MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Arthrobacter sp. Rue61a plasmid pAL1

Total Repeats: 301

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009453	AGGG	2	8	163	170	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009453	ATTA	2	8	379	386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009453	TGGA	2	8	1018	1025	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009453	TGGA	2	8	1044	1051	25 %	25 %	50 %	0 %	403571550
5	NC_009453	AGGC	2	8	1155	1162	25 %	0 %	50 %	25 %	403571550
6	NC_009453	GGTG	2	8	1720	1727	0 %	25 %	75 %	0 %	403571550
7	NC_009453	CGTT	2	8	1734	1741	0 %	50 %	25 %	25 %	403571550
8	NC_009453	CGGC	2	8	2556	2563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009453	ATCG	2	8	2916	2923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009453	GAAA	2	8	3117	3124	75 %	0 %	25 %	0 %	403571551
11	NC_009453	GCCA	2	8	3704	3711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009453	CGTC	2	8	3733	3740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009453	AGGT	2	8	3776	3783	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009453	GGCA	2	8	3784	3791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009453	CTGC	2	8	3940	3947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009453	AGGC	2	8	3948	3955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009453	CTGC	2	8	4107	4114	0 %	25 %	25 %	50 %	403571552
18	NC_009453	GCCC	2	8	4580	4587	0 %	0 %	25 %	75 %	403571552
19	NC_009453	TCAA	2	8	5208	5215	50 %	25 %	0 %	25 %	403571552
20	NC_009453	CCTG	2	8	5487	5494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009453	AGAA	2	8	5574	5581	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009453	AGCG	2	8	5837	5844	25 %	0 %	50 %	25 %	403571553
23	NC_009453	GCCG	2	8	6169	6176	0 %	0 %	50 %	50 %	403571553
24	NC_009453	GGGA	2	8	6603	6610	25 %	0 %	75 %	0 %	403571554
25	NC_009453	GCCC	2	8	7011	7018	0 %	0 %	25 %	75 %	403571554
26	NC_009453	CCAC	2	8	7027	7034	25 %	0 %	0 %	75 %	403571554
27	NC_009453	CGTC	2	8	8170	8177	0 %	25 %	25 %	50 %	403571555
28	NC_009453	AGGG	2	8	8218	8225	25 %	0 %	75 %	0 %	403571555
29	NC_009453	CCCA	2	8	8730	8737	25 %	0 %	0 %	75 %	403571555
30	NC_009453	GGTG	2	8	8930	8937	0 %	25 %	75 %	0 %	403571555
31	NC_009453	ATAC	2	8	8992	8999	50 %	25 %	0 %	25 %	403571555
32	NC_009453	CACG	2	8	9616	9623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009453	GCCG	2	8	9776	9783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009453	CTGG	2	8	11310	11317	0 %	25 %	50 %	25 %	403571556
35	NC_009453	AACC	2	8	11473	11480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009453	GGCC	2	8	11889	11896	0 %	0 %	50 %	50 %	403571557
37	NC_009453	GGGC	2	8	12288	12295	0 %	0 %	75 %	25 %	403571557
38	NC_009453	GAAG	2	8	12595	12602	50 %	0 %	50 %	0 %	403571558
39	NC_009453	GAGC	2	8	13153	13160	25 %	0 %	50 %	25 %	403571558
40	NC_009453	TGCT	2	8	13396	13403	0 %	50 %	25 %	25 %	403571559
41	NC_009453	CAGG	2	8	14338	14345	25 %	0 %	50 %	25 %	403571559
42	NC_009453	TGGA	2	8	15116	15123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009453	TGCA	2	8	15397	15404	25 %	25 %	25 %	25 %	403571560
44	NC_009453	CGGG	2	8	15525	15532	0 %	0 %	75 %	25 %	403571560
45	NC_009453	CAGG	2	8	15815	15822	25 %	0 %	50 %	25 %	403571560
46	NC_009453	ATGC	2	8	15887	15894	25 %	25 %	25 %	25 %	403571560
47	NC_009453	AACC	2	8	15954	15961	50 %	0 %	0 %	50 %	403571560
48	NC_009453	CGGA	2	8	16060	16067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009453	GCTG	2	8	16334	16341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009453	ACGG	2	8	16346	16353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009453	GAGG	2	8	16454	16461	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009453	CGCC	2	8	17156	17163	0 %	0 %	25 %	75 %	403571561
53	NC_009453	GGAG	2	8	17336	17343	25 %	0 %	75 %	0 %	403571561
54	NC_009453	CGGC	2	8	17495	17502	0 %	0 %	50 %	50 %	403571561
55	NC_009453	GCTG	2	8	17833	17840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009453	GCGG	2	8	17920	17927	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009453	GACG	2	8	18312	18319	25 %	0 %	50 %	25 %	403571562
58	NC_009453	TGGG	2	8	18550	18557	0 %	25 %	75 %	0 %	403571562
59	NC_009453	TACC	2	8	18791	18798	25 %	25 %	0 %	50 %	403571563
60	NC_009453	TCCT	2	8	19549	19556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009453	CAAT	2	8	20055	20062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009453	ATTA	2	8	21624	21631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009453	GAGG	2	8	21812	21819	25 %	0 %	75 %	0 %	403571566
64	NC_009453	CCGC	2	8	21926	21933	0 %	0 %	25 %	75 %	403571566
65	NC_009453	CCCG	2	8	22089	22096	0 %	0 %	25 %	75 %	403571566
66	NC_009453	GGAA	2	8	22803	22810	50 %	0 %	50 %	0 %	403571568
67	NC_009453	TTGG	2	8	22974	22981	0 %	50 %	50 %	0 %	403571568
68	NC_009453	GGCC	2	8	23648	23655	0 %	0 %	50 %	50 %	403571569
69	NC_009453	TCCC	2	8	23899	23906	0 %	25 %	0 %	75 %	403571569
70	NC_009453	GACC	2	8	25153	25160	25 %	0 %	25 %	50 %	403571571
71	NC_009453	AGGC	2	8	25331	25338	25 %	0 %	50 %	25 %	403571571
72	NC_009453	GATC	2	8	25392	25399	25 %	25 %	25 %	25 %	403571571
73	NC_009453	CCGG	2	8	26388	26395	0 %	0 %	50 %	50 %	403571571
74	NC_009453	CCCA	2	8	26725	26732	25 %	0 %	0 %	75 %	403571572
75	NC_009453	CATT	2	8	26883	26890	25 %	50 %	0 %	25 %	403571572
76	NC_009453	GCCA	2	8	27834	27841	25 %	0 %	25 %	50 %	403571572
77	NC_009453	CACC	2	8	28812	28819	25 %	0 %	0 %	75 %	403571572
78	NC_009453	CGGA	2	8	28930	28937	25 %	0 %	50 %	25 %	403571572
79	NC_009453	CTCC	2	8	28956	28963	0 %	25 %	0 %	75 %	403571572
80	NC_009453	CCAC	2	8	29283	29290	25 %	0 %	0 %	75 %	403571573
81	NC_009453	ACTC	2	8	29389	29396	25 %	25 %	0 %	50 %	403571573
82	NC_009453	TGGA	2	8	29475	29482	25 %	25 %	50 %	0 %	403571573
83	NC_009453	ACGG	2	8	30445	30452	25 %	0 %	50 %	25 %	403571574
84	NC_009453	GTGG	2	8	30457	30464	0 %	25 %	75 %	0 %	403571574
85	NC_009453	CAGT	2	8	30587	30594	25 %	25 %	25 %	25 %	403571574
86	NC_009453	GCCT	2	8	30900	30907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_009453	CCGG	2	8	30984	30991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009453	CGGG	2	8	31449	31456	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009453	AACC	2	8	31476	31483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009453	TCTA	2	8	31576	31583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009453	CCAG	2	8	32255	32262	25 %	0 %	25 %	50 %	403571576
92	NC_009453	GGAT	2	8	32263	32270	25 %	25 %	50 %	0 %	403571576
93	NC_009453	ACCA	2	8	32437	32444	50 %	0 %	0 %	50 %	403571576
94	NC_009453	GCTT	2	8	32707	32714	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009453	GTTT	2	8	32758	32765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009453	TCAC	2	8	33140	33147	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009453	GATG	2	8	33249	33256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009453	CAGG	2	8	33931	33938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009453	GGTC	2	8	34071	34078	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009453	GGCG	2	8	34224	34231	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009453	GTGA	2	8	36478	36485	25 %	25 %	50 %	0 %	403571578
102	NC_009453	TCAA	2	8	36653	36660	50 %	25 %	0 %	25 %	403571579
103	NC_009453	GCCG	2	8	36920	36927	0 %	0 %	50 %	50 %	403571579
104	NC_009453	ATGG	2	8	38136	38143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009453	TCGT	2	8	38340	38347	0 %	50 %	25 %	25 %	403571580
106	NC_009453	ATGG	2	8	38453	38460	25 %	25 %	50 %	0 %	403571580
107	NC_009453	GGCC	2	8	38470	38477	0 %	0 %	50 %	50 %	403571580
108	NC_009453	GCGG	2	8	38578	38585	0 %	0 %	75 %	25 %	403571580
109	NC_009453	CAAC	2	8	38668	38675	50 %	0 %	0 %	50 %	403571580
110	NC_009453	TCAG	2	8	38849	38856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009453	AAGG	2	8	39009	39016	50 %	0 %	50 %	0 %	403571581
112	NC_009453	CCCG	2	8	39440	39447	0 %	0 %	25 %	75 %	403571581
113	NC_009453	GGCC	2	8	39479	39486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009453	CCGG	2	8	39794	39801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009453	GTGA	2	8	39923	39930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009453	GAAC	2	8	40818	40825	50 %	0 %	25 %	25 %	403571584
117	NC_009453	ATTG	2	8	40887	40894	25 %	50 %	25 %	0 %	403571584
118	NC_009453	GGAC	2	8	41312	41319	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009453	AGCA	2	8	41326	41333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009453	TGCC	2	8	41436	41443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009453	TCCC	2	8	41919	41926	0 %	25 %	0 %	75 %	403571585
122	NC_009453	TCAT	2	8	42688	42695	25 %	50 %	0 %	25 %	403571586
123	NC_009453	CACC	2	8	42849	42856	25 %	0 %	0 %	75 %	403571586
124	NC_009453	CAAT	2	8	42961	42968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_009453	GGCG	2	8	43154	43161	0 %	0 %	75 %	25 %	403571587
126	NC_009453	GGGC	2	8	44055	44062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009453	GAAT	2	8	44189	44196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009453	CGCC	2	8	44534	44541	0 %	0 %	25 %	75 %	403571588
129	NC_009453	GCCC	2	8	45436	45443	0 %	0 %	25 %	75 %	403571589
130	NC_009453	GTGG	2	8	45926	45933	0 %	25 %	75 %	0 %	403571590
131	NC_009453	CCAA	2	8	46624	46631	50 %	0 %	0 %	50 %	403571592
132	NC_009453	CGGC	2	8	47584	47591	0 %	0 %	50 %	50 %	403571593
133	NC_009453	GGCC	2	8	47653	47660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009453	CCTA	2	8	48146	48153	25 %	25 %	0 %	50 %	403571594
135	NC_009453	AGCC	2	8	48783	48790	25 %	0 %	25 %	50 %	403571594
136	NC_009453	CGTG	2	8	48795	48802	0 %	25 %	50 %	25 %	403571594
137	NC_009453	ACAG	2	8	49194	49201	50 %	0 %	25 %	25 %	403571594
138	NC_009453	ACGC	2	8	49249	49256	25 %	0 %	25 %	50 %	403571594
139	NC_009453	TTGG	2	8	49262	49269	0 %	50 %	50 %	0 %	403571594
140	NC_009453	CAAC	2	8	50310	50317	50 %	0 %	0 %	50 %	403571594
141	NC_009453	GACG	2	8	50960	50967	25 %	0 %	50 %	25 %	403571595
142	NC_009453	TCCC	2	8	51035	51042	0 %	25 %	0 %	75 %	403571595
143	NC_009453	CGAG	2	8	51935	51942	25 %	0 %	50 %	25 %	403571597
144	NC_009453	CCGT	2	8	53186	53193	0 %	25 %	25 %	50 %	403571598
145	NC_009453	CGCA	2	8	53719	53726	25 %	0 %	25 %	50 %	403571599
146	NC_009453	CAGA	2	8	54237	54244	50 %	0 %	25 %	25 %	403571600
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285	NC_009453	CTGC	2	8	108440	108447	0 %	25 %	25 %	50 %	403571648
286	NC_009453	GCGG	2	8	109085	109092	0 %	0 %	75 %	25 %	403571648
287	NC_009453	GCTG	2	8	109229	109236	0 %	25 %	50 %	25 %	403571648
288	NC_009453	ACCG	2	8	109358	109365	25 %	0 %	25 %	50 %	403571648
289	NC_009453	CGGA	2	8	109396	109403	25 %	0 %	50 %	25 %	403571648
290	NC_009453	TCGA	2	8	109548	109555	25 %	25 %	25 %	25 %	403571648
291	NC_009453	CGCC	2	8	110128	110135	0 %	0 %	25 %	75 %	403571648
292	NC_009453	TGGA	2	8	110787	110794	25 %	25 %	50 %	0 %	403571648
293	NC_009453	TTCA	2	8	110829	110836	25 %	50 %	0 %	25 %	403571648
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295	NC_009453	CGCC	2	8	111751	111758	0 %	0 %	25 %	75 %	403571650
296	NC_009453	CCAG	2	8	111790	111797	25 %	0 %	25 %	50 %	403571650
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298	NC_009453	GCAT	2	8	112296	112303	25 %	25 %	25 %	25 %	403571650
299	NC_009453	CTAT	2	8	112747	112754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
300	NC_009453	CTCA	2	8	112796	112803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
301	NC_009453	GCCG	2	8	112859	112866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.