MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Pelotomaculum thermopropionicum SI chromosome

Total Repeats: 1842

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009454	AGTA	2	8	1454	1461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009454	ATTT	2	8	7750	7757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009454	GGCC	2	8	8479	8486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009454	GAAT	2	8	8543	8550	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009454	GCAT	2	8	8604	8611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009454	CGCC	2	8	11341	11348	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_009454	TTAA	2	8	11597	11604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009454	ATTA	2	8	12599	12606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009454	CCGG	2	8	13360	13367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009454	GATG	2	8	13479	13486	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009454	AGGC	2	8	13526	13533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009454	GTTT	2	8	16469	16476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009454	CAGG	2	8	18838	18845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_009454	GCGG	2	8	19284	19291	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009454	CCGG	2	8	19343	19350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009454	GCCG	2	8	26141	26148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009454	GGCG	2	8	28085	28092	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009454	CAGG	2	8	28111	28118	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009454	TAGT	2	8	29147	29154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009454	GGCA	2	8	29407	29414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009454	CATT	2	8	35399	35406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009454	CAAC	2	8	38535	38542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009454	AATG	2	8	38640	38647	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009454	GCTG	2	8	42200	42207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009454	TAAA	2	8	47400	47407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009454	CTGC	2	8	53569	53576	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009454	TCCC	2	8	66306	66313	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_009454	TTAT	2	8	70334	70341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009454	GAAA	2	8	76568	76575	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009454	ATGA	2	8	79935	79942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009454	AGGG	2	8	79983	79990	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009454	AAAG	2	8	82397	82404	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009454	GGCC	2	8	83395	83402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009454	GCTG	3	12	83474	83485	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009454	AGGA	2	8	87869	87876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009454	CGGC	3	12	88005	88016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009454	AACT	2	8	90228	90235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009454	AAGC	2	8	96088	96095	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009454	AGTA	2	8	96096	96103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009454	TTAT	3	12	100420	100431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009454	CGGA	2	8	106146	106153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009454	CCGG	2	8	107732	107739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009454	CGGG	2	8	107804	107811	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009454	GGTA	2	8	113939	113946	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009454	GGGA	2	8	116976	116983	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009454	TTAT	2	8	121442	121449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009454	CAAG	2	8	124786	124793	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009454	CCGG	2	8	125864	125871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009454	TAAA	2	8	126583	126590	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009454	GCCA	2	8	127304	127311	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009454	AAGG	2	8	136454	136461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009454	TAAT	2	8	138873	138880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009454	GCCT	2	8	140490	140497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009454	GTTT	3	12	155666	155677	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009454	AAAC	2	8	156028	156035	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009454	AATT	2	8	158036	158043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009454	GAAA	2	8	158742	158749	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009454	AATA	2	8	159102	159109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009454	AATT	2	8	159394	159401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009454	TTGT	2	8	159489	159496	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009454	AGGG	2	8	160689	160696	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009454	CCAG	2	8	162663	162670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009454	GGCC	2	8	163258	163265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009454	CCCG	2	8	168190	168197	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_009454	CGGG	2	8	168202	168209	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009454	GAAG	2	8	170288	170295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009454	GAAA	3	12	170499	170510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009454	GTCA	2	8	170768	170775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009454	ACGA	2	8	170858	170865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009454	TGGT	2	8	171002	171009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009454	ATTC	2	8	171069	171076	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009454	CGGG	2	8	171225	171232	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009454	GAAG	2	8	171310	171317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009454	AATA	2	8	173036	173043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009454	ACCC	2	8	173234	173241	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_009454	ACTT	2	8	173526	173533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009454	AGGA	2	8	174838	174845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009454	TCTT	2	8	174969	174976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009454	TTTA	2	8	178478	178485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009454	CAAA	2	8	178531	178538	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009454	CGGA	2	8	179436	179443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009454	TGAA	2	8	182255	182262	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009454	CAGC	2	8	187156	187163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009454	GCCG	2	8	190982	190989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009454	TAAT	2	8	190992	190999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009454	GAGT	2	8	191771	191778	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009454	AAGG	2	8	193151	193158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009454	GCCG	2	8	201277	201284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009454	TAAA	2	8	201313	201320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009454	GCCG	2	8	203177	203184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009454	TTTG	2	8	203263	203270	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009454	TGCT	2	8	203499	203506	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009454	TTAA	2	8	212054	212061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009454	GATT	2	8	215596	215603	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009454	GTTT	2	8	215880	215887	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009454	TTTA	2	8	216036	216043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009454	CGGC	2	8	216050	216057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009454	CCGG	2	8	221197	221204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009454	GCCG	2	8	223952	223959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009454	GCGG	2	8	224632	224639	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009454	ATTA	2	8	228437	228444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009454	AAAG	2	8	229731	229738	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009454	ATAA	2	8	231220	231227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009454	CCAG	2	8	236335	236342	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009454	AATT	2	8	236477	236484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009454	AAGG	2	8	236527	236534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009454	ATTA	2	8	250242	250249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009454	GGGA	2	8	250464	250471	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009454	GCCC	2	8	251636	251643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
110	NC_009454	CGGC	2	8	251658	251665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009454	AAAT	2	8	251770	251777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009454	GGGA	2	8	251805	251812	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009454	TTTA	2	8	253887	253894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009454	AGGC	2	8	258524	258531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009454	CGGG	2	8	258945	258952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009454	AGAA	2	8	258992	258999	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009454	GCAG	2	8	262745	262752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009454	AGGC	2	8	265299	265306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009454	CCTG	2	8	265562	265569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009454	GAAG	2	8	265885	265892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009454	GCCT	2	8	266042	266049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009454	ACAG	2	8	267291	267298	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009454	AGAA	2	8	267671	267678	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009454	GCGA	2	8	267700	267707	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009454	ACCG	2	8	268337	268344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009454	AGGC	2	8	268610	268617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009454	CAAA	2	8	269126	269133	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009454	TAAG	2	8	269280	269287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009454	AGGC	2	8	269510	269517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009454	GCTT	2	8	270936	270943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009454	ACTG	2	8	276992	276999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009454	GCCT	2	8	277031	277038	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009454	GAAG	2	8	277226	277233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009454	ATTG	2	8	288275	288282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009454	GTCA	2	8	288307	288314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009454	CAGG	2	8	288324	288331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009454	TCCT	2	8	293850	293857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009454	GCGG	2	8	296456	296463	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009454	TCCG	2	8	306280	306287	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009454	TAAT	2	8	306292	306299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009454	AGTT	2	8	307105	307112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009454	CGCC	2	8	307150	307157	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_009454	GGCA	2	8	307252	307259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009454	GTAG	2	8	307743	307750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009454	GCCC	2	8	307952	307959	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_009454	TCCG	2	8	308021	308028	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009454	TAAG	2	8	308176	308183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009454	GGAA	2	8	313335	313342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009454	TTCT	2	8	316140	316147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_009454	TATG	2	8	316466	316473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009454	GACC	2	8	320253	320260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_009454	GCAG	2	8	327191	327198	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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155	NC_009454	GAAG	2	8	333591	333598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_009454	CCGG	2	8	340304	340311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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176	NC_009454	GGAT	2	8	388614	388621	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_009454	AAAG	2	8	388628	388635	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_009454	TTGG	2	8	395911	395918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_009454	AGGG	3	12	1078279	1078290	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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