MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009456	CTCA	2	8	3402	3409	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009456	TGAG	2	8	3429	3436	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009456	TTAA	2	8	11642	11649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009456	CATT	2	8	11671	11678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009456	CTTC	2	8	15364	15371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009456	TTGA	2	8	35886	35893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009456	TCAA	2	8	35900	35907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009456	AAAT	2	8	35998	36005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009456	AATA	2	8	36152	36159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009456	ATTA	2	8	37877	37884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009456	ATTA	2	8	38048	38055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009456	AAGT	2	8	38137	38144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009456	ATAA	2	8	38159	38166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009456	CTCA	2	8	38459	38466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009456	AGTG	2	8	42679	42686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009456	CAGC	2	8	47314	47321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009456	GTGA	2	8	47409	47416	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009456	TAAA	2	8	50295	50302	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009456	TAAA	2	8	50370	50377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009456	ATAA	2	8	50482	50489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009456	AGTG	2	8	50518	50525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009456	TAGT	2	8	50985	50992	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009456	GAGT	2	8	52684	52691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009456	AAAT	2	8	59157	59164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009456	CCAA	2	8	59170	59177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009456	AATA	2	8	59179	59186	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009456	GTCA	2	8	64318	64325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009456	AATA	2	8	66292	66299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009456	AATT	2	8	66333	66340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009456	AAAT	2	8	66355	66362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009456	ATTT	2	8	73575	73582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009456	CAAG	2	8	75369	75376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009456	TTGA	2	8	84024	84031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009456	CGAA	2	8	85700	85707	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009456	AATT	2	8	85804	85811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009456	ACCA	2	8	90486	90493	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009456	AACG	2	8	97885	97892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009456	TCAC	2	8	101419	101426	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009456	GATA	2	8	101778	101785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009456	TTAC	2	8	107264	107271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009456	ATCA	2	8	115161	115168	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009456	GATT	2	8	119920	119927	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009456	TTCC	2	8	132301	132308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009456	TAAA	2	8	132967	132974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009456	CTTG	2	8	133113	133120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009456	AGTG	2	8	140579	140586	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009456	GATT	2	8	140801	140808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009456	GCAA	2	8	144315	144322	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009456	TAAG	2	8	148318	148325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009456	GAGC	2	8	149442	149449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009456	ATAA	2	8	151653	151660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009456	TCCT	2	8	151981	151988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009456	TAAA	2	8	152768	152775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009456	TGGC	2	8	158436	158443	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009456	TGGC	2	8	162452	162459	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009456	CGTT	2	8	164993	165000	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009456	AAAC	2	8	166938	166945	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009456	ATGA	2	8	166970	166977	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009456	GCAG	2	8	171774	171781	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009456	TCTG	2	8	185519	185526	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009456	CAAT	2	8	192595	192602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009456	CTGC	2	8	198116	198123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009456	ACTT	2	8	198194	198201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009456	GCCA	2	8	198301	198308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009456	CTTT	2	8	203800	203807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009456	GCTG	2	8	204241	204248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009456	AGCC	2	8	208749	208756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_009456	TAAA	2	8	209106	209113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009456	ATTT	2	8	209620	209627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009456	GAAT	2	8	216168	216175	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009456	ATAG	2	8	216990	216997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009456	CTGA	2	8	217276	217283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009456	TCGC	2	8	220604	220611	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009456	GTGA	2	8	221909	221916	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009456	TCAT	2	8	222746	222753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009456	GTCA	2	8	224174	224181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009456	TACC	2	8	228122	228129	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009456	TTTA	2	8	237333	237340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009456	CGAA	2	8	238519	238526	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009456	TTTA	2	8	239006	239013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009456	AGGT	2	8	242465	242472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009456	ATTT	2	8	242538	242545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009456	TTCG	2	8	243204	243211	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009456	TATG	2	8	245135	245142	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009456	GTTG	2	8	245199	245206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009456	TTTA	2	8	247818	247825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009456	ACCG	2	8	250381	250388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009456	TTGA	2	8	251801	251808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009456	CAAA	2	8	252681	252688	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009456	CCAA	2	8	252782	252789	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009456	TCCA	2	8	255380	255387	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009456	AAAT	2	8	261575	261582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009456	CGTT	2	8	262977	262984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009456	TTGA	2	8	265964	265971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009456	TTGC	2	8	266579	266586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009456	ATTT	2	8	266632	266639	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009456	AATG	2	8	267120	267127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009456	TTCA	2	8	271461	271468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009456	ATTG	2	8	278694	278701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009456	AGCG	2	8	282783	282790	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009456	GCTC	2	8	292227	292234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009456	ACTC	2	8	295065	295072	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009456	GTGC	2	8	296028	296035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_009456	TTCA	2	8	298501	298508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009456	GAAG	2	8	300860	300867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009456	AACA	2	8	305369	305376	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009456	ACAA	2	8	307173	307180	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009456	CAAA	2	8	307191	307198	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009456	CGTT	2	8	307265	307272	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009456	ATGA	2	8	309023	309030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009456	GTTC	2	8	314146	314153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_009456	AGTT	2	8	314861	314868	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009456	CGTT	2	8	315016	315023	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009456	CTTA	2	8	321927	321934	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009456	GCTG	2	8	331677	331684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009456	TGCA	2	8	332847	332854	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009456	GATG	2	8	337715	337722	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009456	AAAT	2	8	338449	338456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009456	TGAG	2	8	339139	339146	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009456	CGTT	2	8	346440	346447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009456	GTCT	2	8	346463	346470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009456	TAAA	2	8	351410	351417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009456	TACT	2	8	353811	353818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009456	ATAA	2	8	362156	362163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009456	CTGC	2	8	364195	364202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009456	AGTG	2	8	364235	364242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009456	CTTT	2	8	368132	368139	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009456	GAAT	2	8	370812	370819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009456	TAGC	2	8	371158	371165	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009456	ACAT	2	8	375118	375125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009456	TGTT	2	8	378199	378206	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009456	TCCT	2	8	379569	379576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009456	GGAA	2	8	379597	379604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009456	GTTT	2	8	387379	387386	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009456	GAAA	2	8	388041	388048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009456	TTTA	2	8	392450	392457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009456	TAGT	2	8	392581	392588	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009456	ATGG	2	8	392665	392672	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009456	TTAT	2	8	392697	392704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009456	ATTT	2	8	392772	392779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009456	CTGA	2	8	395661	395668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009456	ATAA	2	8	395838	395845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009456	GTGA	2	8	397328	397335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009456	TTAA	2	8	397750	397757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009456	GAAT	2	8	397968	397975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009456	ATAG	2	8	398021	398028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009456	ATTG	2	8	398096	398103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009456	ATCC	2	8	402751	402758	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009456	ACTG	2	8	402760	402767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009456	TTAA	2	8	403921	403928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009456	AGTA	2	8	404078	404085	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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