MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 2991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009456	GTCT	2	8	244	251	0 %	50 %	25 %	25 %	147671835
2	NC_009456	CTTT	2	8	598	605	0 %	75 %	0 %	25 %	147671835
3	NC_009456	GGGC	2	8	916	923	0 %	0 %	75 %	25 %	147671835
4	NC_009456	ACAT	2	8	1649	1656	50 %	25 %	0 %	25 %	147672362
5	NC_009456	ATCT	2	8	2130	2137	25 %	50 %	0 %	25 %	147672362
6	NC_009456	GTTG	2	8	2363	2370	0 %	50 %	50 %	0 %	147672362
7	NC_009456	AGCA	2	8	2416	2423	50 %	0 %	25 %	25 %	147672362
8	NC_009456	GCAG	2	8	3266	3273	25 %	0 %	50 %	25 %	147671726
9	NC_009456	CTCA	2	8	3402	3409	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009456	TGAG	2	8	3429	3436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009456	ATGC	2	8	3490	3497	25 %	25 %	25 %	25 %	147671999
12	NC_009456	CAGC	2	8	3511	3518	25 %	0 %	25 %	50 %	147671999
13	NC_009456	GCGA	2	8	3742	3749	25 %	0 %	50 %	25 %	147671999
14	NC_009456	ACTG	2	8	3771	3778	25 %	25 %	25 %	25 %	147671999
15	NC_009456	ATGG	2	8	3996	4003	25 %	25 %	50 %	0 %	147671999
16	NC_009456	ATGC	2	8	4583	4590	25 %	25 %	25 %	25 %	147671650
17	NC_009456	CAAA	2	8	4773	4780	75 %	0 %	0 %	25 %	147671650
18	NC_009456	GATG	2	8	5189	5196	25 %	25 %	50 %	0 %	147671890
19	NC_009456	AAAC	2	8	5327	5334	75 %	0 %	0 %	25 %	147671890
20	NC_009456	TTCG	2	8	6436	6443	0 %	50 %	25 %	25 %	147671538
21	NC_009456	CGCC	2	8	6741	6748	0 %	0 %	25 %	75 %	147671538
22	NC_009456	TATT	2	8	8069	8076	25 %	75 %	0 %	0 %	147672299
23	NC_009456	CCAG	2	8	8711	8718	25 %	0 %	25 %	50 %	147672299
24	NC_009456	AATC	2	8	8814	8821	50 %	25 %	0 %	25 %	147672299
25	NC_009456	AAGA	2	8	8927	8934	75 %	0 %	25 %	0 %	147672299
26	NC_009456	TCAA	2	8	8978	8985	50 %	25 %	0 %	25 %	147672299
27	NC_009456	TCGC	2	8	9127	9134	0 %	25 %	25 %	50 %	147671783
28	NC_009456	TTTC	2	8	9956	9963	0 %	75 %	0 %	25 %	147671783
29	NC_009456	TCGG	2	8	10057	10064	0 %	25 %	50 %	25 %	147671783
30	NC_009456	GCGT	2	8	10675	10682	0 %	25 %	50 %	25 %	229259762
31	NC_009456	TTAA	2	8	11642	11649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009456	CATT	2	8	11671	11678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009456	TGCT	2	8	11854	11861	0 %	50 %	25 %	25 %	147671565
34	NC_009456	CAAA	2	8	12349	12356	75 %	0 %	0 %	25 %	147671421
35	NC_009456	ACCC	2	8	12702	12709	25 %	0 %	0 %	75 %	147671421
36	NC_009456	GGGT	2	8	12786	12793	0 %	25 %	75 %	0 %	147671421
37	NC_009456	CTGC	2	8	13236	13243	0 %	25 %	25 %	50 %	147671421
38	NC_009456	GTTG	2	8	13501	13508	0 %	50 %	50 %	0 %	147671421
39	NC_009456	TCAA	2	8	13584	13591	50 %	25 %	0 %	25 %	147671421
40	NC_009456	TGCA	2	8	13610	13617	25 %	25 %	25 %	25 %	147671421
41	NC_009456	TACG	2	8	13752	13759	25 %	25 %	25 %	25 %	147671421
42	NC_009456	AGCA	2	8	14243	14250	50 %	0 %	25 %	25 %	147671421
43	NC_009456	TGCG	2	8	14376	14383	0 %	25 %	50 %	25 %	147671421
44	NC_009456	AAAG	2	8	14793	14800	75 %	0 %	25 %	0 %	147671421
45	NC_009456	CTTC	2	8	15364	15371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009456	TTTG	2	8	15448	15455	0 %	75 %	25 %	0 %	147672179
47	NC_009456	TTGG	2	8	16346	16353	0 %	50 %	50 %	0 %	147672179
48	NC_009456	CAGG	2	8	16412	16419	25 %	0 %	50 %	25 %	147672179
49	NC_009456	GCTT	2	8	17129	17136	0 %	50 %	25 %	25 %	147671876
50	NC_009456	CAGC	2	8	17328	17335	25 %	0 %	25 %	50 %	147671876
51	NC_009456	TTGA	2	8	18514	18521	25 %	50 %	25 %	0 %	147671876
52	NC_009456	GTTT	2	8	18885	18892	0 %	75 %	25 %	0 %	147671876
53	NC_009456	GGTA	2	8	19054	19061	25 %	25 %	50 %	0 %	147671876
54	NC_009456	TCGC	2	8	19124	19131	0 %	25 %	25 %	50 %	147671876
55	NC_009456	AAAG	2	8	19384	19391	75 %	0 %	25 %	0 %	147671876
56	NC_009456	ATCA	2	8	19687	19694	50 %	25 %	0 %	25 %	147671876
57	NC_009456	TTTA	2	8	19865	19872	25 %	75 %	0 %	0 %	147672059
58	NC_009456	AGCC	2	8	20089	20096	25 %	0 %	25 %	50 %	147672059
59	NC_009456	ACAG	2	8	20301	20308	50 %	0 %	25 %	25 %	147672276
60	NC_009456	GCCA	2	8	20568	20575	25 %	0 %	25 %	50 %	147672276
61	NC_009456	GTTT	2	8	20982	20989	0 %	75 %	25 %	0 %	147672276
62	NC_009456	ATTG	2	8	21352	21359	25 %	50 %	25 %	0 %	147672276
63	NC_009456	ACTC	2	8	21364	21371	25 %	25 %	0 %	50 %	147672276
64	NC_009456	ACCA	2	8	21664	21671	50 %	0 %	0 %	50 %	147671784
65	NC_009456	ACTG	2	8	22446	22453	25 %	25 %	25 %	25 %	147671674
66	NC_009456	CCAG	2	8	22496	22503	25 %	0 %	25 %	50 %	147671674
67	NC_009456	TCAA	2	8	22655	22662	50 %	25 %	0 %	25 %	147671674
68	NC_009456	GCCA	2	8	23891	23898	25 %	0 %	25 %	50 %	147671674
69	NC_009456	GGTA	2	8	24202	24209	25 %	25 %	50 %	0 %	147672171
70	NC_009456	AAAG	2	8	24246	24253	75 %	0 %	25 %	0 %	147672171
71	NC_009456	GATC	2	8	25433	25440	25 %	25 %	25 %	25 %	147672171
72	NC_009456	ATCA	2	8	25674	25681	50 %	25 %	0 %	25 %	147672171
73	NC_009456	TGGG	2	8	25774	25781	0 %	25 %	75 %	0 %	147672171
74	NC_009456	GCCA	2	8	25788	25795	25 %	0 %	25 %	50 %	147672171
75	NC_009456	CACC	2	8	25847	25854	25 %	0 %	0 %	75 %	147672171
76	NC_009456	CAAA	2	8	26111	26118	75 %	0 %	0 %	25 %	147672171
77	NC_009456	GCTT	2	8	26341	26348	0 %	50 %	25 %	25 %	147672171
78	NC_009456	TTGA	2	8	26563	26570	25 %	50 %	25 %	0 %	147671772
79	NC_009456	TCTG	2	8	26667	26674	0 %	50 %	25 %	25 %	147671772
80	NC_009456	CGCA	2	8	26689	26696	25 %	0 %	25 %	50 %	147671772
81	NC_009456	TCGG	2	8	26705	26712	0 %	25 %	50 %	25 %	147671772
82	NC_009456	GCTC	2	8	26730	26737	0 %	25 %	25 %	50 %	147671772
83	NC_009456	ATAA	2	8	26848	26855	75 %	25 %	0 %	0 %	147671772
84	NC_009456	ATCA	2	8	27196	27203	50 %	25 %	0 %	25 %	147671772
85	NC_009456	TCGC	2	8	28015	28022	0 %	25 %	25 %	50 %	147671947
86	NC_009456	CGCT	2	8	28463	28470	0 %	25 %	25 %	50 %	147671947
87	NC_009456	TCAC	2	8	29582	29589	25 %	25 %	0 %	50 %	147671976
88	NC_009456	TTGG	2	8	30176	30183	0 %	50 %	50 %	0 %	147671976
89	NC_009456	CACT	2	8	30330	30337	25 %	25 %	0 %	50 %	147671976
90	NC_009456	CATC	2	8	30749	30756	25 %	25 %	0 %	50 %	147671686
91	NC_009456	CAAT	2	8	30901	30908	50 %	25 %	0 %	25 %	147671686
92	NC_009456	ACGT	2	8	31215	31222	25 %	25 %	25 %	25 %	147671686
93	NC_009456	AATC	2	8	31260	31267	50 %	25 %	0 %	25 %	147671686
94	NC_009456	GTCG	2	8	32090	32097	0 %	25 %	50 %	25 %	147672162
95	NC_009456	TTGA	2	8	32157	32164	25 %	50 %	25 %	0 %	147672162
96	NC_009456	CCAA	2	8	32381	32388	50 %	0 %	0 %	50 %	147672162
97	NC_009456	ATCG	2	8	32474	32481	25 %	25 %	25 %	25 %	147672162
98	NC_009456	GAGT	2	8	33177	33184	25 %	25 %	50 %	0 %	147672162
99	NC_009456	CATC	2	8	33926	33933	25 %	25 %	0 %	50 %	147672284
100	NC_009456	TACG	2	8	33968	33975	25 %	25 %	25 %	25 %	147672284
101	NC_009456	CATC	2	8	35051	35058	25 %	25 %	0 %	50 %	147672284
102	NC_009456	CAAC	2	8	35084	35091	50 %	0 %	0 %	50 %	147672284
103	NC_009456	TCAA	2	8	35489	35496	50 %	25 %	0 %	25 %	147671915
104	NC_009456	GCTC	2	8	35631	35638	0 %	25 %	25 %	50 %	147671915
105	NC_009456	CTTC	2	8	35826	35833	0 %	50 %	0 %	50 %	147672397
106	NC_009456	TTGA	2	8	35886	35893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009456	TCAA	2	8	35900	35907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009456	AAAT	2	8	35998	36005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009456	AATA	2	8	36152	36159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009456	TTTC	2	8	36348	36355	0 %	75 %	0 %	25 %	147672189
111	NC_009456	CTGC	2	8	36431	36438	0 %	25 %	25 %	50 %	147672189
112	NC_009456	ACTC	2	8	36504	36511	25 %	25 %	0 %	50 %	147672189
113	NC_009456	CTGC	2	8	36567	36574	0 %	25 %	25 %	50 %	147672189
114	NC_009456	TCAA	2	8	36881	36888	50 %	25 %	0 %	25 %	147672189
115	NC_009456	AATA	2	8	36998	37005	75 %	25 %	0 %	0 %	147672189
116	NC_009456	TGCT	2	8	37279	37286	0 %	50 %	25 %	25 %	147671407
117	NC_009456	ATCA	2	8	37343	37350	50 %	25 %	0 %	25 %	147671407
118	NC_009456	ATTA	2	8	37877	37884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009456	ATTA	2	8	38048	38055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009456	AAGT	2	8	38137	38144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009456	ATAA	2	8	38159	38166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009456	CTCA	2	8	38459	38466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009456	AACA	2	8	39584	39591	75 %	0 %	0 %	25 %	147672092
124	NC_009456	CACT	2	8	39750	39757	25 %	25 %	0 %	50 %	147672092
125	NC_009456	GTTT	2	8	39912	39919	0 %	75 %	25 %	0 %	147672092
126	NC_009456	TGGT	2	8	40056	40063	0 %	50 %	50 %	0 %	147671884
127	NC_009456	CAGC	2	8	40293	40300	25 %	0 %	25 %	50 %	147671884
128	NC_009456	TTCC	2	8	40509	40516	0 %	50 %	0 %	50 %	147671884
129	NC_009456	CAAT	2	8	41577	41584	50 %	25 %	0 %	25 %	147671884
130	NC_009456	TTCA	2	8	41809	41816	25 %	50 %	0 %	25 %	147671884
131	NC_009456	ATGG	2	8	42034	42041	25 %	25 %	50 %	0 %	147672516
132	NC_009456	CATG	2	8	42243	42250	25 %	25 %	25 %	25 %	147672516
133	NC_009456	AGTG	2	8	42679	42686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009456	TTAC	2	8	43357	43364	25 %	50 %	0 %	25 %	147671764
135	NC_009456	TGCT	2	8	43497	43504	0 %	50 %	25 %	25 %	147671764
136	NC_009456	TTGA	2	8	43634	43641	25 %	50 %	25 %	0 %	147671764
137	NC_009456	ACCA	2	8	43814	43821	50 %	0 %	0 %	50 %	147671764
138	NC_009456	TTGA	2	8	44521	44528	25 %	50 %	25 %	0 %	147671576
139	NC_009456	TTGA	2	8	44686	44693	25 %	50 %	25 %	0 %	147671576
140	NC_009456	CAAA	2	8	45309	45316	75 %	0 %	0 %	25 %	147671842
141	NC_009456	GAAA	2	8	46141	46148	75 %	0 %	25 %	0 %	147672331
142	NC_009456	TCGG	2	8	46376	46383	0 %	25 %	50 %	25 %	147672331
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