MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter sp. Rue61a plasmid pAL1

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009453	TGGA	2	8	1044	1051	25 %	25 %	50 %	0 %	403571550
2	NC_009453	AGGC	2	8	1155	1162	25 %	0 %	50 %	25 %	403571550
3	NC_009453	GGTG	2	8	1720	1727	0 %	25 %	75 %	0 %	403571550
4	NC_009453	CGTT	2	8	1734	1741	0 %	50 %	25 %	25 %	403571550
5	NC_009453	GAAA	2	8	3117	3124	75 %	0 %	25 %	0 %	403571551
6	NC_009453	CTGC	2	8	4107	4114	0 %	25 %	25 %	50 %	403571552
7	NC_009453	GCCC	2	8	4580	4587	0 %	0 %	25 %	75 %	403571552
8	NC_009453	TCAA	2	8	5208	5215	50 %	25 %	0 %	25 %	403571552
9	NC_009453	AGCG	2	8	5837	5844	25 %	0 %	50 %	25 %	403571553
10	NC_009453	GCCG	2	8	6169	6176	0 %	0 %	50 %	50 %	403571553
11	NC_009453	GGGA	2	8	6603	6610	25 %	0 %	75 %	0 %	403571554
12	NC_009453	GCCC	2	8	7011	7018	0 %	0 %	25 %	75 %	403571554
13	NC_009453	CCAC	2	8	7027	7034	25 %	0 %	0 %	75 %	403571554
14	NC_009453	CGTC	2	8	8170	8177	0 %	25 %	25 %	50 %	403571555
15	NC_009453	AGGG	2	8	8218	8225	25 %	0 %	75 %	0 %	403571555
16	NC_009453	CCCA	2	8	8730	8737	25 %	0 %	0 %	75 %	403571555
17	NC_009453	GGTG	2	8	8930	8937	0 %	25 %	75 %	0 %	403571555
18	NC_009453	ATAC	2	8	8992	8999	50 %	25 %	0 %	25 %	403571555
19	NC_009453	CTGG	2	8	11310	11317	0 %	25 %	50 %	25 %	403571556
20	NC_009453	GGCC	2	8	11889	11896	0 %	0 %	50 %	50 %	403571557
21	NC_009453	GGGC	2	8	12288	12295	0 %	0 %	75 %	25 %	403571557
22	NC_009453	GAAG	2	8	12595	12602	50 %	0 %	50 %	0 %	403571558
23	NC_009453	GAGC	2	8	13153	13160	25 %	0 %	50 %	25 %	403571558
24	NC_009453	TGCT	2	8	13396	13403	0 %	50 %	25 %	25 %	403571559
25	NC_009453	CAGG	2	8	14338	14345	25 %	0 %	50 %	25 %	403571559
26	NC_009453	TGCA	2	8	15397	15404	25 %	25 %	25 %	25 %	403571560
27	NC_009453	CGGG	2	8	15525	15532	0 %	0 %	75 %	25 %	403571560
28	NC_009453	CAGG	2	8	15815	15822	25 %	0 %	50 %	25 %	403571560
29	NC_009453	ATGC	2	8	15887	15894	25 %	25 %	25 %	25 %	403571560
30	NC_009453	AACC	2	8	15954	15961	50 %	0 %	0 %	50 %	403571560
31	NC_009453	CGCC	2	8	17156	17163	0 %	0 %	25 %	75 %	403571561
32	NC_009453	GGAG	2	8	17336	17343	25 %	0 %	75 %	0 %	403571561
33	NC_009453	CGGC	2	8	17495	17502	0 %	0 %	50 %	50 %	403571561
34	NC_009453	GACG	2	8	18312	18319	25 %	0 %	50 %	25 %	403571562
35	NC_009453	TGGG	2	8	18550	18557	0 %	25 %	75 %	0 %	403571562
36	NC_009453	TACC	2	8	18791	18798	25 %	25 %	0 %	50 %	403571563
37	NC_009453	GAGG	2	8	21812	21819	25 %	0 %	75 %	0 %	403571566
38	NC_009453	CCGC	2	8	21926	21933	0 %	0 %	25 %	75 %	403571566
39	NC_009453	CCCG	2	8	22089	22096	0 %	0 %	25 %	75 %	403571566
40	NC_009453	GGAA	2	8	22803	22810	50 %	0 %	50 %	0 %	403571568
41	NC_009453	TTGG	2	8	22974	22981	0 %	50 %	50 %	0 %	403571568
42	NC_009453	GGCC	2	8	23648	23655	0 %	0 %	50 %	50 %	403571569
43	NC_009453	TCCC	2	8	23899	23906	0 %	25 %	0 %	75 %	403571569
44	NC_009453	GACC	2	8	25153	25160	25 %	0 %	25 %	50 %	403571571
45	NC_009453	AGGC	2	8	25331	25338	25 %	0 %	50 %	25 %	403571571
46	NC_009453	GATC	2	8	25392	25399	25 %	25 %	25 %	25 %	403571571
47	NC_009453	CCGG	2	8	26388	26395	0 %	0 %	50 %	50 %	403571571
48	NC_009453	CCCA	2	8	26725	26732	25 %	0 %	0 %	75 %	403571572
49	NC_009453	CATT	2	8	26883	26890	25 %	50 %	0 %	25 %	403571572
50	NC_009453	GCCA	2	8	27834	27841	25 %	0 %	25 %	50 %	403571572
51	NC_009453	CACC	2	8	28812	28819	25 %	0 %	0 %	75 %	403571572
52	NC_009453	CGGA	2	8	28930	28937	25 %	0 %	50 %	25 %	403571572
53	NC_009453	CTCC	2	8	28956	28963	0 %	25 %	0 %	75 %	403571572
54	NC_009453	CCAC	2	8	29283	29290	25 %	0 %	0 %	75 %	403571573
55	NC_009453	ACTC	2	8	29389	29396	25 %	25 %	0 %	50 %	403571573
56	NC_009453	TGGA	2	8	29475	29482	25 %	25 %	50 %	0 %	403571573
57	NC_009453	ACGG	2	8	30445	30452	25 %	0 %	50 %	25 %	403571574
58	NC_009453	GTGG	2	8	30457	30464	0 %	25 %	75 %	0 %	403571574
59	NC_009453	CAGT	2	8	30587	30594	25 %	25 %	25 %	25 %	403571574
60	NC_009453	CCAG	2	8	32255	32262	25 %	0 %	25 %	50 %	403571576
61	NC_009453	GGAT	2	8	32263	32270	25 %	25 %	50 %	0 %	403571576
62	NC_009453	ACCA	2	8	32437	32444	50 %	0 %	0 %	50 %	403571576
63	NC_009453	GTGA	2	8	36478	36485	25 %	25 %	50 %	0 %	403571578
64	NC_009453	TCAA	2	8	36653	36660	50 %	25 %	0 %	25 %	403571579
65	NC_009453	GCCG	2	8	36920	36927	0 %	0 %	50 %	50 %	403571579
66	NC_009453	TCGT	2	8	38340	38347	0 %	50 %	25 %	25 %	403571580
67	NC_009453	ATGG	2	8	38453	38460	25 %	25 %	50 %	0 %	403571580
68	NC_009453	GGCC	2	8	38470	38477	0 %	0 %	50 %	50 %	403571580
69	NC_009453	GCGG	2	8	38578	38585	0 %	0 %	75 %	25 %	403571580
70	NC_009453	CAAC	2	8	38668	38675	50 %	0 %	0 %	50 %	403571580
71	NC_009453	AAGG	2	8	39009	39016	50 %	0 %	50 %	0 %	403571581
72	NC_009453	CCCG	2	8	39440	39447	0 %	0 %	25 %	75 %	403571581
73	NC_009453	GAAC	2	8	40818	40825	50 %	0 %	25 %	25 %	403571584
74	NC_009453	ATTG	2	8	40887	40894	25 %	50 %	25 %	0 %	403571584
75	NC_009453	TCCC	2	8	41919	41926	0 %	25 %	0 %	75 %	403571585
76	NC_009453	TCAT	2	8	42688	42695	25 %	50 %	0 %	25 %	403571586
77	NC_009453	CACC	2	8	42849	42856	25 %	0 %	0 %	75 %	403571586
78	NC_009453	GGCG	2	8	43154	43161	0 %	0 %	75 %	25 %	403571587
79	NC_009453	CGCC	2	8	44534	44541	0 %	0 %	25 %	75 %	403571588
80	NC_009453	GCCC	2	8	45436	45443	0 %	0 %	25 %	75 %	403571589
81	NC_009453	GTGG	2	8	45926	45933	0 %	25 %	75 %	0 %	403571590
82	NC_009453	CCAA	2	8	46624	46631	50 %	0 %	0 %	50 %	403571592
83	NC_009453	CGGC	2	8	47584	47591	0 %	0 %	50 %	50 %	403571593
84	NC_009453	CCTA	2	8	48146	48153	25 %	25 %	0 %	50 %	403571594
85	NC_009453	AGCC	2	8	48783	48790	25 %	0 %	25 %	50 %	403571594
86	NC_009453	CGTG	2	8	48795	48802	0 %	25 %	50 %	25 %	403571594
87	NC_009453	ACAG	2	8	49194	49201	50 %	0 %	25 %	25 %	403571594
88	NC_009453	ACGC	2	8	49249	49256	25 %	0 %	25 %	50 %	403571594
89	NC_009453	TTGG	2	8	49262	49269	0 %	50 %	50 %	0 %	403571594
90	NC_009453	CAAC	2	8	50310	50317	50 %	0 %	0 %	50 %	403571594
91	NC_009453	GACG	2	8	50960	50967	25 %	0 %	50 %	25 %	403571595
92	NC_009453	TCCC	2	8	51035	51042	0 %	25 %	0 %	75 %	403571595
93	NC_009453	CGAG	2	8	51935	51942	25 %	0 %	50 %	25 %	403571597
94	NC_009453	CCGT	2	8	53186	53193	0 %	25 %	25 %	50 %	403571598
95	NC_009453	CGCA	2	8	53719	53726	25 %	0 %	25 %	50 %	403571599
96	NC_009453	CAGA	2	8	54237	54244	50 %	0 %	25 %	25 %	403571600
97	NC_009453	ACCA	2	8	54632	54639	50 %	0 %	0 %	50 %	403571601
98	NC_009453	CCAT	2	8	55839	55846	25 %	25 %	0 %	50 %	403571603
99	NC_009453	TGAT	2	8	56284	56291	25 %	50 %	25 %	0 %	403571604
100	NC_009453	AATG	2	8	56433	56440	50 %	25 %	25 %	0 %	403571605
101	NC_009453	TTGC	2	8	57219	57226	0 %	50 %	25 %	25 %	403571606
102	NC_009453	GGCT	2	8	57242	57249	0 %	25 %	50 %	25 %	403571606
103	NC_009453	CGGC	2	8	57283	57290	0 %	0 %	50 %	50 %	403571606
104	NC_009453	ATCC	2	8	57344	57351	25 %	25 %	0 %	50 %	403571606
105	NC_009453	GCGA	2	8	57600	57607	25 %	0 %	50 %	25 %	403571607
106	NC_009453	CGCC	2	8	57709	57716	0 %	0 %	25 %	75 %	403571607
107	NC_009453	CCAG	2	8	57886	57893	25 %	0 %	25 %	50 %	403571607
108	NC_009453	GCTG	2	8	57929	57936	0 %	25 %	50 %	25 %	403571607
109	NC_009453	GGCT	2	8	59541	59548	0 %	25 %	50 %	25 %	403571610
110	NC_009453	GATG	2	8	59603	59610	25 %	25 %	50 %	0 %	403571610
111	NC_009453	GGTG	2	8	60488	60495	0 %	25 %	75 %	0 %	403571610
112	NC_009453	CAGG	2	8	60538	60545	25 %	0 %	50 %	25 %	403571610
113	NC_009453	TGCC	2	8	60691	60698	0 %	25 %	25 %	50 %	403571610
114	NC_009453	GATG	2	8	62360	62367	25 %	25 %	50 %	0 %	403571611
115	NC_009453	GCCG	2	8	62661	62668	0 %	0 %	50 %	50 %	403571612
116	NC_009453	CTGG	2	8	63251	63258	0 %	25 %	50 %	25 %	403571613
117	NC_009453	CCGG	2	8	63259	63266	0 %	0 %	50 %	50 %	403571613
118	NC_009453	CCAG	2	8	63479	63486	25 %	0 %	25 %	50 %	403571613
119	NC_009453	CCAG	2	8	63503	63510	25 %	0 %	25 %	50 %	403571613
120	NC_009453	CTTG	2	8	64105	64112	0 %	50 %	25 %	25 %	403571614
121	NC_009453	GTCC	2	8	64369	64376	0 %	25 %	25 %	50 %	403571614
122	NC_009453	AGGC	2	8	64723	64730	25 %	0 %	50 %	25 %	403571614
123	NC_009453	TGCG	2	8	65419	65426	0 %	25 %	50 %	25 %	403571615
124	NC_009453	GTGG	2	8	65438	65445	0 %	25 %	75 %	0 %	403571615
125	NC_009453	CGGA	2	8	66513	66520	25 %	0 %	50 %	25 %	403571615
126	NC_009453	ACGA	2	8	67705	67712	50 %	0 %	25 %	25 %	403571616
127	NC_009453	CCCG	2	8	67992	67999	0 %	0 %	25 %	75 %	403571616
128	NC_009453	CCCG	2	8	68219	68226	0 %	0 %	25 %	75 %	403571616
129	NC_009453	ACTG	2	8	68297	68304	25 %	25 %	25 %	25 %	403571616
130	NC_009453	CTTC	2	8	68382	68389	0 %	50 %	0 %	50 %	403571616
131	NC_009453	GCCC	2	8	68407	68414	0 %	0 %	25 %	75 %	403571616
132	NC_009453	GATC	2	8	70857	70864	25 %	25 %	25 %	25 %	403571618
133	NC_009453	AGCC	2	8	72995	73002	25 %	0 %	25 %	50 %	403571620
134	NC_009453	TCAC	2	8	73164	73171	25 %	25 %	0 %	50 %	403571621
135	NC_009453	GATC	2	8	73318	73325	25 %	25 %	25 %	25 %	403571621
136	NC_009453	CCCT	2	8	73425	73432	0 %	25 %	0 %	75 %	403571621
137	NC_009453	CCAG	2	8	74160	74167	25 %	0 %	25 %	50 %	403571621
138	NC_009453	TTGG	2	8	75385	75392	0 %	50 %	50 %	0 %	403571622
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.