MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 38315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009457	CAC	2	6	56	61	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009457	TGA	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009457	CTG	2	6	359	364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009457	GAG	2	6	402	407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009457	ATC	2	6	428	433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009457	TGA	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009457	CTA	2	6	502	507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009457	GCG	2	6	657	662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009457	AAT	2	6	774	779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009457	CCT	2	6	815	820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_009457	CAT	2	6	856	861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009457	ATG	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009457	CTT	2	6	948	953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674855
14	NC_009457	CAT	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674855
15	NC_009457	CTT	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674855
16	NC_009457	TGT	2	6	1086	1091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674855
17	NC_009457	CTT	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674855
18	NC_009457	GTT	2	6	1240	1245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675529
19	NC_009457	GCA	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675529
20	NC_009457	TGG	2	6	1450	1455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675529
21	NC_009457	GCT	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
22	NC_009457	TGC	2	6	1629	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
23	NC_009457	CAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675529
24	NC_009457	AGC	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675529
25	NC_009457	AGA	2	6	1883	1888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147675529
26	NC_009457	CGC	2	6	1960	1965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675529
27	NC_009457	GCT	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
28	NC_009457	GTA	2	6	2018	2023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675529
29	NC_009457	GCA	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675529
30	NC_009457	GCG	2	6	2059	2064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675529
31	NC_009457	CTG	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
32	NC_009457	TTG	2	6	2189	2194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675529
33	NC_009457	ATT	3	9	2270	2278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009457	CAC	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674068
35	NC_009457	TGG	2	6	2313	2318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674068
36	NC_009457	GGC	2	6	2383	2388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674068
37	NC_009457	TAA	2	6	2428	2433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674068
38	NC_009457	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674960
39	NC_009457	TGC	2	6	2543	2548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674960
40	NC_009457	TCG	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674960
41	NC_009457	TTC	2	6	2917	2922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674960
42	NC_009457	AAG	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674960
43	NC_009457	CAC	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674960
44	NC_009457	TCA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674960
45	NC_009457	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674960
46	NC_009457	TGA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674960
47	NC_009457	AGC	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674960
48	NC_009457	GCC	2	6	3314	3319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_009457	AGT	2	6	3334	3339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009457	TAA	3	9	3437	3445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674885
51	NC_009457	CAG	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674885
52	NC_009457	ATT	2	6	3486	3491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674885
53	NC_009457	GAA	2	6	3492	3497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674885
54	NC_009457	TGC	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674885
55	NC_009457	GCA	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674885
56	NC_009457	GAT	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674885
57	NC_009457	CAA	2	6	4088	4093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674885
58	NC_009457	ATG	2	6	4180	4185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674885
59	NC_009457	ATT	2	6	4245	4250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674885
60	NC_009457	GCA	2	6	4413	4418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009457	GCC	2	6	4527	4532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009457	TTC	3	9	4600	4608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675539
63	NC_009457	ATC	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675539
64	NC_009457	GTG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675539
65	NC_009457	TGG	2	6	4914	4919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675539
66	NC_009457	GCG	2	6	5193	5198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675539
67	NC_009457	TGG	2	6	5300	5305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675539
68	NC_009457	GCG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675539
69	NC_009457	CTT	2	6	5328	5333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675539
70	NC_009457	GCA	2	6	5517	5522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675539
71	NC_009457	ACC	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675539
72	NC_009457	GCA	2	6	5583	5588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675539
73	NC_009457	CAG	2	6	5641	5646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675539
74	NC_009457	GCT	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673291
75	NC_009457	GCT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673291
76	NC_009457	CAG	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673291
77	NC_009457	TTC	2	6	5874	5879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673291
78	NC_009457	TGC	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673291
79	NC_009457	GTG	2	6	5924	5929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673291
80	NC_009457	ATC	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673291
81	NC_009457	CGC	2	6	6054	6059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673291
82	NC_009457	AGC	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673291
83	NC_009457	ATC	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673291
84	NC_009457	TGA	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673291
85	NC_009457	GTG	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673291
86	NC_009457	CGA	2	6	6281	6286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673291
87	NC_009457	CGT	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009457	AGT	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673975
89	NC_009457	CTT	2	6	6572	6577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673975
90	NC_009457	GCT	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673975
91	NC_009457	AGT	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673975
92	NC_009457	CAT	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673975
93	NC_009457	ATT	2	6	6914	6919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674564
94	NC_009457	CAC	2	6	7005	7010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674564
95	NC_009457	CGG	2	6	7080	7085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674564
96	NC_009457	TTC	2	6	7107	7112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674564
97	NC_009457	CAA	2	6	7124	7129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674564
98	NC_009457	GCA	2	6	7166	7171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674564
99	NC_009457	GCA	2	6	7261	7266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675181
100	NC_009457	GCC	2	6	7298	7303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675181
101	NC_009457	AAT	2	6	7313	7318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147675181
102	NC_009457	CAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147675181
103	NC_009457	AAC	2	6	7428	7433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147675181
104	NC_009457	GCC	2	6	7436	7441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675181
105	NC_009457	TGG	2	6	7567	7572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675181
106	NC_009457	TGC	2	6	7582	7587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675181
107	NC_009457	ACC	2	6	7707	7712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675181
108	NC_009457	ATG	2	6	7713	7718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675181
109	NC_009457	TGA	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675181
110	NC_009457	GTT	2	6	7824	7829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673294
111	NC_009457	CCG	2	6	7851	7856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673294
112	NC_009457	GTG	2	6	7922	7927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673294
113	NC_009457	GGC	2	6	7993	7998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673294
114	NC_009457	TTG	2	6	8014	8019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673294
115	NC_009457	TAA	2	6	8023	8028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147673294
116	NC_009457	TCA	2	6	8042	8047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673294
117	NC_009457	TGC	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673294
118	NC_009457	AAG	2	6	8090	8095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147673294
119	NC_009457	GCG	2	6	8117	8122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673294
120	NC_009457	CCG	2	6	8340	8345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673294
121	NC_009457	ACC	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147673294
122	NC_009457	TTG	2	6	8446	8451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673294
123	NC_009457	CGC	2	6	8452	8457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673294
124	NC_009457	TGG	2	6	8472	8477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673294
125	NC_009457	GAT	2	6	8536	8541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673294
126	NC_009457	CGG	2	6	8547	8552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673294
127	NC_009457	ATG	2	6	8579	8584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673294
128	NC_009457	TGC	2	6	8746	8751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673920
129	NC_009457	GCT	2	6	8763	8768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673920
130	NC_009457	GTT	2	6	8827	8832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673920
131	NC_009457	GCC	2	6	8859	8864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673920
132	NC_009457	TGC	2	6	8964	8969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673920
133	NC_009457	TGT	2	6	9339	9344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673920
134	NC_009457	TAC	2	6	9388	9393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673920
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239	NC_009457	GCA	2	6	18399	18404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673542
240	NC_009457	GAA	2	6	18442	18447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147673542
241	NC_009457	ATG	2	6	18464	18469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673542
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243	NC_009457	CGC	2	6	18577	18582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673542
244	NC_009457	CAC	3	9	18660	18668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147673542
245	NC_009457	GCC	2	6	18682	18687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673542
246	NC_009457	GAT	2	6	18700	18705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673542
247	NC_009457	CCA	2	6	18740	18745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147673542
248	NC_009457	CTG	2	6	18801	18806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673542
249	NC_009457	TGA	2	6	18819	18824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673542
250	NC_009457	ATG	2	6	19076	19081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673542
251	NC_009457	GCA	3	9	19726	19734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674061
252	NC_009457	GCC	2	6	19754	19759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147674061
253	NC_009457	TCT	2	6	19814	19819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675757
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255	NC_009457	GCT	2	6	20029	20034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675757
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288	NC_009457	AAT	2	6	22871	22876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009457	AAT	2	6	22894	22899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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