MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 46269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009464	TAA	2	6	1	6	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009464	CTG	2	6	218	223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009464	TAA	2	6	258	263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009464	CAT	2	6	301	306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918683
5	NC_009464	GCA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918683
6	NC_009464	CGA	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918683
7	NC_009464	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918683
8	NC_009464	TCC	2	6	486	491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918683
9	NC_009464	ATC	2	6	602	607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918683
10	NC_009464	GGT	2	6	619	624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918683
11	NC_009464	AGT	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918683
12	NC_009464	GGA	2	6	754	759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918683
13	NC_009464	GGC	2	6	824	829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918683
14	NC_009464	CAT	3	9	856	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918683
15	NC_009464	GGA	2	6	946	951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918683
16	NC_009464	ACA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918683
17	NC_009464	TCT	2	6	1315	1320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009464	ATC	2	6	1382	1387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009464	CGT	2	6	1426	1431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009464	ATC	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918684
21	NC_009464	AGA	3	9	1551	1559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918684
22	NC_009464	GGA	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918684
23	NC_009464	AGC	2	6	1692	1697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918684
24	NC_009464	TGA	2	6	1755	1760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918684
25	NC_009464	TCC	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918684
26	NC_009464	CGG	2	6	1869	1874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918684
27	NC_009464	CAC	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918684
28	NC_009464	ATG	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918684
29	NC_009464	GTT	2	6	2086	2091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918684
30	NC_009464	GAA	2	6	2120	2125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918684
31	NC_009464	CGT	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918684
32	NC_009464	CGA	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918684
33	NC_009464	CGG	2	6	2239	2244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918684
34	NC_009464	CCG	2	6	2352	2357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918684
35	NC_009464	ATC	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918684
36	NC_009464	GAG	2	6	2529	2534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918685
37	NC_009464	TGC	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918685
38	NC_009464	CGG	2	6	2888	2893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918685
39	NC_009464	CCA	2	6	2978	2983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918685
40	NC_009464	TAC	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918685
41	NC_009464	AAG	2	6	3174	3179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918685
42	NC_009464	GTC	2	6	3285	3290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918685
43	NC_009464	CGG	2	6	3475	3480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009464	ACA	2	6	3503	3508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009464	CGG	2	6	3527	3532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009464	CTT	2	6	3572	3577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009464	CGG	2	6	3588	3593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009464	CGG	2	6	3596	3601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009464	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009464	TAC	2	6	3666	3671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009464	TCA	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009464	ATA	2	6	3746	3751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009464	GCC	2	6	3796	3801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_009464	TCG	2	6	3946	3951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
55	NC_009464	CTT	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918686
56	NC_009464	GTC	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
57	NC_009464	GCT	2	6	4101	4106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
58	NC_009464	TGC	2	6	4156	4161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
59	NC_009464	AGA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918686
60	NC_009464	CGG	2	6	4366	4371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918686
61	NC_009464	CAG	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
62	NC_009464	TCT	2	6	4524	4529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918686
63	NC_009464	GAT	2	6	4679	4684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918686
64	NC_009464	AGC	2	6	4692	4697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
65	NC_009464	AGC	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
66	NC_009464	AGC	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
67	NC_009464	CGC	2	6	5053	5058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918686
68	NC_009464	TGC	2	6	5078	5083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
69	NC_009464	CAG	2	6	5156	5161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
70	NC_009464	TGA	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918686
71	NC_009464	CAG	2	6	5354	5359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
72	NC_009464	CTT	2	6	5406	5411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918687
73	NC_009464	TTC	2	6	5462	5467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918687
74	NC_009464	CGG	2	6	5501	5506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918687
75	NC_009464	GAT	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918687
76	NC_009464	TCG	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
77	NC_009464	GAT	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918687
78	NC_009464	TCC	2	6	5729	5734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918687
79	NC_009464	TGC	2	6	5744	5749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
80	NC_009464	CTC	2	6	5855	5860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918687
81	NC_009464	GTA	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918687
82	NC_009464	CTT	2	6	5955	5960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918687
83	NC_009464	GCA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918687
84	NC_009464	TCC	2	6	6089	6094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918687
85	NC_009464	TCG	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
86	NC_009464	GGT	2	6	6174	6179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918687
87	NC_009464	TCG	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
88	NC_009464	CTC	2	6	6280	6285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918687
89	NC_009464	CCA	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918687
90	NC_009464	GCA	2	6	6435	6440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918687
91	NC_009464	CGT	2	6	6549	6554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
92	NC_009464	AAT	2	6	6739	6744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009464	CGC	2	6	6751	6756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_009464	GCG	2	6	6878	6883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918688
95	NC_009464	ACC	2	6	6955	6960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918688
96	NC_009464	GAG	2	6	7075	7080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918688
97	NC_009464	AAG	2	6	7084	7089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918688
98	NC_009464	ATC	2	6	7192	7197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918688
99	NC_009464	CAT	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918688
100	NC_009464	TCA	2	6	7280	7285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918688
101	NC_009464	TGG	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918688
102	NC_009464	GAT	2	6	7308	7313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918688
103	NC_009464	TCT	2	6	7316	7321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918688
104	NC_009464	CGA	2	6	7347	7352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918688
105	NC_009464	GCT	2	6	7353	7358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918688
106	NC_009464	GGT	2	6	7380	7385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918688
107	NC_009464	GCC	2	6	7446	7451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918688
108	NC_009464	AAG	2	6	7484	7489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918688
109	NC_009464	GAA	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918688
110	NC_009464	CCA	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009464	TAT	2	6	7611	7616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918689
112	NC_009464	GCA	2	6	7618	7623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918689
113	NC_009464	CGG	2	6	7709	7714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918689
114	NC_009464	GCA	2	6	7726	7731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918689
115	NC_009464	CTG	2	6	7889	7894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918689
116	NC_009464	TGC	2	6	7978	7983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918689
117	NC_009464	AGA	2	6	7984	7989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918689
118	NC_009464	GGC	2	6	7994	7999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918689
119	NC_009464	TTC	2	6	8354	8359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918690
120	NC_009464	GCC	2	6	8371	8376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918690
121	NC_009464	GAT	2	6	8416	8421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918690
122	NC_009464	ATA	2	6	8459	8464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918690
123	NC_009464	TCA	2	6	8589	8594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918690
124	NC_009464	GGC	3	9	8646	8654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918690
125	NC_009464	CAT	2	6	8655	8660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918690
126	NC_009464	AGC	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918690
127	NC_009464	GAT	2	6	8788	8793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918690
128	NC_009464	TCT	2	6	8815	8820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918690
129	NC_009464	CTG	2	6	8867	8872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918691
130	NC_009464	CTG	2	6	8956	8961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918691
131	NC_009464	TCG	2	6	8972	8977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918691
132	NC_009464	TGC	2	6	9207	9212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918691
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152	NC_009464	GGA	2	6	10344	10349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_009464	CAT	2	6	10413	10418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_009464	ATG	2	6	10452	10457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_009464	ATA	2	6	15972	15977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_009464	CAC	2	6	16138	16143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
244	NC_009464	AGC	2	6	16168	16173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_009464	ATC	2	6	17196	17201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918698
257	NC_009464	GAC	2	6	17295	17300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918698
258	NC_009464	CGC	2	6	17338	17343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918698
259	NC_009464	GTA	2	6	17456	17461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918698
260	NC_009464	GTC	2	6	17514	17519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918698
261	NC_009464	TCG	2	6	17550	17555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918698
262	NC_009464	GAT	2	6	17783	17788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918698
263	NC_009464	AGA	2	6	17798	17803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918698
264	NC_009464	TTA	2	6	17934	17939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918698
265	NC_009464	ATA	2	6	18101	18106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_009464	AAT	2	6	18206	18211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_009464	CGT	2	6	18245	18250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_009464	TTA	2	6	18268	18273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_009464	ATG	2	6	18292	18297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_009464	CCG	2	6	18425	18430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918699
271	NC_009464	CGT	2	6	18479	18484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918699
272	NC_009464	GCA	2	6	18488	18493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918699
273	NC_009464	GCC	2	6	18583	18588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918699
274	NC_009464	CGA	2	6	18711	18716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918699
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276	NC_009464	TGC	2	6	18877	18882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_009464	CGG	2	6	18904	18909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_009464	AGC	2	6	18937	18942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_009464	ATG	2	6	19048	19053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918700
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281	NC_009464	TAC	2	6	19183	19188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918700
282	NC_009464	ATC	2	6	19204	19209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918700
283	NC_009464	TCG	2	6	19235	19240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918700
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285	NC_009464	CGC	2	6	19392	19397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918701
286	NC_009464	CTC	2	6	19498	19503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918701
287	NC_009464	GCA	2	6	19715	19720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918701
288	NC_009464	CGA	2	6	19722	19727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918701
289	NC_009464	CCT	2	6	19899	19904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918701
290	NC_009464	AAC	2	6	19963	19968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_009464	AGC	2	6	20173	20178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918702
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293	NC_009464	TGA	2	6	20345	20350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918702
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295	NC_009464	AGT	2	6	20375	20380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918702
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297	NC_009464	TAA	2	6	20663	20668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_009464	ATA	2	6	20689	20694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_009464	GGC	2	6	20713	20718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_009464	TTA	2	6	20758	20763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918703
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302	NC_009464	CAT	2	6	20802	20807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918703
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320	NC_009464	GGA	2	6	21981	21986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_009464	GAA	2	6	22270	22275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918704
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340	NC_009464	GCT	2	6	23082	23087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918704
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355	NC_009464	CAA	3	9	24509	24517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918707
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362	NC_009464	GTA	2	6	24937	24942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
363	NC_009464	GGA	2	6	24964	24969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
364	NC_009464	CAG	2	6	25019	25024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918708
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377	NC_009464	GCG	2	6	25974	25979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918709
378	NC_009464	TTG	2	6	26040	26045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918709
379	NC_009464	CAG	2	6	26054	26059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918709
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500	NC_009464	CAC	2	6	34413	34418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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