617	20 %	20 %	40 %	20 %	147918761
60	NC_009464	GCTTT	2	10	85624	85633	0 %	60 %	20 %	20 %	147918763
61	NC_009464	CTGTG	2	10	87710	87719	0 %	40 %	40 %	20 %	147918765
62	NC_009464	CGGCA	2	10	88293	88302	20 %	0 %	40 %	40 %	147918766
63	NC_009464	CGGCA	2	10	88928	88937	20 %	0 %	40 %	40 %	147918767
64	NC_009464	CTGGA	2	10	89607	89616	20 %	20 %	40 %	20 %	147918767
65	NC_009464	CGCTG	2	10	92775	92784	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009464	CAGCG	2	10	93382	93391	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009464	ATCGC	2	10	93398	93407	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_009464	CTCGA	2	10	93626	93635	20 %	20 %	20 %	40 %	147918772
69	NC_009464	GGCGC	2	10	95566	95575	0 %	0 %	60 %	40 %	147918774
70	NC_009464	ATCTG	2	10	96372	96381	20 %	40 %	20 %	20 %	147918775
71	NC_009464	GAAGA	2	10	101706	101715	60 %	0 %	40 %	0 %	147918779
72	NC_009464	GTCCT	2	10	104319	104328	0 %	40 %	20 %	40 %	147918782
73	NC_009464	TGTCC	2	10	104530	104539	0 %	40 %	20 %	40 %	147918782
74	NC_009464	ACTGG	2	10	107815	107824	20 %	20 %	40 %	20 %	147918784
75	NC_009464	GCTTT	2	10	115179	115188	0 %	60 %	20 %	20 %	147918790
76	NC_009464	ACGAT	2	10	116296	116305	40 %	20 %	20 %	20 %	147918790
77	NC_009464	GAAAA	2	10	119072	119081	80 %	0 %	20 %	0 %	147918793
78	NC_009464	CTGGC	2	10	124541	124550	0 %	20 %	40 %	40 %	147918798
79	NC_009464	CCGCC	2	10	127665	127674	0 %	0 %	20 %	80 %	147918802
80	NC_009464	ACAGG	2	10	128515	128524	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009464	TGCTC	2	10	131148	131157	0 %	40 %	20 %	40 %	147918806
82	NC_009464	CACTT	2	10	131224	131233	20 %	40 %	0 %	40 %	147918806
83	NC_009464	TCAGG	2	10	133549	133558	20 %	20 %	40 %	20 %	147918809
84	NC_009464	CTCTG	2	10	134030	134039	0 %	40 %	20 %	40 %	147918810
85	NC_009464	GTAGC	2	10	134809	134818	20 %	20 %	40 %	20 %	147918811
86	NC_009464	CCTGC	2	10	139428	139437	0 %	20 %	20 %	60 %	147918815
87	NC_009464	TGTCC	2	10	141002	141011	0 %	40 %	20 %	40 %	147918816
88	NC_009464	TCTGC	2	10	142012	142021	0 %	40 %	20 %	40 %	147918817
89	NC_009464	CAGTC	2	10	143391	143400	20 %	20 %	20 %	40 %	147918818
90	NC_009464	GCTGG	2	10	147144	147153	0 %	20 %	60 %	20 %	147918821
91	NC_009464	GACGG	2	10	150211	150220	20 %	0 %	60 %	20 %	147918823
92	NC_009464	TACTG	2	10	150792	150801	20 %	40 %	20 %	20 %	147918824
93	NC_009464	TGCTG	2	10	151562	151571	0 %	40 %	40 %	20 %	147918825
94	NC_009464	TGGGG	2	10	151631	151640	0 %	20 %	80 %	0 %	147918825
95	NC_009464	GGTCT	2	10	152624	152633	0 %	40 %	40 %	20 %	147918826
96	NC_009464	AATGG	2	10	153992	154001	40 %	20 %	40 %	0 %	147918827
97	NC_009464	TCCGC	2	10	156158	156167	0 %	20 %	20 %	60 %	147918828
98	NC_009464	GTTCA	2	10	158900	158909	20 %	40 %	20 %	20 %	147918831
99	NC_009464	ATCCT	2	10	159441	159450	20 %	40 %	0 %	40 %	147918832
100	NC_009464	CAAGG	2	10	160835	160844	40 %	0 %	40 %	20 %	147918834
101	NC_009464	TTTGA	2	10	162040	162049	20 %	60 %	20 %	0 %	147918835
102	NC_009464	TGGTG	2	10	163737	163746	0 %	40 %	60 %	0 %	147918836
103	NC_009464	TATCT	2	10	165755	165764	20 %	60 %	0 %	20 %	147918839
104	NC_009464	TACCC	2	10	169207	169216	20 %	20 %	0 %	60 %	147918842
105	NC_009464	CTGTG	2	10	170095	170104	0 %	40 %	40 %	20 %	147918843
106	NC_009464	AAGCG	2	10	171241	171250	40 %	0 %	40 %	20 %	147918844
107	NC_009464	CGGCA	2	10	171427	171436	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_009464	GGCAG	2	10	172030	172039	20 %	0 %	60 %	20 %	147918845
109	NC_009464	TCTTT	2	10	173840	173849	0 %	80 %	0 %	20 %	147918847
110	NC_009464	TTTGC	2	10	175077	175086	0 %	60 %	20 %	20 %	147918849
111	NC_009464	ATGGA	2	10	176082	176091	40 %	20 %	40 %	0 %	147918850
112	NC_009464	TCAGG	2	10	177941	177950	20 %	20 %	40 %	20 %	147918852
113	NC_009464	AAGTC	2	10	179350	179359	40 %	20 %	20 %	20 %	147918852
114	NC_009464	GGGCT	2	10	180161	180170	0 %	20 %	60 %	20 %	147918853
115	NC_009464	AGTGA	2	10	180899	180908	40 %	20 %	40 %	0 %	147918854
116	NC_009464	TATGA	2	10	184266	184275	40 %	40 %	20 %	0 %	147918858
117	NC_009464	CGGTT	2	10	185867	185876	0 %	40 %	40 %	20 %	147918859
118	NC_009464	GGTGT	2	10	186327	186336	0 %	40 %	60 %	0 %	147918859
119	NC_009464	GGTGT	2	10	188778	188787	0 %	40 %	60 %	0 %	147918861
120	NC_009464	GCTTT	2	10	189720	189729	0 %	60 %	20 %	20 %	147918862
121	NC_009464	TCTTT	2	10	189973	189982	0 %	80 %	0 %	20 %	147918862
122	NC_009464	AGGAC	2	10	191906	191915	40 %	0 %	40 %	20 %	147918864
123	NC_009464	CCAGT	2	10	192650	192659	20 %	20 %	20 %	40 %	147918865
124	NC_009464	CCAGG	2	10	193840	193849	20 %	0 %	40 %	40 %	147918866
125	NC_009464	TATCA	2	10	195200	195209	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009464	TCTTA	2	10	196332	196341	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009464	TGCCT	2	10	199847	199856	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_009464	CGCTG	2	10	199890	199899	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_009464	CGCTG	2	10	199966	199975	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_009464	CAGCG	2	10	200229	200238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_009464	CAGCG	2	10	200282	200291	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_009464	CCGGG	2	10	205301	205310	0 %	0 %	60 %	40 %	147918876
133	NC_009464	CTGAT	2	10	206012	206021	20 %	40 %	20 %	20 %	147918877
134	NC_009464	TTTAA	2	10	207118	207127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009464	AATCG	2	10	207999	208008	40 %	20 %	20 %	20 %	147918878
136	NC_009464	TTAAT	2	10	209720	209729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009464	ATACG	2	10	209781	209790	40 %	20 %	20 %	20 %	147918880
138	NC_009464	AACAG	2	10	209832	209841	60 %	0 %	20 %	20 %	147918880
139	NC_009464	GCTGC	2	10	210100	210109	0 %	20 %	40 %	40 %	147918880
140	NC_009464	ATTTT	2	10	210441	210450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009464	TTACT	2	10	212093	212102	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_009464	AGCCC	2	10	215559	215568	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
143	NC_009464	TCTTT	2	10	223368	223377	0 %	80 %	0 %	20 %	147918895
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155	NC_009464	CAGCG	2	10	239272	239281	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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261	NC_009464	CTGCA	2	10	434352	434361	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
262	NC_009464	CTGTG	2	10	434795	434804	0 %	40 %	40 %	20 %	147919091
263	NC_009464	GGCCT	2	10	437538	437547	0 %	20 %	40 %	40 %	147919094
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265	NC_009464	ATGAG	2	10	444044	444053	40 %	20 %	40 %	0 %	147919101
266	NC_009464	CCCAG	2	10	445572	445581	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
267	NC_009464	GTCCG	2	10	445828	445837	0 %	20 %	40 %	40 %	147919102
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392	NC_009464	CGCTG	2	10	589453	589462	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
393	NC_009464	CGCTG	2	10	589505	589514	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
394	NC_009464	GATTC	2	10	589587	589596	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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396	NC_009464	CAGCG	2	10	589830	589839	20 %	0 %	40 %	40 %	147919245
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400	NC_009464	CTCTT	2	10	600266	600275	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
401	NC_009464	CGGCA	2	10	602004	602013	20 %	0 %	40 %	40 %	147919260
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