MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter sp. Rue61a plasmid pAL1

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009453	AGGG	2	8	163	170	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009453	ATTA	2	8	379	386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009453	TGGA	2	8	1018	1025	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009453	CGGC	2	8	2556	2563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009453	ATCG	2	8	2916	2923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009453	GCCA	2	8	3704	3711	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009453	CGTC	2	8	3733	3740	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009453	AGGT	2	8	3776	3783	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009453	GGCA	2	8	3784	3791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009453	CTGC	2	8	3940	3947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009453	AGGC	2	8	3948	3955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_009453	CCTG	2	8	5487	5494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009453	AGAA	2	8	5574	5581	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009453	CACG	2	8	9616	9623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009453	GCCG	2	8	9776	9783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009453	AACC	2	8	11473	11480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009453	TGGA	2	8	15116	15123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009453	CGGA	2	8	16060	16067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009453	GCTG	2	8	16334	16341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009453	ACGG	2	8	16346	16353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_009453	GAGG	2	8	16454	16461	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009453	GCTG	2	8	17833	17840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_009453	GCGG	2	8	17920	17927	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009453	TCCT	2	8	19549	19556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009453	CAAT	2	8	20055	20062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009453	ATTA	2	8	21624	21631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009453	GCCT	2	8	30900	30907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009453	CCGG	2	8	30984	30991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009453	CGGG	2	8	31449	31456	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_009453	AACC	2	8	31476	31483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009453	TCTA	2	8	31576	31583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009453	GCTT	2	8	32707	32714	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009453	GTTT	2	8	32758	32765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009453	TCAC	2	8	33140	33147	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_009453	GATG	2	8	33249	33256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009453	CAGG	2	8	33931	33938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_009453	GGTC	2	8	34071	34078	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009453	GGCG	2	8	34224	34231	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009453	ATGG	2	8	38136	38143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009453	TCAG	2	8	38849	38856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009453	GGCC	2	8	39479	39486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009453	CCGG	2	8	39794	39801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009453	GTGA	2	8	39923	39930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009453	GGAC	2	8	41312	41319	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009453	AGCA	2	8	41326	41333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009453	TGCC	2	8	41436	41443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009453	CAAT	2	8	42961	42968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_009453	GGGC	2	8	44055	44062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009453	GAAT	2	8	44189	44196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009453	GGCC	2	8	47653	47660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009453	AGTT	2	8	54439	54446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009453	TTGT	2	8	55405	55412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009453	GGTA	2	8	58540	58547	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009453	GCAG	2	8	61443	61450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009453	GTTG	2	8	63095	63102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009453	CCAA	2	8	72240	72247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009453	GGCC	2	8	73095	73102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009453	GGCC	2	8	73109	73116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009453	CGTC	2	8	86365	86372	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009453	CGGC	2	8	86386	86393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009453	TGCG	2	8	86409	86416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009453	CAGC	2	8	99520	99527	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009453	CATT	2	8	100705	100712	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009453	CTTC	2	8	104427	104434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009453	GGGT	2	8	105214	105221	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009453	TACC	2	8	105291	105298	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009453	CTAT	2	8	112747	112754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009453	CTCA	2	8	112796	112803	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009453	GCCG	2	8	112859	112866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.