MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter sp. Rue61a plasmid pAL1

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009453	GC	3	6	3108	3113	0 %	0 %	50 %	50 %	403571551
2	NC_009453	GC	3	6	4541	4546	0 %	0 %	50 %	50 %	403571552
3	NC_009453	TG	3	6	4828	4833	0 %	50 %	50 %	0 %	403571552
4	NC_009453	CA	3	6	5072	5077	50 %	0 %	0 %	50 %	403571552
5	NC_009453	TG	3	6	7210	7215	0 %	50 %	50 %	0 %	403571555
6	NC_009453	CA	3	6	7240	7245	50 %	0 %	0 %	50 %	403571555
7	NC_009453	TC	3	6	7385	7390	0 %	50 %	0 %	50 %	403571555
8	NC_009453	TC	3	6	9593	9598	0 %	50 %	0 %	50 %	403571555
9	NC_009453	GC	3	6	10413	10418	0 %	0 %	50 %	50 %	403571556
10	NC_009453	CG	3	6	10513	10518	0 %	0 %	50 %	50 %	403571556
11	NC_009453	CA	4	8	11290	11297	50 %	0 %	0 %	50 %	403571556
12	NC_009453	GC	3	6	11363	11368	0 %	0 %	50 %	50 %	403571556
13	NC_009453	TC	3	6	11445	11450	0 %	50 %	0 %	50 %	403571556
14	NC_009453	CG	3	6	12500	12505	0 %	0 %	50 %	50 %	403571558
15	NC_009453	GC	3	6	12514	12519	0 %	0 %	50 %	50 %	403571558
16	NC_009453	CT	3	6	12729	12734	0 %	50 %	0 %	50 %	403571558
17	NC_009453	GC	3	6	14195	14200	0 %	0 %	50 %	50 %	403571559
18	NC_009453	CT	3	6	14266	14271	0 %	50 %	0 %	50 %	403571559
19	NC_009453	GT	3	6	18427	18432	0 %	50 %	50 %	0 %	403571562
20	NC_009453	CG	4	8	19267	19274	0 %	0 %	50 %	50 %	403571563
21	NC_009453	GC	3	6	21124	21129	0 %	0 %	50 %	50 %	403571565
22	NC_009453	CG	3	6	21297	21302	0 %	0 %	50 %	50 %	403571565
23	NC_009453	CA	3	6	25168	25173	50 %	0 %	0 %	50 %	403571571
24	NC_009453	CG	3	6	25665	25670	0 %	0 %	50 %	50 %	403571571
25	NC_009453	CT	3	6	30817	30822	0 %	50 %	0 %	50 %	403571574
26	NC_009453	TC	3	6	31020	31025	0 %	50 %	0 %	50 %	403571575
27	NC_009453	AC	3	6	31137	31142	50 %	0 %	0 %	50 %	403571575
28	NC_009453	CA	3	6	31192	31197	50 %	0 %	0 %	50 %	403571575
29	NC_009453	TA	3	6	32066	32071	50 %	50 %	0 %	0 %	403571576
30	NC_009453	GA	3	6	32373	32378	50 %	0 %	50 %	0 %	403571576
31	NC_009453	AC	3	6	34853	34858	50 %	0 %	0 %	50 %	403571577
32	NC_009453	GC	3	6	35891	35896	0 %	0 %	50 %	50 %	403571578
33	NC_009453	GC	3	6	35990	35995	0 %	0 %	50 %	50 %	403571578
34	NC_009453	GC	3	6	36035	36040	0 %	0 %	50 %	50 %	403571578
35	NC_009453	CG	3	6	36052	36057	0 %	0 %	50 %	50 %	403571578
36	NC_009453	GC	3	6	36643	36648	0 %	0 %	50 %	50 %	403571579
37	NC_009453	AC	3	6	36755	36760	50 %	0 %	0 %	50 %	403571579
38	NC_009453	GC	5	10	37477	37486	0 %	0 %	50 %	50 %	403571579
39	NC_009453	CT	3	6	37572	37577	0 %	50 %	0 %	50 %	403571579
40	NC_009453	CA	3	6	38530	38535	50 %	0 %	0 %	50 %	403571580
41	NC_009453	GC	3	6	38633	38638	0 %	0 %	50 %	50 %	403571580
42	NC_009453	GA	3	6	40437	40442	50 %	0 %	50 %	0 %	403571582
43	NC_009453	GC	3	6	40918	40923	0 %	0 %	50 %	50 %	403571584
44	NC_009453	GC	3	6	43126	43131	0 %	0 %	50 %	50 %	403571587
45	NC_009453	GC	3	6	45184	45189	0 %	0 %	50 %	50 %	403571589
46	NC_009453	CG	3	6	45885	45890	0 %	0 %	50 %	50 %	403571590
47	NC_009453	CA	3	6	46092	46097	50 %	0 %	0 %	50 %	403571590
48	NC_009453	CA	3	6	46828	46833	50 %	0 %	0 %	50 %	403571592
49	NC_009453	CG	3	6	48463	48468	0 %	0 %	50 %	50 %	403571594
50	NC_009453	CG	4	8	48822	48829	0 %	0 %	50 %	50 %	403571594
51	NC_009453	CG	3	6	49621	49626	0 %	0 %	50 %	50 %	403571594
52	NC_009453	CT	3	6	50846	50851	0 %	50 %	0 %	50 %	403571595
53	NC_009453	CT	4	8	51353	51360	0 %	50 %	0 %	50 %	403571596
54	NC_009453	CG	3	6	52058	52063	0 %	0 %	50 %	50 %	403571597
55	NC_009453	CA	3	6	53388	53393	50 %	0 %	0 %	50 %	403571598
56	NC_009453	TC	3	6	54739	54744	0 %	50 %	0 %	50 %	403571601
57	NC_009453	CT	3	6	56248	56253	0 %	50 %	0 %	50 %	403571604
58	NC_009453	CT	3	6	56381	56386	0 %	50 %	0 %	50 %	403571605
59	NC_009453	AC	3	6	57309	57314	50 %	0 %	0 %	50 %	403571606
60	NC_009453	TC	3	6	59020	59025	0 %	50 %	0 %	50 %	403571610
61	NC_009453	AC	3	6	59596	59601	50 %	0 %	0 %	50 %	403571610
62	NC_009453	CG	3	6	60232	60237	0 %	0 %	50 %	50 %	403571610
63	NC_009453	TC	3	6	60658	60663	0 %	50 %	0 %	50 %	403571610
64	NC_009453	CA	3	6	60757	60762	50 %	0 %	0 %	50 %	403571610
65	NC_009453	GC	3	6	62283	62288	0 %	0 %	50 %	50 %	403571611
66	NC_009453	GC	3	6	65760	65765	0 %	0 %	50 %	50 %	403571615
67	NC_009453	TG	3	6	66702	66707	0 %	50 %	50 %	0 %	403571615
68	NC_009453	CA	3	6	66894	66899	50 %	0 %	0 %	50 %	403571615
69	NC_009453	GA	3	6	67500	67505	50 %	0 %	50 %	0 %	403571616
70	NC_009453	CT	3	6	69288	69293	0 %	50 %	0 %	50 %	403571616
71	NC_009453	GT	3	6	70747	70752	0 %	50 %	50 %	0 %	403571618
72	NC_009453	AG	3	6	71497	71502	50 %	0 %	50 %	0 %	403571619
73	NC_009453	CA	3	6	72332	72337	50 %	0 %	0 %	50 %	403571620
74	NC_009453	CA	3	6	72945	72950	50 %	0 %	0 %	50 %	403571620
75	NC_009453	TG	3	6	74534	74539	0 %	50 %	50 %	0 %	403571621
76	NC_009453	AG	3	6	75535	75540	50 %	0 %	50 %	0 %	403571622
77	NC_009453	TC	3	6	76410	76415	0 %	50 %	0 %	50 %	403571622
78	NC_009453	CG	3	6	77035	77040	0 %	0 %	50 %	50 %	403571622
79	NC_009453	GC	3	6	77312	77317	0 %	0 %	50 %	50 %	403571622
80	NC_009453	GC	3	6	77428	77433	0 %	0 %	50 %	50 %	403571622
81	NC_009453	GC	3	6	78896	78901	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
82	NC_009453	CG	3	6	79754	79759	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
83	NC_009453	GC	4	8	80004	80011	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
84	NC_009453	CG	5	10	80195	80204	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
85	NC_009453	CG	3	6	80666	80671	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
86	NC_009453	GC	3	6	80869	80874	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
87	NC_009453	GC	3	6	81188	81193	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
88	NC_009453	GA	3	6	83159	83164	50 %	0 %	50 %	0 %	403571624
89	NC_009453	GC	3	6	83321	83326	0 %	0 %	50 %	50 %	403571624
90	NC_009453	AG	4	8	85312	85319	50 %	0 %	50 %	0 %	403571625
91	NC_009453	CG	4	8	85766	85773	0 %	0 %	50 %	50 %	403571626
92	NC_009453	AC	3	6	87325	87330	50 %	0 %	0 %	50 %	403571627
93	NC_009453	CA	3	6	89288	89293	50 %	0 %	0 %	50 %	403571630
94	NC_009453	AC	3	6	90324	90329	50 %	0 %	0 %	50 %	403571631
95	NC_009453	CT	3	6	90395	90400	0 %	50 %	0 %	50 %	403571631
96	NC_009453	CG	4	8	94233	94240	0 %	0 %	50 %	50 %	403571635
97	NC_009453	TA	3	6	94760	94765	50 %	50 %	0 %	0 %	403571636
98	NC_009453	AC	3	6	94869	94874	50 %	0 %	0 %	50 %	403571636
99	NC_009453	TC	3	6	95203	95208	0 %	50 %	0 %	50 %	403571637
100	NC_009453	CA	3	6	96955	96960	50 %	0 %	0 %	50 %	403571639
101	NC_009453	GC	3	6	97646	97651	0 %	0 %	50 %	50 %	403571639
102	NC_009453	CG	4	8	98228	98235	0 %	0 %	50 %	50 %	403571639
103	NC_009453	CG	3	6	98338	98343	0 %	0 %	50 %	50 %	403571639
104	NC_009453	AG	3	6	98702	98707	50 %	0 %	50 %	0 %	403571639
105	NC_009453	CG	3	6	98895	98900	0 %	0 %	50 %	50 %	403571639
106	NC_009453	GC	4	8	100935	100942	0 %	0 %	50 %	50 %	403571642
107	NC_009453	TC	3	6	101442	101447	0 %	50 %	0 %	50 %	403571643
108	NC_009453	CA	3	6	102262	102267	50 %	0 %	0 %	50 %	403571644
109	NC_009453	TC	3	6	103067	103072	0 %	50 %	0 %	50 %	403571645
110	NC_009453	GC	3	6	104035	104040	0 %	0 %	50 %	50 %	403571645
111	NC_009453	GC	3	6	104189	104194	0 %	0 %	50 %	50 %	403571645
112	NC_009453	CG	3	6	104221	104226	0 %	0 %	50 %	50 %	403571645
113	NC_009453	AC	3	6	104701	104706	50 %	0 %	0 %	50 %	403571646
114	NC_009453	GA	3	6	106606	106611	50 %	0 %	50 %	0 %	403571648
115	NC_009453	TG	3	6	106958	106963	0 %	50 %	50 %	0 %	403571648
116	NC_009453	GC	3	6	108901	108906	0 %	0 %	50 %	50 %	403571648
117	NC_009453	GC	3	6	109175	109180	0 %	0 %	50 %	50 %	403571648
118	NC_009453	GC	3	6	110838	110843	0 %	0 %	50 %	50 %	403571648

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.