MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 12028

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009456	TTG	2	6	118	123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671835
2	NC_009456	CTA	2	6	134	139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671835
3	NC_009456	GCA	2	6	367	372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671835
4	NC_009456	CTG	2	6	390	395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671835
5	NC_009456	TGG	2	6	456	461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671835
6	NC_009456	GTG	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671835
7	NC_009456	GGT	3	9	516	524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671835
8	NC_009456	GAT	2	6	567	572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671835
9	NC_009456	CTC	2	6	649	654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147671835
10	NC_009456	ACC	2	6	668	673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671835
11	NC_009456	GAT	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671835
12	NC_009456	TCT	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671835
13	NC_009456	CAA	3	9	767	775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671835
14	NC_009456	AAG	2	6	859	864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671835
15	NC_009456	TCT	2	6	888	893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671835
16	NC_009456	TGT	2	6	937	942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671835
17	NC_009456	GCC	2	6	973	978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671835
18	NC_009456	CAG	2	6	985	990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671835
19	NC_009456	GCT	2	6	1071	1076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671835
20	NC_009456	GAA	2	6	1148	1153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671835
21	NC_009456	GCC	2	6	1155	1160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671835
22	NC_009456	GCA	2	6	1167	1172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671835
23	NC_009456	GGT	2	6	1200	1205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671835
24	NC_009456	GGC	2	6	1260	1265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671835
25	NC_009456	ATG	2	6	1524	1529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672362
26	NC_009456	CTG	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672362
27	NC_009456	TGA	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672362
28	NC_009456	TGG	2	6	1735	1740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672362
29	NC_009456	TTA	2	6	1817	1822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147672362
30	NC_009456	AGA	2	6	1964	1969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672362
31	NC_009456	ACA	2	6	2008	2013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672362
32	NC_009456	GAC	2	6	2121	2126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672362
33	NC_009456	ATG	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672362
34	NC_009456	GCT	2	6	2180	2185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672362
35	NC_009456	GCT	2	6	2219	2224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672362
36	NC_009456	GGC	2	6	2307	2312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672362
37	NC_009456	ATG	2	6	2371	2376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672362
38	NC_009456	CCA	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672362
39	NC_009456	ACA	2	6	2389	2394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672362
40	NC_009456	TGA	2	6	2410	2415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672362
41	NC_009456	GTG	2	6	2439	2444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672362
42	NC_009456	AAT	2	6	2590	2595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672362
43	NC_009456	TGA	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671726
44	NC_009456	CCA	2	6	2733	2738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671726
45	NC_009456	AGC	2	6	2843	2848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671726
46	NC_009456	TTC	2	6	3019	3024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671726
47	NC_009456	CCA	2	6	3027	3032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671726
48	NC_009456	GCC	2	6	3128	3133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671726
49	NC_009456	TGC	2	6	3194	3199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671726
50	NC_009456	GTA	2	6	3305	3310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671726
51	NC_009456	AGC	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671999
52	NC_009456	CAT	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671999
53	NC_009456	ACA	2	6	3589	3594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671999
54	NC_009456	ATT	2	6	3599	3604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671999
55	NC_009456	CCG	2	6	3670	3675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671999
56	NC_009456	CTT	2	6	3715	3720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671999
57	NC_009456	GCG	2	6	3837	3842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671999
58	NC_009456	TCA	2	6	3867	3872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671999
59	NC_009456	CCA	2	6	3886	3891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671999
60	NC_009456	CAC	2	6	3961	3966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671999
61	NC_009456	GAT	2	6	3989	3994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671999
62	NC_009456	TGC	2	6	4018	4023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671999
63	NC_009456	CAC	2	6	4051	4056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671999
64	NC_009456	CAA	2	6	4103	4108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671999
65	NC_009456	TGA	2	6	4344	4349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671650
66	NC_009456	CAC	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671650
67	NC_009456	TCA	2	6	4395	4400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671650
68	NC_009456	CCA	2	6	4410	4415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671650
69	NC_009456	TCG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671650
70	NC_009456	TCA	2	6	4557	4562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671650
71	NC_009456	AGC	2	6	4595	4600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671650
72	NC_009456	GCT	2	6	4609	4614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671650
73	NC_009456	ACG	2	6	4625	4630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671650
74	NC_009456	AGA	2	6	4689	4694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147671650
75	NC_009456	CAA	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671650
76	NC_009456	TCA	2	6	4917	4922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671650
77	NC_009456	CAC	2	6	5082	5087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671890
78	NC_009456	GTG	2	6	5119	5124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671890
79	NC_009456	CAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671890
80	NC_009456	CAT	2	6	5313	5318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671890
81	NC_009456	ACC	2	6	5385	5390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671890
82	NC_009456	TGG	2	6	5488	5493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671890
83	NC_009456	GCC	2	6	5554	5559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671890
84	NC_009456	CAG	2	6	5697	5702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671890
85	NC_009456	GCA	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671890
86	NC_009456	GGT	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671890
87	NC_009456	GCG	2	6	5941	5946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671890
88	NC_009456	TCA	2	6	5968	5973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671890
89	NC_009456	TGG	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671890
90	NC_009456	CAA	2	6	6202	6207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671538
91	NC_009456	GCG	2	6	6242	6247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671538
92	NC_009456	GTG	2	6	6248	6253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671538
93	NC_009456	CAC	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671538
94	NC_009456	TAA	2	6	6333	6338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671538
95	NC_009456	CCG	2	6	6372	6377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671538
96	NC_009456	TGC	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671538
97	NC_009456	ATC	2	6	6394	6399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671538
98	NC_009456	TCA	2	6	6473	6478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671538
99	NC_009456	CTT	2	6	6534	6539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671538
100	NC_009456	GCT	2	6	6542	6547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671538
101	NC_009456	CGC	2	6	6607	6612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671538
102	NC_009456	CAC	2	6	6681	6686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671538
103	NC_009456	ATC	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671538
104	NC_009456	ATC	2	6	6799	6804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671538
105	NC_009456	GCA	2	6	6942	6947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671538
106	NC_009456	ACC	2	6	6974	6979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671538
107	NC_009456	ATT	2	6	7128	7133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671798
108	NC_009456	GCT	2	6	7233	7238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671798
109	NC_009456	GGC	2	6	7249	7254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671798
110	NC_009456	CAT	2	6	7284	7289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671798
111	NC_009456	CAA	2	6	7305	7310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671798
112	NC_009456	TCA	2	6	7311	7316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671798
113	NC_009456	CAG	2	6	7468	7473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671798
114	NC_009456	TGC	2	6	7482	7487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671798
115	NC_009456	CAC	2	6	7512	7517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671798
116	NC_009456	CGC	2	6	7525	7530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671798
117	NC_009456	CGC	2	6	7611	7616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671798
118	NC_009456	CAC	2	6	7653	7658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671798
119	NC_009456	CGC	2	6	7767	7772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671798
120	NC_009456	GTT	2	6	7900	7905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671798
121	NC_009456	CAA	2	6	7947	7952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671798
122	NC_009456	AGC	2	6	7975	7980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671798
123	NC_009456	TGT	2	6	8079	8084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672299
124	NC_009456	GTA	2	6	8131	8136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672299
125	NC_009456	GGA	2	6	8137	8142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147672299
126	NC_009456	GTT	2	6	8164	8169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672299
127	NC_009456	GAT	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672299
128	NC_009456	ATG	2	6	8207	8212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672299
129	NC_009456	CAC	2	6	8248	8253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672299
130	NC_009456	AGA	2	6	8302	8307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672299
131	NC_009456	GAT	2	6	8323	8328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672299
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133	NC_009456	CCG	2	6	8559	8564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672299
134	NC_009456	GCA	2	6	8622	8627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672299
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139	NC_009456	CAG	2	6	8953	8958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672299
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159	NC_009456	CCA	2	6	10969	10974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229259762
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254	NC_009456	GCA	2	6	19245	19250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671876
255	NC_009456	GCA	2	6	19485	19490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671876
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257	NC_009456	GCG	2	6	19621	19626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671876
258	NC_009456	CAT	2	6	19638	19643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671876
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374	NC_009456	CAC	2	6	28115	28120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671947
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500	NC_009456	CAC	2	6	42399	42404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672516

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