MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 6680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009457	TCAC	2	8	1971	1978	25 %	25 %	0 %	50 %	147675529
2	NC_009457	GATT	2	8	2634	2641	25 %	50 %	25 %	0 %	147674960
3	NC_009457	CCAG	2	8	2643	2650	25 %	0 %	25 %	50 %	147674960
4	NC_009457	ACTG	2	8	3034	3041	25 %	25 %	25 %	25 %	147674960
5	NC_009457	ACCA	2	8	3588	3595	50 %	0 %	0 %	50 %	147674885
6	NC_009457	CAAA	2	8	4142	4149	75 %	0 %	0 %	25 %	147674885
7	NC_009457	CTCG	2	8	4313	4320	0 %	25 %	25 %	50 %	147674885
8	NC_009457	TCAA	2	8	4784	4791	50 %	25 %	0 %	25 %	147675539
9	NC_009457	CAAC	2	8	4836	4843	50 %	0 %	0 %	50 %	147675539
10	NC_009457	TGCT	2	8	5233	5240	0 %	50 %	25 %	25 %	147675539
11	NC_009457	GCAC	2	8	5721	5728	25 %	0 %	25 %	50 %	147675539
12	NC_009457	TTGT	2	8	6972	6979	0 %	75 %	25 %	0 %	147674564
13	NC_009457	TGAC	2	8	8328	8335	25 %	25 %	25 %	25 %	147673294
14	NC_009457	TAAC	2	8	8355	8362	50 %	25 %	0 %	25 %	147673294
15	NC_009457	GTGA	2	8	8516	8523	25 %	25 %	50 %	0 %	147673294
16	NC_009457	CAAT	2	8	8565	8572	50 %	25 %	0 %	25 %	147673294
17	NC_009457	TTAC	2	8	9291	9298	25 %	50 %	0 %	25 %	147673920
18	NC_009457	ATGA	2	8	9585	9592	50 %	25 %	25 %	0 %	147674559
19	NC_009457	CAAC	2	8	9941	9948	50 %	0 %	0 %	50 %	147674559
20	NC_009457	TGCG	2	8	10201	10208	0 %	25 %	50 %	25 %	147674559
21	NC_009457	TAGG	2	8	10458	10465	25 %	25 %	50 %	0 %	147674559
22	NC_009457	GGTG	2	8	10537	10544	0 %	25 %	75 %	0 %	147675116
23	NC_009457	CCAA	2	8	11166	11173	50 %	0 %	0 %	50 %	147675116
24	NC_009457	GAAT	2	8	12603	12610	50 %	25 %	25 %	0 %	147673691
25	NC_009457	GCAG	2	8	12731	12738	25 %	0 %	50 %	25 %	147673691
26	NC_009457	GTGA	2	8	12902	12909	25 %	25 %	50 %	0 %	147673691
27	NC_009457	TGAG	2	8	13614	13621	25 %	25 %	50 %	0 %	147673691
28	NC_009457	AGGC	2	8	14160	14167	25 %	0 %	50 %	25 %	147674125
29	NC_009457	ATCG	2	8	14858	14865	25 %	25 %	25 %	25 %	147674877
30	NC_009457	CATC	2	8	15060	15067	25 %	25 %	0 %	50 %	147673886
31	NC_009457	TGGT	2	8	15413	15420	0 %	50 %	50 %	0 %	147673886
32	NC_009457	TCAT	2	8	15857	15864	25 %	50 %	0 %	25 %	147673886
33	NC_009457	GGGT	2	8	16174	16181	0 %	25 %	75 %	0 %	147674458
34	NC_009457	CTCA	2	8	17021	17028	25 %	25 %	0 %	50 %	147675504
35	NC_009457	ACTG	2	8	17146	17153	25 %	25 %	25 %	25 %	147675504
36	NC_009457	GCAC	2	8	17792	17799	25 %	0 %	25 %	50 %	147673320
37	NC_009457	TGGA	2	8	18636	18643	25 %	25 %	50 %	0 %	147673542
38	NC_009457	GTTG	2	8	19057	19064	0 %	50 %	50 %	0 %	147673542
39	NC_009457	GCAA	2	8	19318	19325	50 %	0 %	25 %	25 %	147673542
40	NC_009457	CATT	2	8	19776	19783	25 %	50 %	0 %	25 %	147675757
41	NC_009457	CAAA	2	8	20565	20572	75 %	0 %	0 %	25 %	147675757
42	NC_009457	GCAA	2	8	20711	20718	50 %	0 %	25 %	25 %	147675757
43	NC_009457	ACCA	2	8	21231	21238	50 %	0 %	0 %	50 %	147675757
44	NC_009457	CGAC	2	8	21567	21574	25 %	0 %	25 %	50 %	147675757
45	NC_009457	AAGC	2	8	21782	21789	50 %	0 %	25 %	25 %	147675757
46	NC_009457	CTTG	2	8	21899	21906	0 %	50 %	25 %	25 %	147674947
47	NC_009457	AATA	2	8	21919	21926	75 %	25 %	0 %	0 %	147674947
48	NC_009457	AATC	2	8	22206	22213	50 %	25 %	0 %	25 %	147674947
49	NC_009457	AGCC	2	8	22457	22464	25 %	0 %	25 %	50 %	147674947
50	NC_009457	ATCC	2	8	22934	22941	25 %	25 %	0 %	50 %	147674899
51	NC_009457	CCAG	2	8	23068	23075	25 %	0 %	25 %	50 %	147674899
52	NC_009457	GGTT	2	8	23296	23303	0 %	50 %	50 %	0 %	147674899
53	NC_009457	CGCA	2	8	23986	23993	25 %	0 %	25 %	50 %	147674899
54	NC_009457	CCAA	2	8	24407	24414	50 %	0 %	0 %	50 %	147674899
55	NC_009457	AGTT	2	8	25395	25402	25 %	50 %	25 %	0 %	229259769
56	NC_009457	TGAT	2	8	25611	25618	25 %	50 %	25 %	0 %	229259769
57	NC_009457	CTAC	2	8	26325	26332	25 %	25 %	0 %	50 %	147673541
58	NC_009457	GATG	2	8	26615	26622	25 %	25 %	50 %	0 %	147673541
59	NC_009457	CTGC	2	8	27327	27334	0 %	25 %	25 %	50 %	147673541
60	NC_009457	TCCA	2	8	27517	27524	25 %	25 %	0 %	50 %	147674645
61	NC_009457	AAAG	2	8	29084	29091	75 %	0 %	25 %	0 %	147673216
62	NC_009457	ACTA	2	8	29439	29446	50 %	25 %	0 %	25 %	147673216
63	NC_009457	ATCA	2	8	29901	29908	50 %	25 %	0 %	25 %	147675146
64	NC_009457	AAAG	2	8	30193	30200	75 %	0 %	25 %	0 %	147675146
65	NC_009457	TTGG	2	8	30803	30810	0 %	50 %	50 %	0 %	147674972
66	NC_009457	AATG	2	8	31778	31785	50 %	25 %	25 %	0 %	147674164
67	NC_009457	ATCA	2	8	32025	32032	50 %	25 %	0 %	25 %	147674164
68	NC_009457	TGTT	2	8	32684	32691	0 %	75 %	25 %	0 %	147675027
69	NC_009457	CCAT	2	8	33350	33357	25 %	25 %	0 %	50 %	147674848
70	NC_009457	TTTC	2	8	33657	33664	0 %	75 %	0 %	25 %	147674848
71	NC_009457	TCAG	2	8	34199	34206	25 %	25 %	25 %	25 %	147674848
72	NC_009457	TGAT	2	8	34980	34987	25 %	50 %	25 %	0 %	147674087
73	NC_009457	CAAA	2	8	35410	35417	75 %	0 %	0 %	25 %	147674087
74	NC_009457	TCGC	2	8	36038	36045	0 %	25 %	25 %	50 %	147675377
75	NC_009457	GTGC	2	8	37135	37142	0 %	25 %	50 %	25 %	147675377
76	NC_009457	TAAG	2	8	37477	37484	50 %	25 %	25 %	0 %	147675633
77	NC_009457	AGCG	2	8	37510	37517	25 %	0 %	50 %	25 %	147675633
78	NC_009457	ATCG	2	8	37651	37658	25 %	25 %	25 %	25 %	147675633
79	NC_009457	TGTT	2	8	38267	38274	0 %	75 %	25 %	0 %	147675633
80	NC_009457	TTTA	2	8	38470	38477	25 %	75 %	0 %	0 %	147675633
81	NC_009457	GTAG	2	8	39048	39055	25 %	25 %	50 %	0 %	147673361
82	NC_009457	GATC	2	8	39684	39691	25 %	25 %	25 %	25 %	147673361
83	NC_009457	CTTG	2	8	40009	40016	0 %	50 %	25 %	25 %	147673361
84	NC_009457	ATTG	2	8	40414	40421	25 %	50 %	25 %	0 %	147673361
85	NC_009457	TCTT	2	8	41911	41918	0 %	75 %	0 %	25 %	147674012
86	NC_009457	ACAG	2	8	41980	41987	50 %	0 %	25 %	25 %	147674012
87	NC_009457	ATAC	2	8	42759	42766	50 %	25 %	0 %	25 %	147674012
88	NC_009457	ACGC	2	8	43487	43494	25 %	0 %	25 %	50 %	147674914
89	NC_009457	TCAA	2	8	43776	43783	50 %	25 %	0 %	25 %	147674914
90	NC_009457	TTCT	2	8	44623	44630	0 %	75 %	0 %	25 %	147674914
91	NC_009457	CTGA	2	8	44768	44775	25 %	25 %	25 %	25 %	147674914
92	NC_009457	TGAA	2	8	44779	44786	50 %	25 %	25 %	0 %	147674914
93	NC_009457	TGCA	2	8	44937	44944	25 %	25 %	25 %	25 %	147674914
94	NC_009457	ACAA	2	8	44964	44971	75 %	0 %	0 %	25 %	147674914
95	NC_009457	AGCT	2	8	45525	45532	25 %	25 %	25 %	25 %	147674201
96	NC_009457	CCAG	2	8	45793	45800	25 %	0 %	25 %	50 %	147674821
97	NC_009457	TCCT	2	8	45832	45839	0 %	50 %	0 %	50 %	147674821
98	NC_009457	GTTT	2	8	45875	45882	0 %	75 %	25 %	0 %	147674821
99	NC_009457	TTGG	2	8	46197	46204	0 %	50 %	50 %	0 %	147675246
100	NC_009457	TTGG	2	8	46212	46219	0 %	50 %	50 %	0 %	147675246
101	NC_009457	TGAT	2	8	47134	47141	25 %	50 %	25 %	0 %	147673630
102	NC_009457	GATG	2	8	47723	47730	25 %	25 %	50 %	0 %	147673630
103	NC_009457	GCAG	2	8	47879	47886	25 %	0 %	50 %	25 %	147673630
104	NC_009457	AGGC	2	8	48334	48341	25 %	0 %	50 %	25 %	147674048
105	NC_009457	GAGC	2	8	49133	49140	25 %	0 %	50 %	25 %	147674486
106	NC_009457	GCCA	2	8	49282	49289	25 %	0 %	25 %	50 %	147673898
107	NC_009457	TCAC	2	8	49600	49607	25 %	25 %	0 %	50 %	147673898
108	NC_009457	GCGG	2	8	51088	51095	0 %	0 %	75 %	25 %	147673316
109	NC_009457	TCTG	2	8	52640	52647	0 %	50 %	25 %	25 %	147673999
110	NC_009457	TCGT	2	8	52652	52659	0 %	50 %	25 %	25 %	147673999
111	NC_009457	GGCG	2	8	52826	52833	0 %	0 %	75 %	25 %	147673999
112	NC_009457	AATC	2	8	53406	53413	50 %	25 %	0 %	25 %	147674427
113	NC_009457	CTTA	2	8	53598	53605	25 %	50 %	0 %	25 %	147674427
114	NC_009457	TCAC	2	8	53803	53810	25 %	25 %	0 %	50 %	147674427
115	NC_009457	TGGC	2	8	54274	54281	0 %	25 %	50 %	25 %	147675360
116	NC_009457	CAAA	2	8	54991	54998	75 %	0 %	0 %	25 %	147673872
117	NC_009457	AGGA	2	8	55313	55320	50 %	0 %	50 %	0 %	147673872
118	NC_009457	CTAC	2	8	55947	55954	25 %	25 %	0 %	50 %	147674644
119	NC_009457	ATTT	2	8	56048	56055	25 %	75 %	0 %	0 %	147674644
120	NC_009457	GACC	2	8	56126	56133	25 %	0 %	25 %	50 %	147674644
121	NC_009457	AACG	2	8	56165	56172	50 %	0 %	25 %	25 %	147674644
122	NC_009457	GCCA	2	8	56845	56852	25 %	0 %	25 %	50 %	147675773
123	NC_009457	AGCG	2	8	57061	57068	25 %	0 %	50 %	25 %	147675773
124	NC_009457	CATC	2	8	57105	57112	25 %	25 %	0 %	50 %	147675773
125	NC_009457	TCAT	2	8	57404	57411	25 %	50 %	0 %	25 %	147675773
126	NC_009457	GGGT	2	8	57937	57944	0 %	25 %	75 %	0 %	147675773
127	NC_009457	GCTC	2	8	58032	58039	0 %	25 %	25 %	50 %	147675773
128	NC_009457	TGAG	2	8	58349	58356	25 %	25 %	50 %	0 %	147675773
129	NC_009457	TGCT	2	8	58501	58508	0 %	50 %	25 %	25 %	147675773
130	NC_009457	CTCG	2	8	59176	59183	0 %	25 %	25 %	50 %	147675773
131	NC_009457	ATAA	2	8	59493	59500	75 %	25 %	0 %	0 %	147673090
132	NC_009457	TTGC	2	8	61572	61579	0 %	50 %	25 %	25 %	147673555
133	NC_009457	TGCT	2	8	62078	62085	0 %	50 %	25 %	25 %	147674327
134	NC_009457	CAAT	2	8	62908	62915	50 %	25 %	0 %	25 %	147673965
135	NC_009457	TTGA	2	8	62988	62995	25 %	50 %	25 %	0 %	147673965
136	NC_009457	TGAG	2	8	64861	64868	25 %	25 %	50 %	0 %	147673308
137	NC_009457	GCAA	2	8	65039	65046	50 %	0 %	25 %	25 %	147673308
138	NC_009457	TTCA	2	8	65110	65117	25 %	50 %	0 %	25 %	147673308
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