MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 5559

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009464	TAA	2	6	1	6	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009464	CTG	2	6	218	223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009464	TAA	2	6	258	263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009464	TCT	2	6	1315	1320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009464	ATC	2	6	1382	1387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009464	CGT	2	6	1426	1431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_009464	CGG	2	6	3475	3480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009464	ACA	2	6	3503	3508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009464	CGG	2	6	3527	3532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009464	CTT	2	6	3572	3577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009464	CGG	2	6	3588	3593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009464	CGG	2	6	3596	3601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009464	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009464	TAC	2	6	3666	3671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009464	TCA	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009464	ATA	2	6	3746	3751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009464	GCC	2	6	3796	3801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_009464	AAT	2	6	6739	6744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009464	CGC	2	6	6751	6756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009464	CCA	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009464	GGA	2	6	10344	10349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009464	AAT	2	6	10375	10380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009464	CAT	2	6	10413	10418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009464	ATG	2	6	10452	10457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009464	TAT	2	6	14064	14069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009464	ATT	2	6	14145	14150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009464	GGA	2	6	14173	14178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009464	GAA	2	6	15207	15212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009464	CGA	2	6	15274	15279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009464	ATG	2	6	15305	15310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009464	CAC	2	6	15316	15321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009464	TGA	2	6	15797	15802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009464	CTG	2	6	15923	15928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009464	TAC	2	6	15940	15945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009464	ATA	2	6	15972	15977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009464	CGT	2	6	16041	16046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009464	CAC	2	6	16138	16143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009464	AGC	2	6	16168	16173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009464	ATA	2	6	18101	18106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009464	AAT	2	6	18206	18211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009464	CGT	2	6	18245	18250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009464	TTA	2	6	18268	18273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009464	ATG	2	6	18292	18297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009464	TGC	2	6	18877	18882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009464	CGG	2	6	18904	18909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009464	AGC	2	6	18937	18942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009464	AAC	2	6	19963	19968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009464	TAA	2	6	20663	20668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009464	ATA	2	6	20689	20694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009464	GGC	2	6	20713	20718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009464	GCG	2	6	21730	21735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009464	CTC	2	6	21874	21879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009464	AAG	2	6	21892	21897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009464	GGA	2	6	21981	21986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009464	CGA	2	6	22019	22024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009464	TAT	2	6	24362	24367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009464	CTG	2	6	24907	24912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009464	GTA	2	6	24937	24942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009464	GGA	2	6	24964	24969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009464	TAA	2	6	26919	26924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009464	ATT	2	6	27801	27806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009464	GCA	2	6	27835	27840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009464	CAA	2	6	32574	32579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009464	CCG	2	6	32617	32622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009464	GAT	2	6	32770	32775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009464	TAA	2	6	32867	32872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009464	ATA	2	6	33101	33106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009464	CAC	2	6	34413	34418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009464	TTA	2	6	34436	34441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009464	TCA	2	6	34478	34483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009464	AAT	2	6	36904	36909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009464	CTG	2	6	37115	37120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009464	TAC	2	6	37132	37137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009464	ATT	2	6	37206	37211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009464	GTT	2	6	37212	37217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009464	TGC	2	6	37320	37325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009464	GCA	2	6	37355	37360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009464	TGT	2	6	37414	37419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009464	ATG	2	6	40689	40694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009464	CTT	2	6	40700	40705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009464	GAC	2	6	40854	40859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009464	ATC	2	6	42217	42222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009464	CCG	3	9	42300	42308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_009464	CGA	2	6	44849	44854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009464	TAA	2	6	44996	45001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009464	ATC	2	6	45082	45087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009464	CGG	2	6	45562	45567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009464	CAG	2	6	47275	47280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009464	TAA	2	6	47283	47288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009464	CTC	2	6	48081	48086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_009464	GTC	2	6	51407	51412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009464	GTT	2	6	51703	51708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009464	AAT	2	6	51941	51946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009464	CGT	2	6	51960	51965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009464	GGC	2	6	51990	51995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009464	GTC	2	6	52119	52124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009464	CCG	2	6	53843	53848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_009464	ATT	2	6	54931	54936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009464	TAA	2	6	54982	54987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009464	GTA	3	9	54988	54996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009464	AGG	2	6	55079	55084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009464	AAT	2	6	55117	55122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009464	CTG	2	6	55198	55203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009464	CAG	2	6	55338	55343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009464	ACA	2	6	56335	56340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009464	TGG	2	6	56496	56501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009464	AGT	2	6	56610	56615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009464	TCC	2	6	56697	56702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009464	CTG	2	6	56806	56811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009464	TGC	2	6	56866	56871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009464	GCA	2	6	58179	58184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009464	ATC	2	6	58275	58280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009464	TCA	2	6	58285	58290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009464	CTC	2	6	58311	58316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009464	AGC	3	9	58352	58360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009464	TTA	2	6	59504	59509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009464	TCT	2	6	60072	60077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009464	GAT	2	6	62435	62440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009464	TCC	2	6	64463	64468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009464	TAA	2	6	64544	64549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009464	TAT	2	6	64550	64555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009464	GGT	2	6	64601	64606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009464	TAA	2	6	67053	67058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009464	AAT	2	6	67171	67176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009464	TGG	2	6	69453	69458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009464	CTG	2	6	69646	69651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009464	TAC	2	6	69663	69668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009464	ATC	2	6	69769	69774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009464	GGA	2	6	72430	72435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009464	AAC	2	6	72518	72523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009464	GCC	2	6	72816	72821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_009464	CAG	2	6	72856	72861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009464	CGG	2	6	72882	72887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009464	TAT	2	6	72918	72923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009464	AAT	2	6	72957	72962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009464	TAA	2	6	74919	74924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009464	AAT	2	6	74933	74938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009464	ATG	2	6	74942	74947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009464	CAT	2	6	75016	75021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009464	TTC	2	6	75038	75043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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143	NC_009464	CAT	2	6	75251	75256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009464	GTT	2	6	75302	75307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_009464	TAT	2	6	229522	229527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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