MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 303

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009456	GT	3	6	1378	1383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009456	CT	4	8	1455	1462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009456	TC	3	6	4938	4943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009456	TG	3	6	15223	15228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009456	AT	3	6	36045	36050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009456	AT	3	6	36233	36238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009456	AT	3	6	37640	37645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009456	AC	3	6	38875	38880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009456	CT	3	6	41874	41879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009456	CA	3	6	42701	42706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009456	TG	3	6	50328	50333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009456	AT	3	6	50995	51000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009456	CA	3	6	55219	55224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009456	TA	3	6	55942	55947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009456	GA	4	8	55982	55989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009456	AG	3	6	59111	59116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009456	AG	3	6	60338	60343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009456	TG	3	6	63708	63713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009456	TC	3	6	64150	64155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009456	CA	3	6	66234	66239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009456	GT	3	6	66470	66475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009456	AG	3	6	90565	90570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009456	TC	3	6	90585	90590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009456	AC	3	6	97866	97871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009456	TC	3	6	103983	103988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_009456	AG	3	6	105559	105564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009456	TA	3	6	109569	109574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009456	GA	4	8	116864	116871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009456	CT	3	6	117086	117091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009456	TC	3	6	119694	119699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009456	AG	3	6	119776	119781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009456	AG	3	6	133178	133183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009456	TA	3	6	133311	133316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009456	GT	3	6	135637	135642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009456	CT	3	6	137912	137917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009456	TC	3	6	147918	147923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009456	CT	3	6	148756	148761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009456	CA	3	6	151928	151933	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009456	AG	3	6	152021	152026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009456	TG	3	6	152723	152728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009456	CG	3	6	162397	162402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009456	GA	3	6	171801	171806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009456	GA	3	6	181844	181849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009456	AC	3	6	193549	193554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009456	TA	3	6	207252	207257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009456	AT	4	8	209077	209084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009456	AT	4	8	209120	209127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009456	GA	4	8	213574	213581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009456	AC	3	6	213589	213594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009456	GC	3	6	215074	215079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009456	TA	3	6	216093	216098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009456	AC	3	6	220642	220647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009456	CA	3	6	221321	221326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009456	TC	3	6	225247	225252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009456	TC	3	6	228145	228150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009456	CA	3	6	230257	230262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009456	AG	3	6	232012	232017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009456	TC	3	6	232023	232028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009456	AT	3	6	232045	232050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009456	GC	3	6	247727	247732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009456	CT	3	6	248005	248010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009456	AG	3	6	259857	259862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009456	CT	3	6	266068	266073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009456	TG	3	6	266565	266570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009456	TG	3	6	266624	266629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009456	TG	3	6	267153	267158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009456	AG	3	6	267222	267227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009456	CT	3	6	267856	267861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009456	AC	3	6	271391	271396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009456	AG	3	6	279684	279689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009456	AG	3	6	282672	282677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009456	AG	3	6	284499	284504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009456	CT	3	6	284523	284528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_009456	GT	3	6	290910	290915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009456	CT	4	8	303244	303251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009456	CT	3	6	308016	308021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_009456	TG	3	6	315125	315130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009456	AG	3	6	320293	320298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009456	TG	3	6	322418	322423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009456	TC	3	6	323700	323705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009456	TC	3	6	325852	325857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009456	AG	3	6	325889	325894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009456	TC	3	6	327393	327398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009456	CT	3	6	327494	327499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009456	AC	3	6	332819	332824	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009456	AG	3	6	333806	333811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009456	TC	3	6	337627	337632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009456	AG	4	8	338319	338326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009456	TC	3	6	341751	341756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009456	TC	3	6	344101	344106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009456	GC	3	6	350722	350727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009456	TG	3	6	353297	353302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009456	CT	3	6	353840	353845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009456	GA	3	6	353941	353946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009456	GA	3	6	354893	354898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009456	TC	3	6	359441	359446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009456	CT	3	6	362150	362155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009456	CT	3	6	368237	368242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009456	AT	3	6	370664	370669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009456	CT	4	8	370841	370848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009456	CT	3	6	378230	378235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009456	AC	3	6	379655	379660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009456	TC	3	6	387234	387239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009456	TA	4	8	392544	392551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009456	AC	3	6	397365	397370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_009456	AC	3	6	397925	397930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009456	TG	3	6	398085	398090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009456	CT	3	6	399568	399573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009456	AG	3	6	402911	402916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009456	AT	3	6	404126	404131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009456	TG	3	6	404783	404788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009456	TG	3	6	404794	404799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009456	GC	3	6	404807	404812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009456	TC	3	6	424022	424027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009456	TG	3	6	435136	435141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009456	GC	3	6	435160	435165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009456	AT	3	6	439656	439661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009456	AG	3	6	439877	439882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009456	TC	3	6	440692	440697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009456	CT	3	6	441858	441863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009456	TC	3	6	441914	441919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009456	CT	3	6	447960	447965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009456	TG	3	6	452908	452913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009456	AC	3	6	461752	461757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009456	GA	3	6	464723	464728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009456	TC	3	6	467984	467989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009456	AT	3	6	469975	469980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009456	GT	3	6	471799	471804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009456	TG	4	8	472721	472728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009456	CA	3	6	478632	478637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009456	GT	3	6	479780	479785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009456	AT	3	6	479831	479836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009456	AC	3	6	479837	479842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009456	GC	3	6	483864	483869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009456	TA	3	6	492957	492962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009456	GA	3	6	493001	493006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009456	AT	3	6	510752	510757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009456	AT	3	6	510794	510799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009456	AT	3	6	513557	513562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009456	AT	3	6	513762	513767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009456	GC	3	6	513816	513821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009456	GA	3	6	515987	515992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009456	TA	3	6	516162	516167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009456	AC	3	6	523919	523924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009456	TC	3	6	524265	524270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009456	CA	3	6	532574	532579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009456	TG	3	6	532584	532589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009456	AG	3	6	534481	534486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009456	AG	3	6	534542	534547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009456	AG	3	6	538104	538109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009456	TG	3	6	552647	552652	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009456	CA	3	6	552681	552686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_009456	AG	3	6	560409	560414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009456	GT	3	6	560458	560463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.