MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 1451

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009464	TACAG	2	10	1495	1504	40 %	20 %	20 %	20 %	147918684
2	NC_009464	GCAGA	2	10	1535	1544	40 %	0 %	40 %	20 %	147918684
3	NC_009464	CCACT	2	10	3876	3885	20 %	20 %	0 %	60 %	147918686
4	NC_009464	CCGGG	2	10	4558	4567	0 %	0 %	60 %	40 %	147918686
5	NC_009464	GGACA	2	10	8046	8055	40 %	0 %	40 %	20 %	147918689
6	NC_009464	GCCGG	2	10	10705	10714	0 %	0 %	60 %	40 %	147918692
7	NC_009464	TCTCC	2	10	10859	10868	0 %	40 %	0 %	60 %	147918692
8	NC_009464	CAAGG	2	10	12522	12531	40 %	0 %	40 %	20 %	147918693
9	NC_009464	TCCAG	2	10	14634	14643	20 %	20 %	20 %	40 %	147918695
10	NC_009464	GCCGG	2	10	16408	16417	0 %	0 %	60 %	40 %	147918697
11	NC_009464	CAGCT	2	10	16570	16579	20 %	20 %	20 %	40 %	147918697
12	NC_009464	TTATA	2	10	16966	16975	40 %	60 %	0 %	0 %	147918698
13	NC_009464	CGAGG	2	10	20292	20301	20 %	0 %	60 %	20 %	147918702
14	NC_009464	GGCAG	2	10	20909	20918	20 %	0 %	60 %	20 %	147918703
15	NC_009464	GGCGA	2	10	21079	21088	20 %	0 %	60 %	20 %	147918703
16	NC_009464	GCGCG	2	10	23927	23936	0 %	0 %	60 %	40 %	147918706
17	NC_009464	AAGAA	2	10	24980	24989	80 %	0 %	20 %	0 %	147918708
18	NC_009464	CTGTA	2	10	28447	28456	20 %	40 %	20 %	20 %	147918712
19	NC_009464	CCGGA	2	10	29437	29446	20 %	0 %	40 %	40 %	147918713
20	NC_009464	GGCCT	2	10	29765	29774	0 %	20 %	40 %	40 %	147918714
21	NC_009464	AGTAG	2	10	32317	32326	40 %	20 %	40 %	0 %	147918715
22	NC_009464	GGCTG	2	10	37978	37987	0 %	20 %	60 %	20 %	147918719
23	NC_009464	ACATC	2	10	38428	38437	40 %	20 %	0 %	40 %	147918719
24	NC_009464	ATTTC	2	10	44316	44325	20 %	60 %	0 %	20 %	147918725
25	NC_009464	CATGC	2	10	48502	48511	20 %	20 %	20 %	40 %	147918729
26	NC_009464	AGCTT	2	10	51147	51156	20 %	40 %	20 %	20 %	147918730
27	NC_009464	GCTCA	2	10	52820	52829	20 %	20 %	20 %	40 %	147918731
28	NC_009464	CAGAT	2	10	58017	58026	40 %	20 %	20 %	20 %	147918735
29	NC_009464	CTGCC	2	10	63427	63436	0 %	20 %	20 %	60 %	147918741
30	NC_009464	TCACG	2	10	66245	66254	20 %	20 %	20 %	40 %	147918744
31	NC_009464	CCTGG	2	10	67883	67892	0 %	20 %	40 %	40 %	147918745
32	NC_009464	TTCGT	2	10	79895	79904	0 %	60 %	20 %	20 %	147918756
33	NC_009464	ACTGG	2	10	83608	83617	20 %	20 %	40 %	20 %	147918761
34	NC_009464	GCTTT	2	10	85624	85633	0 %	60 %	20 %	20 %	147918763
35	NC_009464	CTGTG	2	10	87710	87719	0 %	40 %	40 %	20 %	147918765
36	NC_009464	CGGCA	2	10	88293	88302	20 %	0 %	40 %	40 %	147918766
37	NC_009464	CGGCA	2	10	88928	88937	20 %	0 %	40 %	40 %	147918767
38	NC_009464	CTGGA	2	10	89607	89616	20 %	20 %	40 %	20 %	147918767
39	NC_009464	CTCGA	2	10	93626	93635	20 %	20 %	20 %	40 %	147918772
40	NC_009464	GGCGC	2	10	95566	95575	0 %	0 %	60 %	40 %	147918774
41	NC_009464	ATCTG	2	10	96372	96381	20 %	40 %	20 %	20 %	147918775
42	NC_009464	GAAGA	2	10	101706	101715	60 %	0 %	40 %	0 %	147918779
43	NC_009464	GTCCT	2	10	104319	104328	0 %	40 %	20 %	40 %	147918782
44	NC_009464	TGTCC	2	10	104530	104539	0 %	40 %	20 %	40 %	147918782
45	NC_009464	ACTGG	2	10	107815	107824	20 %	20 %	40 %	20 %	147918784
46	NC_009464	GCTTT	2	10	115179	115188	0 %	60 %	20 %	20 %	147918790
47	NC_009464	ACGAT	2	10	116296	116305	40 %	20 %	20 %	20 %	147918790
48	NC_009464	GAAAA	2	10	119072	119081	80 %	0 %	20 %	0 %	147918793
49	NC_009464	CTGGC	2	10	124541	124550	0 %	20 %	40 %	40 %	147918798
50	NC_009464	CCGCC	2	10	127665	127674	0 %	0 %	20 %	80 %	147918802
51	NC_009464	TGCTC	2	10	131148	131157	0 %	40 %	20 %	40 %	147918806
52	NC_009464	CACTT	2	10	131224	131233	20 %	40 %	0 %	40 %	147918806
53	NC_009464	TCAGG	2	10	133549	133558	20 %	20 %	40 %	20 %	147918809
54	NC_009464	CTCTG	2	10	134030	134039	0 %	40 %	20 %	40 %	147918810
55	NC_009464	GTAGC	2	10	134809	134818	20 %	20 %	40 %	20 %	147918811
56	NC_009464	CCTGC	2	10	139428	139437	0 %	20 %	20 %	60 %	147918815
57	NC_009464	TGTCC	2	10	141002	141011	0 %	40 %	20 %	40 %	147918816
58	NC_009464	TCTGC	2	10	142012	142021	0 %	40 %	20 %	40 %	147918817
59	NC_009464	CAGTC	2	10	143391	143400	20 %	20 %	20 %	40 %	147918818
60	NC_009464	GCTGG	2	10	147144	147153	0 %	20 %	60 %	20 %	147918821
61	NC_009464	GACGG	2	10	150211	150220	20 %	0 %	60 %	20 %	147918823
62	NC_009464	TACTG	2	10	150792	150801	20 %	40 %	20 %	20 %	147918824
63	NC_009464	TGCTG	2	10	151562	151571	0 %	40 %	40 %	20 %	147918825
64	NC_009464	TGGGG	2	10	151631	151640	0 %	20 %	80 %	0 %	147918825
65	NC_009464	GGTCT	2	10	152624	152633	0 %	40 %	40 %	20 %	147918826
66	NC_009464	AATGG	2	10	153992	154001	40 %	20 %	40 %	0 %	147918827
67	NC_009464	TCCGC	2	10	156158	156167	0 %	20 %	20 %	60 %	147918828
68	NC_009464	GTTCA	2	10	158900	158909	20 %	40 %	20 %	20 %	147918831
69	NC_009464	ATCCT	2	10	159441	159450	20 %	40 %	0 %	40 %	147918832
70	NC_009464	CAAGG	2	10	160835	160844	40 %	0 %	40 %	20 %	147918834
71	NC_009464	TTTGA	2	10	162040	162049	20 %	60 %	20 %	0 %	147918835
72	NC_009464	TGGTG	2	10	163737	163746	0 %	40 %	60 %	0 %	147918836
73	NC_009464	TATCT	2	10	165755	165764	20 %	60 %	0 %	20 %	147918839
74	NC_009464	TACCC	2	10	169207	169216	20 %	20 %	0 %	60 %	147918842
75	NC_009464	CTGTG	2	10	170095	170104	0 %	40 %	40 %	20 %	147918843
76	NC_009464	AAGCG	2	10	171241	171250	40 %	0 %	40 %	20 %	147918844
77	NC_009464	GGCAG	2	10	172030	172039	20 %	0 %	60 %	20 %	147918845
78	NC_009464	TCTTT	2	10	173840	173849	0 %	80 %	0 %	20 %	147918847
79	NC_009464	TTTGC	2	10	175077	175086	0 %	60 %	20 %	20 %	147918849
80	NC_009464	ATGGA	2	10	176082	176091	40 %	20 %	40 %	0 %	147918850
81	NC_009464	TCAGG	2	10	177941	177950	20 %	20 %	40 %	20 %	147918852
82	NC_009464	AAGTC	2	10	179350	179359	40 %	20 %	20 %	20 %	147918852
83	NC_009464	GGGCT	2	10	180161	180170	0 %	20 %	60 %	20 %	147918853
84	NC_009464	AGTGA	2	10	180899	180908	40 %	20 %	40 %	0 %	147918854
85	NC_009464	TATGA	2	10	184266	184275	40 %	40 %	20 %	0 %	147918858
86	NC_009464	CGGTT	2	10	185867	185876	0 %	40 %	40 %	20 %	147918859
87	NC_009464	GGTGT	2	10	186327	186336	0 %	40 %	60 %	0 %	147918859
88	NC_009464	GGTGT	2	10	188778	188787	0 %	40 %	60 %	0 %	147918861
89	NC_009464	GCTTT	2	10	189720	189729	0 %	60 %	20 %	20 %	147918862
90	NC_009464	TCTTT	2	10	189973	189982	0 %	80 %	0 %	20 %	147918862
91	NC_009464	AGGAC	2	10	191906	191915	40 %	0 %	40 %	20 %	147918864
92	NC_009464	CCAGT	2	10	192650	192659	20 %	20 %	20 %	40 %	147918865
93	NC_009464	CCAGG	2	10	193840	193849	20 %	0 %	40 %	40 %	147918866
94	NC_009464	CCGGG	2	10	205301	205310	0 %	0 %	60 %	40 %	147918876
95	NC_009464	CTGAT	2	10	206012	206021	20 %	40 %	20 %	20 %	147918877
96	NC_009464	AATCG	2	10	207999	208008	40 %	20 %	20 %	20 %	147918878
97	NC_009464	ATACG	2	10	209781	209790	40 %	20 %	20 %	20 %	147918880
98	NC_009464	AACAG	2	10	209832	209841	60 %	0 %	20 %	20 %	147918880
99	NC_009464	GCTGC	2	10	210100	210109	0 %	20 %	40 %	40 %	147918880
100	NC_009464	TCTTT	2	10	223368	223377	0 %	80 %	0 %	20 %	147918895
101	NC_009464	TGGCG	2	10	228120	228129	0 %	20 %	60 %	20 %	147918899
102	NC_009464	GCTCC	2	10	228417	228426	0 %	20 %	20 %	60 %	147918899
103	NC_009464	CATCG	2	10	229215	229224	20 %	20 %	20 %	40 %	147918900
104	NC_009464	ATACT	2	10	234852	234861	40 %	40 %	0 %	20 %	147918905
105	NC_009464	GGCCG	2	10	235928	235937	0 %	0 %	60 %	40 %	147918908
106	NC_009464	GAAAA	2	10	237200	237209	80 %	0 %	20 %	0 %	147918910
107	NC_009464	CGCTG	2	10	237673	237682	0 %	20 %	40 %	40 %	147918911
108	NC_009464	CTGAT	2	10	240122	240131	20 %	40 %	20 %	20 %	147918913
109	NC_009464	CAGCA	2	10	240965	240974	40 %	0 %	20 %	40 %	147918914
110	NC_009464	CTCTT	2	10	244654	244663	0 %	60 %	0 %	40 %	147918917
111	NC_009464	ATTGT	2	10	247036	247045	20 %	60 %	20 %	0 %	147918923
112	NC_009464	GAAAG	2	10	247151	247160	60 %	0 %	40 %	0 %	147918923
113	NC_009464	ATCTT	2	10	249636	249645	20 %	60 %	0 %	20 %	147918925
114	NC_009464	AAGGA	2	10	250559	250568	60 %	0 %	40 %	0 %	147918926
115	NC_009464	TCCCA	2	10	254223	254232	20 %	20 %	0 %	60 %	147918929
116	NC_009464	CGAGG	2	10	267344	267353	20 %	0 %	60 %	20 %	147918942
117	NC_009464	CGATC	2	10	268250	268259	20 %	20 %	20 %	40 %	147918943
118	NC_009464	TTGCT	2	10	268908	268917	0 %	60 %	20 %	20 %	147918944
119	NC_009464	GTACG	2	10	272639	272648	20 %	20 %	40 %	20 %	147918947
120	NC_009464	TTCCG	2	10	272690	272699	0 %	40 %	20 %	40 %	147918947
121	NC_009464	GTCCT	2	10	274071	274080	0 %	40 %	20 %	40 %	147918948
122	NC_009464	CATCG	2	10	275766	275775	20 %	20 %	20 %	40 %	147918951
123	NC_009464	GCACA	2	10	279795	279804	40 %	0 %	20 %	40 %	147918954
124	NC_009464	TGGGC	2	10	281520	281529	0 %	20 %	60 %	20 %	147918956
125	NC_009464	CGTCC	2	10	282405	282414	0 %	20 %	20 %	60 %	147918957
126	NC_009464	TAGAG	2	10	282884	282893	40 %	20 %	40 %	0 %	147918957
127	NC_009464	GCAGG	2	10	284565	284574	20 %	0 %	60 %	20 %	147918958
128	NC_009464	AGGTG	2	10	291386	291395	20 %	20 %	60 %	0 %	147918963
129	NC_009464	TCTCT	2	10	293153	293162	0 %	60 %	0 %	40 %	147918964
130	NC_009464	GCAGC	2	10	293171	293180	20 %	0 %	40 %	40 %	147918964
131	NC_009464	AACAA	2	10	293630	293639	80 %	0 %	0 %	20 %	147918964
132	NC_009464	CTCGC	2	10	294522	294531	0 %	20 %	20 %	60 %	147918966
133	NC_009464	GGCCT	2	10	296516	296525	0 %	20 %	40 %	40 %	147918968
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