MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter sp. Rue61a plasmid pAL1

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009453	GCCGAG	2	12	1449	1460	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	403571550
2	NC_009453	CCCAGG	2	12	1570	1581	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403571550
3	NC_009453	TCGTGG	2	12	8528	8539	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	403571555
4	NC_009453	CCGGCG	2	12	10797	10808	0 %	0 %	50 %	50 %	403571556
5	NC_009453	TTGACG	2	12	18900	18911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403571563
6	NC_009453	CCCCTG	2	12	24114	24125	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	403571570
7	NC_009453	CCGCGG	2	12	24639	24650	0 %	0 %	50 %	50 %	403571570
8	NC_009453	AGGACC	2	12	27689	27700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403571572
9	NC_009453	GGAGCT	2	12	41145	41156	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403571584
10	NC_009453	CGATGC	2	12	45904	45915	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403571590
11	NC_009453	CACGCT	2	12	46940	46951	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403571593
12	NC_009453	ATTCGA	2	12	49443	49454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403571594
13	NC_009453	AAGCTC	2	12	50999	51010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403571595
14	NC_009453	GTGGCA	2	12	51383	51394	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403571596
15	NC_009453	GCGACG	2	12	51525	51536	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	403571596
16	NC_009453	CCTCGG	2	12	55965	55976	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403571603
17	NC_009453	CCTGAT	2	12	57227	57238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403571606
18	NC_009453	GCCTTC	2	12	59238	59249	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	403571610
19	NC_009453	CCCTTC	2	12	60735	60746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403571610
20	NC_009453	CAGCCG	2	12	61693	61704	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403571611
21	NC_009453	TTGGCC	2	12	66158	66169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403571615
22	NC_009453	AGTTCC	2	12	67916	67927	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403571616
23	NC_009453	GTGAGG	2	12	70895	70906	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	403571619
24	NC_009453	GCAAGA	2	12	72691	72702	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	403571620
25	NC_009453	GTCGAA	2	12	74724	74735	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403571621
26	NC_009453	TCTGCT	2	12	82722	82733	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	403571624
27	NC_009453	CGTTGG	2	12	84555	84566	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	403571624
28	NC_009453	GTTGCC	2	12	85699	85710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403571626
29	NC_009453	TCATCG	2	12	87313	87324	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403571627
30	NC_009453	GCCGAC	2	12	87612	87623	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403571627
31	NC_009453	CCATGA	2	12	89192	89203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403571630
32	NC_009453	GCTCCT	2	12	91553	91564	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	403571632
33	NC_009453	CGGCCT	2	12	92413	92424	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403571633
34	NC_009453	ATCCTG	2	12	94568	94579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403571636
35	NC_009453	AACAGG	2	12	95779	95790	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	403571638
36	NC_009453	ACCAGA	2	12	97360	97371	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	403571639
37	NC_009453	CCGCGC	2	12	98171	98182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403571639
38	NC_009453	GGACCC	2	12	98603	98614	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403571639
39	NC_009453	GATGTC	2	12	101575	101586	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403571643
40	NC_009453	GCTCAA	2	12	103184	103195	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403571645
41	NC_009453	GCAAGG	2	12	107722	107733	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	403571648

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.