MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 1294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009464	ATCG	2	8	1283	1290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009464	GTGA	2	8	1350	1357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009464	ATCG	2	8	3691	3698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009464	TCTT	2	8	10287	10294	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009464	GTCT	2	8	14114	14121	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009464	TGAT	2	8	15902	15909	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009464	GACG	2	8	18011	18018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009464	GCGG	2	8	19351	19358	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009464	CAGC	2	8	21829	21836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009464	CGGC	2	8	22062	22069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009464	ACTG	2	8	24886	24893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009464	AGAA	2	8	30021	30028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009464	TGCC	2	8	33018	33025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009464	GCGA	2	8	33133	33140	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009464	AACG	2	8	33160	33167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009464	GATT	2	8	37095	37102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009464	AGCA	2	8	37181	37188	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009464	CTAT	2	8	37245	37252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009464	AATC	2	8	40993	41000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009464	CTTT	2	8	43278	43285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009464	GGCG	2	8	44959	44966	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009464	AGCA	2	8	47295	47302	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009464	GGGC	2	8	47343	47350	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009464	TAAT	2	8	48146	48153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009464	GCCG	2	8	51478	51485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009464	CGTA	2	8	51505	51512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009464	GCTC	2	8	51626	51633	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009464	CTGC	2	8	58156	58163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009464	AATA	2	8	60105	60112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009464	TGAT	2	8	69625	69632	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009464	CAAT	2	8	69725	69732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009464	TGTC	2	8	69984	69991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009464	TCTG	2	8	72729	72736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009464	CTAT	2	8	73003	73010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009464	TGAC	2	8	73042	73049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009464	CAAA	2	8	75190	75197	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009464	TATT	2	8	75440	75447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009464	CCTG	2	8	78009	78016	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009464	ATCA	2	8	78520	78527	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009464	CCGC	2	8	79502	79509	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_009464	GGCC	2	8	82156	82163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009464	AGAT	2	8	84654	84661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009464	TTTA	2	8	86116	86123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009464	ATAA	2	8	87944	87951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009464	CTTT	2	8	92989	92996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009464	GGGA	2	8	93198	93205	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009464	GGCG	2	8	93440	93447	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009464	TTCT	2	8	94039	94046	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009464	ATTT	2	8	94144	94151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009464	CTAA	2	8	96706	96713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009464	ATTA	2	8	96865	96872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009464	GCGA	2	8	100432	100439	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009464	TAAA	2	8	100515	100522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009464	TACA	2	8	105149	105156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009464	CTAC	2	8	105191	105198	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009464	CTGC	2	8	110962	110969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009464	GTCA	2	8	114875	114882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009464	TATT	2	8	128480	128487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009464	ATTA	2	8	134014	134021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009464	TCCG	2	8	136130	136137	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009464	ATGT	2	8	136207	136214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009464	CTGC	2	8	136515	136522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009464	TTCT	2	8	140643	140650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009464	CTGC	2	8	141258	141265	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009464	CTTC	2	8	141574	141581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009464	TACT	2	8	141917	141924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009464	AACG	2	8	143249	143256	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009464	TACG	2	8	157026	157033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009464	GATT	2	8	161062	161069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009464	ATTG	2	8	161082	161089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009464	CCAG	2	8	165343	165350	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009464	GTCA	2	8	166020	166027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009464	CTGA	2	8	166968	166975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009464	GGAA	2	8	171397	171404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009464	TTAG	2	8	171487	171494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009464	TGAG	2	8	171510	171517	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009464	ATAA	2	8	185093	185100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009464	TGCC	2	8	186858	186865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009464	CTGT	2	8	186920	186927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009464	CCCG	2	8	187082	187089	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_009464	TAAT	2	8	189225	189232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009464	AAGT	2	8	190847	190854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009464	ATTT	2	8	194044	194051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009464	AACT	2	8	194905	194912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_009464	AGGG	2	8	196125	196132	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009464	GATT	2	8	200005	200012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009464	CATA	2	8	204780	204787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009464	AAAT	2	8	207161	207168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009464	AATT	2	8	207286	207293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009464	TTTG	2	8	207298	207305	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009464	GTCA	2	8	209647	209654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009464	ATTG	2	8	215089	215096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009464	GATT	2	8	215192	215199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009464	TGCG	2	8	215399	215406	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009464	CGGA	2	8	220372	220379	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009464	GCCT	2	8	220729	220736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009464	CAAG	2	8	222152	222159	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009464	ATAG	2	8	223872	223879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009464	TGCT	2	8	236945	236952	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009464	AAAT	2	8	237021	237028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009464	CGCC	2	8	237617	237624	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_009464	TTTC	2	8	250127	250134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009464	TCGC	2	8	251162	251169	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009464	TTTA	2	8	251287	251294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009464	AAGC	2	8	257836	257843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009464	TTAT	2	8	257947	257954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009464	TTAC	2	8	263549	263556	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009464	GCTA	2	8	265961	265968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009464	CGCC	2	8	275096	275103	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_009464	TATG	2	8	285288	285295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009464	CGAT	2	8	286653	286660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009464	AATA	2	8	289419	289426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009464	GATA	2	8	292433	292440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009464	CATT	2	8	294774	294781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009464	CGAA	2	8	295811	295818	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009464	GCCA	2	8	296760	296767	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009464	GGCC	2	8	297541	297548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009464	GATT	2	8	298884	298891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009464	ACTG	2	8	306441	306448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009464	GGAT	2	8	306606	306613	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009464	ACAT	2	8	308847	308854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009464	AAAT	2	8	308993	309000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009464	GCCC	2	8	309745	309752	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_009464	AATT	2	8	309855	309862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009464	ATTT	2	8	315572	315579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009464	ACAA	2	8	319584	319591	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009464	ACGC	2	8	320460	320467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009464	CGGG	2	8	320575	320582	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009464	CAGC	2	8	320805	320812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009464	TGAA	2	8	321251	321258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009464	CATG	2	8	321618	321625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009464	CACC	2	8	321782	321789	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_009464	TCAA	2	8	325508	325515	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009464	TGCC	2	8	327932	327939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009464	TGAT	2	8	329682	329689	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009464	TCAG	2	8	332473	332480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009464	AAGT	2	8	333816	333823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009464	AAGA	2	8	337202	337209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009464	AGTG	2	8	338160	338167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009464	AGAT	2	8	340762	340769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009464	TAAT	2	8	343044	343051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009464	ATAA	2	8	345813	345820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009464	AAAT	2	8	345853	345860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009464	GCCA	2	8	345920	345927	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009464	TATG	2	8	345987	345994	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009464	ATAA	2	8	346010	346017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009464	AAAG	2	8	349994	350001	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009464	TGGC	2	8	356769	356776	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009464	CACC	2	8	359235	359242	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
150	NC_009464	AATA	2	8	359873	359880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009464	TATC	2	8	364135	364142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009464	CTTG	2	8	364419	364426	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_009464	TATC	2	8	365482	365489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_009464	TTTA	2	8	371772	371779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_009464	CGCC	2	8	381368	381375	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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161	NC_009464	TCCG	2	8	383615	383622	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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446	NC_009464	ATTA	2	8	1139814	1139821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_009464	CGCC	2	8	1140069	1140076	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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450	NC_009464	TGGC	2	8	1161862	1161869	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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454	NC_009464	ATCG	2	8	1165011	1165018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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460	NC_009464	TGAG	2	8	1173444	1173451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
461	NC_009464	AGCG	2	8	1176602	1176609	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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463	NC_009464	GGCG	2	8	1179439	1179446	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
464	NC_009464	AGAA	2	8	1190494	1190501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
465	NC_009464	GGCG	2	8	1191130	1191137	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
466	NC_009464	TGGC	2	8	1192564	1192571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
467	NC_009464	ATTC	2	8	1192819	1192826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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476	NC_009464	AGCC	2	8	1216633	1216640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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481	NC_009464	CGGT	2	8	1233290	1233297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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483	NC_009464	GTAA	2	8	1240425	1240432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
484	NC_009464	ATTT	2	8	1247622	1247629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_009464	TGAC	2	8	1248821	1248828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_009464	TAGA	2	8	1248860	1248867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_009464	AATC	2	8	1256364	1256371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
490	NC_009464	TGAA	2	8	1257381	1257388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
491	NC_009464	GGAT	2	8	1257463	1257470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
492	NC_009464	GCCG	2	8	1273483	1273490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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494	NC_009464	AGTC	2	8	1273524	1273531	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_009464	CACT	2	8	1286267	1286274	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
499	NC_009464	AAGT	2	8	1286406	1286413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_009464	GCAT	2	8	1288119	1288126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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