MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Arthrobacter sp. Rue61a plasmid pAL1

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009453	GAAAC	2	10	476	485	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009453	TGGTC	2	10	619	628	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009453	CTTCA	2	10	4088	4097	20 %	40 %	0 %	40 %	403571552
4	NC_009453	TTCCA	2	10	4165	4174	20 %	40 %	0 %	40 %	403571552
5	NC_009453	CGTGA	2	10	4556	4565	20 %	20 %	40 %	20 %	403571552
6	NC_009453	CGGAA	2	10	5149	5158	40 %	0 %	40 %	20 %	403571552
7	NC_009453	CGTAA	2	10	8376	8385	40 %	20 %	20 %	20 %	403571555
8	NC_009453	GGACG	2	10	10713	10722	20 %	0 %	60 %	20 %	403571556
9	NC_009453	TTCCG	2	10	10997	11006	0 %	40 %	20 %	40 %	403571556
10	NC_009453	CGGCC	2	10	11055	11064	0 %	0 %	40 %	60 %	403571556
11	NC_009453	TGGCG	2	10	13674	13683	0 %	20 %	60 %	20 %	403571559
12	NC_009453	TGTCG	2	10	14501	14510	0 %	40 %	40 %	20 %	403571559
13	NC_009453	CCATG	2	10	16622	16631	20 %	20 %	20 %	40 %	403571561
14	NC_009453	CAACG	2	10	17741	17750	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009453	ATGCC	2	10	20824	20833	20 %	20 %	20 %	40 %	403571565
16	NC_009453	GGCGG	2	10	22108	22117	0 %	0 %	80 %	20 %	403571566
17	NC_009453	CCGTA	2	10	27850	27859	20 %	20 %	20 %	40 %	403571572
18	NC_009453	TCCAC	2	10	29366	29375	20 %	20 %	0 %	60 %	403571573
19	NC_009453	CCGCA	2	10	31903	31912	20 %	0 %	20 %	60 %	403571576
20	NC_009453	CCTTG	2	10	33421	33430	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_009453	GGCGG	2	10	35845	35854	0 %	0 %	80 %	20 %	403571578
22	NC_009453	AGGGC	2	10	37360	37369	20 %	0 %	60 %	20 %	403571579
23	NC_009453	TTCCC	2	10	39759	39768	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_009453	GCCCG	2	10	41772	41781	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_009453	CCCGA	2	10	41798	41807	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009453	CGGAA	2	10	42589	42598	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009453	CAGTT	2	10	48179	48188	20 %	40 %	20 %	20 %	403571594
28	NC_009453	GACTG	2	10	48382	48391	20 %	20 %	40 %	20 %	403571594
29	NC_009453	GCAAG	2	10	48420	48429	40 %	0 %	40 %	20 %	403571594
30	NC_009453	CACGC	2	10	49934	49943	20 %	0 %	20 %	60 %	403571594
31	NC_009453	CCGGG	2	10	52827	52836	0 %	0 %	60 %	40 %	403571597
32	NC_009453	CTCCC	2	10	54313	54322	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
33	NC_009453	AGTGC	2	10	55360	55369	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009453	AAGGA	2	10	56039	56048	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009453	CGCTA	2	10	56299	56308	20 %	20 %	20 %	40 %	403571605
36	NC_009453	CCGGC	2	10	56353	56362	0 %	0 %	40 %	60 %	403571605
37	NC_009453	TTTTC	2	10	56369	56378	0 %	80 %	0 %	20 %	403571605
38	NC_009453	CGGAC	2	10	59767	59776	20 %	0 %	40 %	40 %	403571610
39	NC_009453	CGCGG	2	10	61731	61740	0 %	0 %	60 %	40 %	403571611
40	NC_009453	GCCCG	2	10	64888	64897	0 %	0 %	40 %	60 %	403571614
41	NC_009453	CGGCC	2	10	71212	71221	0 %	0 %	40 %	60 %	403571619
42	NC_009453	CCAGA	2	10	71645	71654	40 %	0 %	20 %	40 %	403571619
43	NC_009453	GCGGA	2	10	71721	71730	20 %	0 %	60 %	20 %	403571619
44	NC_009453	GCACG	2	10	74777	74786	20 %	0 %	40 %	40 %	403571621
45	NC_009453	TGATC	2	10	75918	75927	20 %	40 %	20 %	20 %	403571622
46	NC_009453	AGCAC	2	10	76166	76175	40 %	0 %	20 %	40 %	403571622
47	NC_009453	AGTCG	2	10	77097	77106	20 %	20 %	40 %	20 %	403571622
48	NC_009453	CCAGT	2	10	79403	79412	20 %	20 %	20 %	40 %	403571623
49	NC_009453	GCCTC	2	10	81060	81069	0 %	20 %	20 %	60 %	403571623
50	NC_009453	CGAAG	2	10	81562	81571	40 %	0 %	40 %	20 %	403571624
51	NC_009453	TGGTC	2	10	83799	83808	0 %	40 %	40 %	20 %	403571624
52	NC_009453	CGCAG	2	10	96007	96016	20 %	0 %	40 %	40 %	403571638
53	NC_009453	TGGCC	2	10	96899	96908	0 %	20 %	40 %	40 %	403571639
54	NC_009453	CGGTC	2	10	100142	100151	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_009453	CAGGC	2	10	101992	102001	20 %	0 %	40 %	40 %	403571644
56	NC_009453	ACGGA	2	10	104089	104098	40 %	0 %	40 %	20 %	403571645
57	NC_009453	CGCAC	2	10	104779	104788	20 %	0 %	20 %	60 %	403571646
58	NC_009453	ACGCC	2	10	105444	105453	20 %	0 %	20 %	60 %	403571647
59	NC_009453	ATCTG	2	10	106835	106844	20 %	40 %	20 %	20 %	403571648
60	NC_009453	CACGG	2	10	108101	108110	20 %	0 %	40 %	40 %	403571648
61	NC_009453	AGGGA	2	10	108947	108956	40 %	0 %	60 %	0 %	403571648
62	NC_009453	GGCCT	2	10	109860	109869	0 %	20 %	40 %	40 %	403571648

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.