MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 1470

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009456	AT	3	6	3846	3851	50 %	50 %	0 %	0 %	147671999
2	NC_009456	AG	3	6	4303	4308	50 %	0 %	50 %	0 %	147671650
3	NC_009456	AC	3	6	4314	4319	50 %	0 %	0 %	50 %	147671650
4	NC_009456	CG	3	6	5905	5910	0 %	0 %	50 %	50 %	147671890
5	NC_009456	CA	3	6	6311	6316	50 %	0 %	0 %	50 %	147671538
6	NC_009456	GC	3	6	6384	6389	0 %	0 %	50 %	50 %	147671538
7	NC_009456	AC	3	6	6458	6463	50 %	0 %	0 %	50 %	147671538
8	NC_009456	CG	3	6	6842	6847	0 %	0 %	50 %	50 %	147671538
9	NC_009456	CA	3	6	8784	8789	50 %	0 %	0 %	50 %	147672299
10	NC_009456	GC	3	6	9500	9505	0 %	0 %	50 %	50 %	147671783
11	NC_009456	GC	3	6	9662	9667	0 %	0 %	50 %	50 %	147671783
12	NC_009456	CG	3	6	10661	10666	0 %	0 %	50 %	50 %	229259762
13	NC_009456	AG	3	6	10979	10984	50 %	0 %	50 %	0 %	229259762
14	NC_009456	TG	3	6	11547	11552	0 %	50 %	50 %	0 %	147672208
15	NC_009456	TA	3	6	11727	11732	50 %	50 %	0 %	0 %	147671565
16	NC_009456	TA	3	6	11817	11822	50 %	50 %	0 %	0 %	147671565
17	NC_009456	AC	3	6	11952	11957	50 %	0 %	0 %	50 %	147671565
18	NC_009456	AT	3	6	12534	12539	50 %	50 %	0 %	0 %	147671421
19	NC_009456	GT	3	6	14571	14576	0 %	50 %	50 %	0 %	147671421
20	NC_009456	CA	3	6	14663	14668	50 %	0 %	0 %	50 %	147671421
21	NC_009456	CG	3	6	17890	17895	0 %	0 %	50 %	50 %	147671876
22	NC_009456	CT	3	6	18314	18319	0 %	50 %	0 %	50 %	147671876
23	NC_009456	AC	3	6	18474	18479	50 %	0 %	0 %	50 %	147671876
24	NC_009456	CT	3	6	18712	18717	0 %	50 %	0 %	50 %	147671876
25	NC_009456	AG	3	6	18865	18870	50 %	0 %	50 %	0 %	147671876
26	NC_009456	CG	3	6	18985	18990	0 %	0 %	50 %	50 %	147671876
27	NC_009456	GA	5	10	21520	21529	50 %	0 %	50 %	0 %	147672276
28	NC_009456	CA	3	6	21623	21628	50 %	0 %	0 %	50 %	147672276
29	NC_009456	CG	3	6	22393	22398	0 %	0 %	50 %	50 %	147671674
30	NC_009456	GC	3	6	22641	22646	0 %	0 %	50 %	50 %	147671674
31	NC_009456	GT	3	6	22906	22911	0 %	50 %	50 %	0 %	147671674
32	NC_009456	CT	3	6	23972	23977	0 %	50 %	0 %	50 %	147672171
33	NC_009456	CT	3	6	24100	24105	0 %	50 %	0 %	50 %	147672171
34	NC_009456	GT	3	6	24562	24567	0 %	50 %	50 %	0 %	147672171
35	NC_009456	TG	3	6	25382	25387	0 %	50 %	50 %	0 %	147672171
36	NC_009456	AG	3	6	26367	26372	50 %	0 %	50 %	0 %	147672171
37	NC_009456	AG	4	8	26438	26445	50 %	0 %	50 %	0 %	147672171
38	NC_009456	AC	6	12	27846	27857	50 %	0 %	0 %	50 %	147671947
39	NC_009456	GA	3	6	27858	27863	50 %	0 %	50 %	0 %	147671947
40	NC_009456	TG	3	6	29294	29299	0 %	50 %	50 %	0 %	147671976
41	NC_009456	CA	3	6	29617	29622	50 %	0 %	0 %	50 %	147671976
42	NC_009456	TG	3	6	29755	29760	0 %	50 %	50 %	0 %	147671976
43	NC_009456	TG	3	6	31638	31643	0 %	50 %	50 %	0 %	147672162
44	NC_009456	CA	3	6	31940	31945	50 %	0 %	0 %	50 %	147672162
45	NC_009456	CA	3	6	32099	32104	50 %	0 %	0 %	50 %	147672162
46	NC_009456	CT	3	6	32247	32252	0 %	50 %	0 %	50 %	147672162
47	NC_009456	AG	3	6	32839	32844	50 %	0 %	50 %	0 %	147672162
48	NC_009456	GT	3	6	32959	32964	0 %	50 %	50 %	0 %	147672162
49	NC_009456	CG	3	6	33222	33227	0 %	0 %	50 %	50 %	147672162
50	NC_009456	GA	3	6	33581	33586	50 %	0 %	50 %	0 %	147671801
51	NC_009456	CT	3	6	33788	33793	0 %	50 %	0 %	50 %	147671801
52	NC_009456	GC	3	6	33942	33947	0 %	0 %	50 %	50 %	147672284
53	NC_009456	GC	3	6	34593	34598	0 %	0 %	50 %	50 %	147672284
54	NC_009456	TC	3	6	35390	35395	0 %	50 %	0 %	50 %	147671915
55	NC_009456	TC	3	6	39439	39444	0 %	50 %	0 %	50 %	147672092
56	NC_009456	TG	3	6	39690	39695	0 %	50 %	50 %	0 %	147672092
57	NC_009456	CA	3	6	40354	40359	50 %	0 %	0 %	50 %	147671884
58	NC_009456	GA	3	6	41408	41413	50 %	0 %	50 %	0 %	147671884
59	NC_009456	AC	3	6	41627	41632	50 %	0 %	0 %	50 %	147671884
60	NC_009456	TC	3	6	42129	42134	0 %	50 %	0 %	50 %	147672516
61	NC_009456	CT	4	8	43218	43225	0 %	50 %	0 %	50 %	147671764
62	NC_009456	TC	3	6	43582	43587	0 %	50 %	0 %	50 %	147671764
63	NC_009456	GC	3	6	44478	44483	0 %	0 %	50 %	50 %	147671576
64	NC_009456	AG	3	6	44799	44804	50 %	0 %	50 %	0 %	147671842
65	NC_009456	TG	3	6	44927	44932	0 %	50 %	50 %	0 %	147671842
66	NC_009456	CA	3	6	45990	45995	50 %	0 %	0 %	50 %	147672331
67	NC_009456	CA	3	6	46173	46178	50 %	0 %	0 %	50 %	147672331
68	NC_009456	CG	3	6	47756	47761	0 %	0 %	50 %	50 %	147671694
69	NC_009456	GC	3	6	48029	48034	0 %	0 %	50 %	50 %	147671694
70	NC_009456	TG	3	6	49288	49293	0 %	50 %	50 %	0 %	147672107
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72	NC_009456	TC	3	6	50824	50829	0 %	50 %	0 %	50 %	147672104
73	NC_009456	TG	3	6	51856	51861	0 %	50 %	50 %	0 %	147671916
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81	NC_009456	AC	3	6	57988	57993	50 %	0 %	0 %	50 %	147672367
82	NC_009456	GA	3	6	58680	58685	50 %	0 %	50 %	0 %	147672367
83	NC_009456	GA	3	6	58689	58694	50 %	0 %	50 %	0 %	147672367
84	NC_009456	AC	3	6	58732	58737	50 %	0 %	0 %	50 %	147672367
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87	NC_009456	CA	3	6	60630	60635	50 %	0 %	0 %	50 %	147672425
88	NC_009456	CT	3	6	61798	61803	0 %	50 %	0 %	50 %	147672425
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101	NC_009456	AG	3	6	74668	74673	50 %	0 %	50 %	0 %	147671767
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103	NC_009456	CG	3	6	74896	74901	0 %	0 %	50 %	50 %	147671767
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108	NC_009456	GA	3	6	77473	77478	50 %	0 %	50 %	0 %	147672272
109	NC_009456	GA	3	6	78792	78797	50 %	0 %	50 %	0 %	147672272
110	NC_009456	CT	3	6	80011	80016	0 %	50 %	0 %	50 %	147671724
111	NC_009456	TG	3	6	80921	80926	0 %	50 %	50 %	0 %	147671724
112	NC_009456	GC	3	6	82330	82335	0 %	0 %	50 %	50 %	147672486
113	NC_009456	GA	3	6	82799	82804	50 %	0 %	50 %	0 %	147672486
114	NC_009456	GT	3	6	82990	82995	0 %	50 %	50 %	0 %	147672486
115	NC_009456	CG	3	6	83512	83517	0 %	0 %	50 %	50 %	147672486
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123	NC_009456	AC	3	6	88673	88678	50 %	0 %	0 %	50 %	147671661
124	NC_009456	CG	3	6	89765	89770	0 %	0 %	50 %	50 %	147672017
125	NC_009456	CA	3	6	90076	90081	50 %	0 %	0 %	50 %	147672017
126	NC_009456	CT	3	6	90123	90128	0 %	50 %	0 %	50 %	147672017
127	NC_009456	CA	3	6	90711	90716	50 %	0 %	0 %	50 %	147672088
128	NC_009456	CA	3	6	92080	92085	50 %	0 %	0 %	50 %	147672075
129	NC_009456	GC	3	6	94123	94128	0 %	0 %	50 %	50 %	147671462
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131	NC_009456	TG	3	6	94299	94304	0 %	50 %	50 %	0 %	147671462
132	NC_009456	GC	3	6	94681	94686	0 %	0 %	50 %	50 %	147672243
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134	NC_009456	CT	3	6	95315	95320	0 %	50 %	0 %	50 %	147672243
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139	NC_009456	CT	3	6	97460	97465	0 %	50 %	0 %	50 %	147672478
140	NC_009456	CA	3	6	100524	100529	50 %	0 %	0 %	50 %	147671883
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