MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 5073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009457	GA	3	6	164	169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009457	GC	3	6	315	320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009457	GC	3	6	1437	1442	0 %	0 %	50 %	50 %	147675529
4	NC_009457	GC	3	6	1826	1831	0 %	0 %	50 %	50 %	147675529
5	NC_009457	GC	3	6	2006	2011	0 %	0 %	50 %	50 %	147675529
6	NC_009457	CA	3	6	2876	2881	50 %	0 %	0 %	50 %	147674960
7	NC_009457	CT	3	6	3840	3845	0 %	50 %	0 %	50 %	147674885
8	NC_009457	CG	3	6	4329	4334	0 %	0 %	50 %	50 %	147674885
9	NC_009457	CG	3	6	4896	4901	0 %	0 %	50 %	50 %	147675539
10	NC_009457	GC	3	6	4959	4964	0 %	0 %	50 %	50 %	147675539
11	NC_009457	AG	3	6	5185	5190	50 %	0 %	50 %	0 %	147675539
12	NC_009457	CG	3	6	5525	5530	0 %	0 %	50 %	50 %	147675539
13	NC_009457	CA	3	6	6006	6011	50 %	0 %	0 %	50 %	147673291
14	NC_009457	CG	3	6	6019	6024	0 %	0 %	50 %	50 %	147673291
15	NC_009457	GC	3	6	6108	6113	0 %	0 %	50 %	50 %	147673291
16	NC_009457	GC	3	6	6128	6133	0 %	0 %	50 %	50 %	147673291
17	NC_009457	CG	3	6	6669	6674	0 %	0 %	50 %	50 %	147673975
18	NC_009457	AG	4	8	7455	7462	50 %	0 %	50 %	0 %	147675181
19	NC_009457	GC	4	8	7674	7681	0 %	0 %	50 %	50 %	147675181
20	NC_009457	GC	3	6	7839	7844	0 %	0 %	50 %	50 %	147673294
21	NC_009457	TG	3	6	8189	8194	0 %	50 %	50 %	0 %	147673294
22	NC_009457	AC	3	6	8334	8339	50 %	0 %	0 %	50 %	147673294
23	NC_009457	AC	3	6	8395	8400	50 %	0 %	0 %	50 %	147673294
24	NC_009457	GC	3	6	9687	9692	0 %	0 %	50 %	50 %	147674559
25	NC_009457	AC	3	6	10106	10111	50 %	0 %	0 %	50 %	147674559
26	NC_009457	CG	3	6	10668	10673	0 %	0 %	50 %	50 %	147675116
27	NC_009457	GC	3	6	12288	12293	0 %	0 %	50 %	50 %	147675703
28	NC_009457	TC	3	6	12501	12506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009457	GT	3	6	13262	13267	0 %	50 %	50 %	0 %	147673691
30	NC_009457	TG	3	6	13652	13657	0 %	50 %	50 %	0 %	147673691
31	NC_009457	GC	3	6	13727	13732	0 %	0 %	50 %	50 %	147673691
32	NC_009457	GT	3	6	13788	13793	0 %	50 %	50 %	0 %	147673691
33	NC_009457	CT	3	6	13948	13953	0 %	50 %	0 %	50 %	147674125
34	NC_009457	GC	4	8	14029	14036	0 %	0 %	50 %	50 %	147674125
35	NC_009457	CG	3	6	14115	14120	0 %	0 %	50 %	50 %	147674125
36	NC_009457	CG	3	6	14719	14724	0 %	0 %	50 %	50 %	147674877
37	NC_009457	CT	3	6	14790	14795	0 %	50 %	0 %	50 %	147674877
38	NC_009457	TC	3	6	15105	15110	0 %	50 %	0 %	50 %	147673886
39	NC_009457	CA	3	6	16934	16939	50 %	0 %	0 %	50 %	147675504
40	NC_009457	AG	3	6	18544	18549	50 %	0 %	50 %	0 %	147673542
41	NC_009457	AC	3	6	20409	20414	50 %	0 %	0 %	50 %	147675757
42	NC_009457	GC	3	6	20595	20600	0 %	0 %	50 %	50 %	147675757
43	NC_009457	CG	3	6	21133	21138	0 %	0 %	50 %	50 %	147675757
44	NC_009457	CT	3	6	22130	22135	0 %	50 %	0 %	50 %	147674947
45	NC_009457	CG	3	6	22186	22191	0 %	0 %	50 %	50 %	147674947
46	NC_009457	AT	3	6	22864	22869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009457	TC	3	6	23777	23782	0 %	50 %	0 %	50 %	147674899
48	NC_009457	GT	3	6	24116	24121	0 %	50 %	50 %	0 %	147674899
49	NC_009457	CT	3	6	25293	25298	0 %	50 %	0 %	50 %	229259769
50	NC_009457	GT	3	6	25344	25349	0 %	50 %	50 %	0 %	229259769
51	NC_009457	TC	3	6	26419	26424	0 %	50 %	0 %	50 %	147673541
52	NC_009457	TG	3	6	26599	26604	0 %	50 %	50 %	0 %	147673541
53	NC_009457	CA	3	6	27942	27947	50 %	0 %	0 %	50 %	147674645
54	NC_009457	CT	3	6	28294	28299	0 %	50 %	0 %	50 %	147674645
55	NC_009457	AG	3	6	28682	28687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009457	TA	3	6	29769	29774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009457	AG	3	6	29928	29933	50 %	0 %	50 %	0 %	147675146
58	NC_009457	CA	3	6	30212	30217	50 %	0 %	0 %	50 %	147675146
59	NC_009457	CT	3	6	31650	31655	0 %	50 %	0 %	50 %	147674164
60	NC_009457	TA	3	6	32296	32301	50 %	50 %	0 %	0 %	147674164
61	NC_009457	AC	3	6	32621	32626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009457	GA	3	6	34155	34160	50 %	0 %	50 %	0 %	147674848
63	NC_009457	CA	3	6	34721	34726	50 %	0 %	0 %	50 %	147674087
64	NC_009457	CT	4	8	34770	34777	0 %	50 %	0 %	50 %	147674087
65	NC_009457	TG	3	6	35525	35530	0 %	50 %	50 %	0 %	147675377
66	NC_009457	TC	3	6	36664	36669	0 %	50 %	0 %	50 %	147675377
67	NC_009457	GC	3	6	37141	37146	0 %	0 %	50 %	50 %	147675377
68	NC_009457	CT	3	6	37276	37281	0 %	50 %	0 %	50 %	147675377
69	NC_009457	TC	3	6	39424	39429	0 %	50 %	0 %	50 %	147673361
70	NC_009457	TG	3	6	39790	39795	0 %	50 %	50 %	0 %	147673361
71	NC_009457	TG	3	6	40311	40316	0 %	50 %	50 %	0 %	147673361
72	NC_009457	CT	3	6	42796	42801	0 %	50 %	0 %	50 %	147674012
73	NC_009457	CT	3	6	43202	43207	0 %	50 %	0 %	50 %	147674914
74	NC_009457	GC	3	6	43725	43730	0 %	0 %	50 %	50 %	147674914
75	NC_009457	GC	3	6	43947	43952	0 %	0 %	50 %	50 %	147674914
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81	NC_009457	CA	3	6	48425	48430	50 %	0 %	0 %	50 %	147674048
82	NC_009457	TC	3	6	50371	50376	0 %	50 %	0 %	50 %	147674526
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89	NC_009457	AG	3	6	53120	53125	50 %	0 %	50 %	0 %	147673999
90	NC_009457	GC	4	8	56813	56820	0 %	0 %	50 %	50 %	147675773
91	NC_009457	GC	3	6	57500	57505	0 %	0 %	50 %	50 %	147675773
92	NC_009457	CG	3	6	58095	58100	0 %	0 %	50 %	50 %	147675773
93	NC_009457	TG	3	6	58428	58433	0 %	50 %	50 %	0 %	147675773
94	NC_009457	CG	3	6	58530	58535	0 %	0 %	50 %	50 %	147675773
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98	NC_009457	CG	3	6	60189	60194	0 %	0 %	50 %	50 %	147673090
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102	NC_009457	GA	3	6	65473	65478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009457	CG	3	6	65575	65580	0 %	0 %	50 %	50 %	147673530
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107	NC_009457	GC	3	6	67477	67482	0 %	0 %	50 %	50 %	147675089
108	NC_009457	CG	3	6	67517	67522	0 %	0 %	50 %	50 %	147675089
109	NC_009457	CT	3	6	69064	69069	0 %	50 %	0 %	50 %	147675089
110	NC_009457	TG	3	6	69300	69305	0 %	50 %	50 %	0 %	147675089
111	NC_009457	AG	3	6	69532	69537	50 %	0 %	50 %	0 %	147675089
112	NC_009457	CT	3	6	70309	70314	0 %	50 %	0 %	50 %	147674175
113	NC_009457	GC	3	6	70711	70716	0 %	0 %	50 %	50 %	147674175
114	NC_009457	CT	3	6	70786	70791	0 %	50 %	0 %	50 %	147674175
115	NC_009457	GC	3	6	72136	72141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009457	GC	3	6	72207	72212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009457	AG	3	6	72361	72366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009457	GC	3	6	72417	72422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009457	GC	3	6	72488	72493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009457	AG	3	6	72642	72647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009457	GC	3	6	72697	72702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009457	GC	3	6	72768	72773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009457	GC	3	6	73748	73753	0 %	0 %	50 %	50 %	147673995
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125	NC_009457	GC	3	6	75141	75146	0 %	0 %	50 %	50 %	147673995
126	NC_009457	GT	3	6	76339	76344	0 %	50 %	50 %	0 %	147675475
127	NC_009457	TA	3	6	76428	76433	50 %	50 %	0 %	0 %	147674535
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134	NC_009457	GC	3	6	78432	78437	0 %	0 %	50 %	50 %	147673676
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136	NC_009457	CT	3	6	81167	81172	0 %	50 %	0 %	50 %	147675148
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139	NC_009457	GT	3	6	82085	82090	0 %	50 %	50 %	0 %	147675148
140	NC_009457	GT	3	6	82156	82161	0 %	50 %	50 %	0 %	147675148
141	NC_009457	GC	3	6	83537	83542	0 %	0 %	50 %	50 %	147673693
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